Boletin 2011

INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA

Vol 2

Directorio

Dra. Yoloxóchitl Bustamante Díez Directora General del Instituto Politécnico Nacional Dr. Juan Manuel Cantú Vázquez Secretario General

Dr. Jaime Álvarez Gallegos Secretario de Investigación y Posgrado

Dra. Ninfa Maria Rosas García Directora del Centro de Biotecnología Genómica Dr. Gildardo Rivera Sánchez Encargado de la Subdirección Académica y de Investigación C.P. Ma. del Carmen Quiroz Herrera Subdirectora Administrativa M. en C. Elma Laura Salazar Marroquín Subdirectora de Vinculación

Boletín Electrónico del CBG

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1.- Directorio 2.- Contenido 3.- Mensaje de Nuestra Directora 4.- Artículos Publicados 5.- Capítulos de Libros 6.- Premios y Reconocimientos 7.- Eventos Culturales 8.- Eventos Deportivos 9.- Avisos

Mensaje de nuestra Directora



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AVANCES Y PERSPECTIVAS DE LA BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA APLICADA A LA GANADERÍA EN MÉXICO

[ADVANCES AND PERSPECTIVES OF GENOMICS BIOTECHNOLOGY APPLIED TO LIVESTOCK

PRODUCTION IN MEXICO]

G.M. Parra-Bracamonte , A. M. Sifuentes Rincón, X. F. De la Rosa Reyna, W. Arellano Vera

Laboratorio de Biotecnología Animal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional. Boulevard del Maestro SN. Esq. Elías Piña, Col. Narciso Mendoza, Reynosa, Tamaulipas, México. C.P. 88710. Tel. 899.924.36.27, Ext. 87709, 87743. *E-mail:

RESUMEN

El desarrollo de la biotecnología genómica en el área animal, ha sido promovido como una realidad necesaria en México, y sus objetivos se enfocan fundamentalmente en el desarrollo, establecimiento e implementación de técnicas y métodos moleculares en beneficio de los sistemas pecuarios del país. En esta revisión se define el concepto de la biotecnología genómica y cómo el conocimiento de las herramientas moleculares y de los marcadores genéticos, derivados de esta disciplina puede ayudar a la ganadería (sobre todo enfocada a los sistemas productores de carne bovina), al mejoramiento en la producción y calidad de sus productos, y finalmente, exponer algunas perspectivas de aplicación para los sistemas de producción pecuaria en México.


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INBREEDING EVIDENCE IN A TRADITIONAL CHANNEL CATFISH

(ICTALURUS PUNCTATUS) HATCHERY IN MEXICO

Gaspar Manuel Parra-Bracamonte , Ana María Sifuentes-Rincón , Xochitl Fabiola De la Rosa-Reyna , Williams Arellano-Vera , Brenda Sosa-Reyes

Centro de Biotecnología Genómica-Instituto Politécnico Nacional, Laboratorio de Biotecnología Animal, Reynosa, Tamaulipas, México

Abstract

Background: Channel catfish are one of the most important aquaculture species raised for food purposes in Mexico. Two temporal samples were obtained from the largest channel catfish breeding hatchery in Mexico to identify changes in genetic diversity and inbreeding that are promoted by traditional hatchery management. Results: The genetic parameter analysis of 11 microsatellite loci showed no significant change in genetic diversity (p > 0.05). However, a significant heterozygosis deficiency was detected (p < 0.001), and genetic structure analysis indicated moderate differentiation between the temporally divided populations (FST = 0.08). A moderate level of inbreeding and a slight increase of the inbreeding coefficient from 0.23 to 0.27 were the result of traditional hatchery practices. To achieve an effective population size, the temporal approach resulted in a limited number of breeders to maintain genetic variability. Conclusions: Although no significant change in genetic diversity parameters was found, the heterozygote deficiency and low effective number of breeders suggest that there is a risk for increased inbreeding. Thus, we propose the need for controlled reproductive management and the establishment of genetic programs in hatcheries. Molecular tools can provide valuable information to facilitate the achievement of these goals.


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NEW PERSPECTIVES ON NODULE NITROGEN ASSIMILATION IN ACTINORHIZAL SYMBIOSES

Alison M. BerryA, Alberto Mendoza-Herrera , Ying-Yi Guo, Jennifer Hayashi, Tomas Persson, Ravi Barabote, Kirill Demchenko, Shuxiao Zhang and Katharina Pawlowski

Abstract

Nitrogen-!xing root nodules are plant organs specialised for symbiotic transfer of nitrogen and carbon between microsymbiont and host. The organisation of nitrogen assimilation, storage and transport processes is partitioned at the subcellular and tissue levels, in distinctive patterns depending on the symbiotic partners. In this review, recent advances in understanding of actinorhizal nodule nitrogen assimilation are presented. New !ndings indicate that Frankia within nodules of Datisca glomerata (Presl.) Baill. carries out both primary nitrogen assimilation and biosynthesis of arginine, rather than exporting ammonium. Arginine is a typical storage form of nitrogen in plant tissues, but is a novel nitrogen carrier molecule in root nodule symbioses. Thus Frankia within D. glomerata nodules exhibits considerable metabolic independence. Furthermore, nitrogen reassimilation is likely to take place in the host in the uninfected nodule cortical cells of this root nodule symbiosis, before amino acid export to host sink tissues via the xylem. The role of an augmented pericycle in carbon and nitrogen exchange in root nodules deserves further attention in actinorhizal symbiosis, and further highlights the importance of a comprehensive, structure–function approach to understanding function in root nodules. Moreover, the multiple patterns of compartmentalisation in relation to nitrogen "ux within root nodules demonstrate the diversity of possible functional interactions between host and microsymbiont that have evolved in the nitrogen-!xing clade.


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PARASITISM BY THE ENDOPARASITOID, COTESIO ,'OVIFJES INDUCES CELLULAR IMMUNOSUPPRESSION AND ENHANCES SUSCEPTIBILITY OF THE SUGAR CANE BORER,

DIOTROEO SOCCHORO'IS TO BOCILLUS THURINGIENS;S

A.M.A. Mahmoud ibI E.D.L. Santiliana and M.A. Rodríguez-Perez

Centro de Biotecnologia Genomica (CBG). lnstiruto Politecnico Nacional (lPN). Mexico and Centro de Investigación en Oencia Aplícada y

Tecnología Avanzada (eICATA) (Unidad Altamirn). Mexico

Abstract

Cotesia flavipes Cameron (Hyrmenoptera: Braconidae). is agregarius larval endoparasítoid of the sugarcane borer, Diatraea saccharalis Fabricius (Lepidoptera: Crambidae). The aim of this research was lo analyze cellular immunosuppression of D. saccharalis parasitized by C. flavipes in terms of encapsulation, melanization, and hemocyte nodule formation. The encapsulation as say was done I and 6 days after parasitoid oviposition. In addition the susceptibility of parasitoid and nonparasitzed larvae to Bacillus thuringiensis HD 73 strain was assussed. 3, 12 and 24 h after bead injection; the percentages of encapsulation were significantly higher in unparasitized larvae compared to larvae parasitized 1 and 6 days after oviposition. Interestingly, there was significant reduction in numbers of beads encapsulated at 1 day after oviposition compared to 6 days, and unparasitized larvae. The percentage of melanized beads decreased significantly inparasitized larvae compared to control. There was a reduction in the number of nodules inparasitized larvae compared to unparasitized controls. Larvae that were injected with polyn davirus 24 h before beads were injected showed significantly reduced encapsulation responses parasitized by C. flavipes exhibited higher susceptibility to B. thuringiensis. These results suggest that parasitization induced hosts immunosupression and the immunosupression factors could impair the defense capacity against microbial pathogens causing an increase in pathogen susceptibility.


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INCIDENCIA DE LA COCHINILLA ROSADA DEL HIBISCO EN CULTIVARES DE MANGO DE NAYARIT, MÉXICO

Ninfa M. Rosas-García & Gaspar M. Parra-Bracamonte

Acta Zoológica Mexicana (n. s.), 27(2): 407-418.

Abstract La incidencia de la cochinilla rosada del hibisco (CRH), Maconellicoccus hirsutus (Green) (Hemiptera: Pseudococcidae) fue evaluada en seis cultivares de mango en producción en Bahía de Banderas estado de Nayarit, México. La presencia de esta plaga fue determinada mediante el monitoreo de cada etapa de desarrollo, ninfas de primer instar o caminantes (N1), ninfas de segundo instar (N2), ninfas de tercer instar (N3), hembras (H) y ovisacos (O) en los cultivares de mango, Tommy Atkins, Haden, Manila, Ataulfo, Keitt, y Kent. Además, la presencia del insecto se determinó en yemas terminales y frutos (en los árboles) y en malezas aledañas. El estudio indicó que la incidencia mensual promedio de individuos N1 y N2 fue mayor entre los meses de enero y febrero, mayo y junio, y agosto y septiembre, mientras que para individuos N3 ocurrió entre julio y agosto. Todas las etapas de desarrollo de la CRH presentaron la mayor incidencia en el cultivar Ataulfo. La media de individuos N1 y N2 en los frutos y en la maleza no mostró diferencia significativa (P>0.05), pero la media de individuos N3, hembras y ovisacos presentes en fruto fue mayor a la media de individuos observados en las yemas terminales y en la maleza. Los resultados sugieren la existencia de una relación entre las diferentes etapas de desarrollo de la plaga, el cultivar y la fenología del árbol, en donde se observa una mayor incidencia de los primeros instares por el cultivar Ataulfo y una mayor incidencia a partir de la etapa N3 por el fruto. Es importante conocer la susceptibilidad de los cultivares de mango al ataque de la CRH para poder ejercer un manejo que evite la diseminación de la plaga. Palabras clave: Insecto polífago, monitoreo, Maconellicoccus hirsutus, fruto de mango, ninfas.


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DISSEMINATION OF METARHIZIUM ANISOPLIAE OF LOW AND HIGH VIRULENCE BY MATING BEHAVIOR IN AEDES

AEGYPTI Filiberto Reyes-Villanueva, Javier A Garza-Hernandez, Alberto M Garcia-Munguia, Patricia Tamez-Guerra, Annabel FV Howard and

Mario A Rodriguez-Perez

Abstract

Dengue is a viral disease transmitted by Aedes mosquitoes. It is a threat for public health worldwide and its primary vector Aedes aegypti is becoming resistant to chemical insecticides. These factors have encouraged studies to evaluate entomopathogenic fungi against the vector. Here we evaluated mortality, infection, insemination and fecundity rates in A. aegypti females after infection by autodissemination with two Mexican strains of Metarhizium anisopliae.


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GENETIC DIFFERENTATION AMONG MACONELLICOCUS

HIRSUTUS(HEMIPTERA: PSEUDOCOCCIDAE) POPULATIONS LIVING ON DIFFERENT HOST PLANTS.

Rosas -Carcía, N.M., Sarmiento-Benavides, S.L., Villega -Mendoza, J.M., Hernández-Delgado S. and Mayek-Pérez, N Envirollmental Entomology. 2011; 39(3): 1043-1050.

Abstract

The pink hibiscus mealybug Maconellicoccus hirsutus (Green) is a dangerous pest that damages a wide variety of agricultural, horticultural, and forestry crops. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) fingerprints were used to characterize the genetic variation of 11 M. hirsutus populations infesting three plant species in Nayarit, Mexico. Analysis was carried out using four primers combinations, producing 590 polymorphic bands. Cluster analysis, as well as bootstrap dendrogram and nonmetric multidimensional scaling analysis, grouped M. hirsutus populations according to their host plant. The estimated FST values indicated a high differentiation in M. hirsutus populations among the three host plant species. These results were also supported by a Bayesian analysis, which indicated a population clustering robustness according to their host plant. Genetic variation among populations is not caused by geographic distances, as shown by a Mantel test.


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CONVENIENT GENOTYPING OF NINE BOVINE K-CASEIN VARIANTS

Víctor I. Pacheco Contreras, Diana L. Lourenco Jaramillo, Gaspar M. Parra Bracamonte, Juan C. Martínez González, Ana M.

Sifuentes Rincón. Electronic Journal of Biotechnology, 2011; 14 (4):1-6.

Abstract

K-casein gene polymorphisms are of major importance in the dairy industry due to their association with different quality and productive traits (i.e., milk protein). Several methods for genotyping this gene have been proposed; however, none are focused on the simultaneous discrimination of nine K-casein variants. A strategy based on PCR-RFLP was designed to characterize nine K-casein variants (A, B, C, E, F2, G, H, I and J) and used to genotype three cattle populations: Gyrholando (3/8 Gyr x 5/8 Holstein), Charolais and Carora. The B variant was the most frequent in the Charolais and Carora breeds, with allelic frequencies of 0.60 and 0.59, respectively. In the Gyrholando breed, four variants were found, with the A variant being the most frequent and E and H the least. The genotyping strategy was effective in detection and differentiation of K-casein variants, and it is proposed for use in laboratories with minimal molecular biology equipment for genotyping and evaluation of the phenotypic effects of nine K-casein variants on milk production and quality.


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IDENTIFICACIÓN DE LA VARIANTE Q204X EN GANADO CHARBRAY EN PRUEBA DE COMPORTAMIENTO

Williams Arellano Veraa, Carmen Yazmín Muñoz Mejíaa, Xochitl Fabiola De la Rosa

Reynaa, Luis Arístides López Bustamanteb, Gaspar Manuel Parra Bracamontea, Ana María Sifuentes Rincóna

Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias. 2011; 2(2): 193-198.

Resumen

Se identificó por medio de discriminación alélica, la variante Q204X del gen de la Miostatina en un grupo de 34 toretes de la raza Charbray del Noroeste de México sometidos a pruebas de comportamiento. Se obtuvo una frecuencia de 9.3 % de portadores heterocigotos, y una frecuencia génica del 5 % en la muestra evaluada. Este es el primer reporte de la presencia de la variante Q204X en ganado Charbray, con el cual se abre la posibilidad de diseñar estrategias de identificación y cuantificación del efecto de la variante segregada para complementar los esquemas de mejoramiento genético basados en características productivas y reproductivas en el ganado Charbray de México.


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IDENTIFICATION OF DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES IN THE

CITRUS EPIPHYTIC-YEAST PICHIA GUILLIERMONDII DURING INTERACTION WITH PENICILLIUM DIGITATUM

Larralde-Corona C.P., Ramírez-Gonzalez S., Oliva-Hernández A., Pérez-Sánchez G. and Narváez-Zapata J.A.

Biological Control. (2011) DOI 10.1016/j.biocontrol.2011.02.012.

Abstract

To gain insight into the antagonistic molecular mechanisms displayed by the biocontrol epiphytic-yeast Pichia guilliermodii (isolate LCBG-03), its patterns of gene expression were evaluated during direct and indirect induction with Penicillium digitatum EfiA, a well-known fungal phytopathogen during the postharvest processing of citrus. Assays of in vitro antagonistic activity indicated a strong inhibitory effect on fungal growth and spore germination by the yeast, even when yeast–fungus interaction was performed on a rich medium. Antagonist gene expression was evaluated in induced condition as well as in direct interaction using differential expressed sequence tags (ESTs) obtained by two methodologies; suppression subtractive hybridization (SSH) and differential display (DD). We obtained the genetic response of the yeast under three different specific metabolic conditions: starvation by carbon source competence, sensing of extracellular metabolites produced by active mycelium of P. digitatum (membrane system) and induction by fungal cell walls. As a result, we observed just one EST, associated as expected to energy metabolism in starvation conditions; for the membrane system, seven ESTs were obtained by the SSH methodology, all related with some of the following metabolic networks: energy, nitrogen, cell cycle, ABC transporters, response to stress and one unknown sequence. The induced (fungal cell walls) system produced the highest number of ESTs, with a total of 22, including all the metabolic networks mentioned above for the membrane system plus ESTs associated with signal transduction.


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RECENT ADVANCES AND NOVEL APPLICATIONS IN MICROBIAL DIVERSITY ESTIMATION BASED ON DNA ANALYSIS METHODS.

Narváez-Zapata JA, Reyes-López MA. Recent Patents on DNA & Gene Sequences, 2011; 5(2): 104-109.

Abstract

This review focuses on recent patents on the exploration and quantification of microbial diversity. Only the patents based on DNA analysis are considered. In general terms, the analysis of environmental samples can be investigated by using three main approaches: microarrays based technologies, genomes/metagenomes comparison and amplification and detection of operative taxonomic units. All patents can relate to the estimation of the microbial diversity, however, many of them were initially designed to detect important medical or agronomic microorganisms. Here, we briefly review recent technological achievements for DNA analysis that offer great potentials for the identification of species.


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REGULATION OF PIGMENT-RELATED GENES DURING FLOWER AND FRUIT DEVELOPMENT OF BIXA ORELLANA

Norma L. Rodríguez-Ávila1, José A. Narváez-Zapata2, Margarita Aguilar-Espinosa1 and Renata Rivera-Madrid1

Plant Molecular Biology Reporter. 2011; 29: 43-50.

Abstract

Annatto (Bixa orellana) is the sole source of the commercially important pigment bixin. The broad diversity of annatto phenotypes and the wide variation in pigment contents have restricted its use. Therefore, genetic improvement focusing on this variation is important in order to achieve optimal exploitation of annatto. To characterize and understand some of the genetic basis governing carotenoid production, two annatto cultivars with either pink or white flowers were selected on the basis of their contrasting pigment levels. Several complementary DNA (cDNA)-probes corresponding to genes involved in carotenoid biosynthesis (dxs, psy, pds, β-lcy, and ε-lcy) were cloned and analyzed by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) in different tissues of these two annatto cultivars during flower and fruit development. In general, expression of most selected genes could be associated with pigment overaccumulation in these cultivars. The pink cultivar exhibited higher carotenoid contents and higher pigment-related gene expression, and the two variants analyzed showed notable differences in gene expression in the highest pigment producing tissues.

EFFECTS OF COMPOST MADE WITH SLUDGE AND ORGANIC RESIDUES ON BEAN (PHASEOLUS VULGARIS L.) CROP AND

ARBUSCULAR MYCORRHIZAL FUNGI DENSITY

Luna Zendejas Héctor Santos, Solís Oba Myrna, López Wong Wenndy, Vera Reyes Andrea and González Prieto Juan Manuel

African Journal of agricultural Research. 2011; 6(6): 1580-1585,

Abstract

In this study we evaluated five composts prepared with two sludge: from a beverage factory and from a paper industry; they were mixture with organic residues from a pepper canned and corn stubble. Composts were tested over yield of common bean and population of arbuscular mycorrhizal (AM) fungi. Mixtures of residues and sludge were composted during four months producing a non phytotoxic material with good physical and chemical properties. Bean cultivated with the application of three composts growth higher than control (without compost). Considering the bean production it was higher in plots applied with composts 1, 2 and 5 compared with control, these show high nitrogen content. In plots applied with the five composts the number of AM fungi spores found was higher than in control. We demonstrate that the use of sludge to make compost is an interesting way to take advantage of residues and a manner to improve the soil properties, because the organic matter and minerals of waste and sludge could be transformed into compounds that could recover the soil fertility.


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EL SISTEMA CRE/LOXP1 COMO UNA HERRAMIENTA GENÉTICA EN YARROWIA LIPOLYTICA

Raymundo Rosas Quijano

Revista Mexicana de Micología. 2011; 33: 17-27

Abstract

The non-conventional yeast Yarrowia lipolytica has been broadly studied, its whole genome sequence is known and public, and there are many molecular tools for study itself. However, their genetic markers are limited. Therefore, we need to recycle these markers. Taking advantage of Y. lipolytica has the ability for express different sources of recombinant protein, we constructed one replicating plasmid for Cre1 recombinase from one replicative plasmid under the direction of a strong promoter. The recombinase activity was evaluated in mutants obtained by transposition. The mTnYl1plasmid includes two Lox at ends who are target sequences of phage P1 recombinase. Our results indicated high efficiency and specificity of the recombinase activity. Based on this strategy we replaced the URA3 selective marker gene contained in mTnYl1 and then we sequenced the segments generated after recombinase activity to corroborate its proper action. This strategy is simple as well as a powerful molecular biology tool for Y. lipolytica study under selection and use of one single marker.


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EVALUACIÓN DE LA TOXICIDAD DE CEPAS BACTERIANAS ENTOMOPATÓGENAS NAYARITAS PARA EL DESARROLLO DE UN BIOINSECTICIDA CONTR EL GUSANO

TELARAÑERO DEL AGUACATE. Dra. Ninfa Maria Rosas Garcia

Abstract

México es el primer productor de aguacate en el mundo. En 2001 produjo 902,500 Ton. con un área cultivada de 94,011 has. y un rendimiento de 9599.9 kh/ha . El 80% del aguacate se cultiva en la región de Uruapan en el estado de Michoacán (INEGI 2003); sin embargo, Nayarit se contempla como el segundo estado productor a nivel nacional. En todo el país son 29 estados los que se dedican a la producción del aguacate (SAGAR 1996) pero la explotación de aguacate a nivel comercial se practica solo en 16 estados entre los que se encuentran Michoacán, Nayarit, Puebla, Chiapas, Estado de México, Veracruz, Jalisco, Morelos, Guanajuato, Guerrero y Sinaloa, entre otros (Martinez 1997)


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ENTOMOPATHOGENIC FUNGI

Ninfa m. Rosas-García, Alejandro Sanchez-Varela, Jesús M. Villegas Mendoza and Jesús d. Quiroz-Velázquez

Abstract

There are more than 700 species of entomopathogenic fungi belonging to approximately 90 genera, however few species have been considered as biological control agents. They are able to kill any insect developmental stage and are wide spectrum pathogens. The general fungal taxonomy is now based on phylogenetically studies and includes Zygomycota, Ascomycota, Deuteromycota and Chytridiomycota. The mode of action of entomopathogenic fungi is a complex process that includes enzymes production to penetrate insect cuticle. Among these enzymes proteases called Pr play one of the most important roles followed by chitinases. The insects exhibit some defense mechanisms against fungal infection which include the presence of inhibitory compounds, but also possess cellular defense reactions which act when fungus invade the hemocele. Other cytotoxic metabolites are produced by entompathogenic fungi such as destruxins by Metarhizium anisopliae and beauvericin by Beauveria bassiana, however their role in pathogenicity is not completely clear. Some important genera are described in this chapter.


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Abstract

This chapter comprises in a descriptive way the basic procedures needed to evaluate and produce the Entomopathogenic bacterium Bacillus thuringiensis as it is the most popular biological control agent. The production and formulation process for finally being applied to the field. Bioassays are important to determine toxic activity and for choosing the best entomopathogenic strains toward different insects pests. The culture media, inoculums, and other conditions such as PH and temperature, are essential factors for mass production technology. Different bioassays procedures such as diet-based bioassays, disk bioassays, green house bioassays and field test are included with their main characteristics and applicability. In the same way, the mass production in a fermentation process is described as well as formulation developmetn for the field application.


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CAPÍTULO DE LIBRO La Dra. Ninfa María Rosas García PUBLICÓ EN LA PART IV: ENTOMOPATHOGENIC BACTERIA CHAPTER 14: BIOASSAY PROCEDURES AND MASS PRODUCTION TECHNOLOGY OF ENTOMOPATHOGENIC BACTERIA;PP. 309-327 En el libro Microbial insecticides principles and applications Editado por I. Alper Susurluk, J. Francis Borgio, K. Sahayaraj

CAPÍTULO DE LIBRO

IMPROVEMENT OF BIOLOGICAL CONTROL

AGENTS THROUGH MOLECULAR STRATEGIES Dra. Ninfa María Rosas García Molecular techniques have improve the efficiency of the bacterium Bacillus thuringiensis through increasing toxicity, broadening the range of target pests, and delaying pest resistance. The genes that produce the crystal toxins of B. thuringiensis have suffered a number of modifications that include gene mutation to produce crystal proteins with enhanced activity, gene integration in which toxic genes from one organism are integrated with another one to extend host range spectrum, chimeric proteins development to understand their mode of action and the biochemical and molecular interactions in order to design the suitable changes to achieve high efficacy or avoid unwanted effects on non-target organisms. Insecticidal genes have been inserted into other organisms which do not possess killing abilities but are useful due to their own characteristics. Among them some bacteria and fungi are also included.


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CAPÍTULO DE LIBRO ANTITUBERCULAR DRUGS DEVELOPMENT: RECENT ADVANCES IN SELECTED

THERAPEUTIC TARGETS AND RATIONAL DRUG DESIGN

Virgilio Bocanegra-García, Abraham García, Jose Prisco Palma-Nicolás, Isidro Palos and Gildardo Rivera

Introduction Mycobacterium tuberculosis, the causative agent of tuberculosis (TB), is a remarkably successful pathogen that has latently infected a third of the world population (Zhang et al., 2006). Infection occurs via aerosol, and inhalation of a few droplets containing M. tuberculosis bacilli is enough for lung infection (Hassan et al., 2006). After infection, M. tuberculosis pathogenesis occurs in two stages. The first is an asymptomatic state that can persist for many years in the host, called latent TB. The second stage requires only a weakened immune response to become activated (Zhang, 2004), then the bacteria begins replicating and causing characteristic symptoms such as cough, chest pain, fatigue and unexplained weight loss. If left untreated, the disease eventually culminates in death. The emergence of Human Immunodeficiency Virus (HIV) and the resultant Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS) pandemic underlined the importance of reactivation of the disease and its potentially catastrophic outcome since over 50% of deaths among HIVinfected patients results from co-infection with M. tuberculosis with the two pathogens inducing each other’s replication, thus accelerating the collapse of the immune system (Cole & Alzari, 2007). While it is impossible to determine the exact number of cases, the latest World Health Organization (WHO) survey estimates that close to 2 million deaths occur every year, that there are approximately 8 million new cases annually, and that every third individual on the planet has been exposed to or infected by M. tuberculosis (Dye, 2006; Cole & Alzari, 2007). Although TB can be treated and even cured with chemotherapy, treatment is exceedingly lengthy and takes 6-9 months (Blumberg, et al., 2003). In addition to significant toxicity, lengthy therapy also causes poor patient compliance, which is a frequent cause for selection of drug resistant and often deadly multidrug resistant TB (MDR-TB) bacteria (Zang et al., 2006). Currently, TB chemotherapy is made up of a cocktail of first-line drugs, isoniazid (INH), Rifampicin (RIF), pyrazinamide (PZA) and ethambutol (EMB), which are given for six Drug Development – A Case Study Based Insight into Modern Strategies 208 months (Blumberg et al., 2006). If this treatment fails as a result of bacterial drug esistance or intolerance to one or more drugs, second-line drugs are used, such as para-aminosalicilate (PAS), kanamycin, fluoroquinolones, capreomycin, ethionamide and cycloserine. These are generally less effective or more toxic with serious side effects (Blumberg et al., 2006). This second-line treatment can also result ineffective since MDR-strains that exhibit resistance to these second-line drugs are currently on the rise (Zhang & Amzel, 2002) Treatment is also made quite difficult by the presence of metabolically silent, persistent or dormant bacteria within host lesions. These are not susceptible to the anti-mycobacterial drugs that usually kill growing but not persistent bacteria (Zhang, 2004). While there are many reasons for drug resistance, including prescription of inadequate regimens, an uncertain drug supply, and ineffective drugs, duration of lengthy treatments is one of the major contributors because some TB patients prematurely stop their therapy after an initial, rapid heath improvement, thereby favoring the emergence of drug-resistant strains (Cole & Alzari, 2007)


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La M.C. SANJUANA HERNÁNDEZ DELGADO dirigió la tesis “ EFECTO DE LA FECHA DE SIEMBRA EN LA INCIDENCIA DEL GÉNERO Fusarium Y EN LA PRODUCCIÓN DE MICOTOXINAS EN GERMOPLASMA DE MAÍZ” ganadora del Premio AGROBIO 2011. El trabajo fue realizado por ALMA DELIA PAZ GONZÁLEZ estudiante de INGENIERO AMBIENTAL Y EN SEGURIDAD de la Universidad Autónoma de Tamaulipas unidad RHODE y dirigido además por la DRA. MARIBEL LEAL CASTILLO. El trabajo de investigación se desarrolló en el Laboratorio de Biotecnología Vegetal de este Centro.

El estudiante del programa de Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica. Víctor Hugo Villareal Villagrán recibió el reconocimiento “AL MEJOR DESEMPEÑO ACADÉMICO DE ALUMNOS DE POSGRADO 2011”.


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El Colegio de Profesores postuló el trabajo “Resistencia Genética a Macrophomina phaseolina en frijol común y producción de germoplasma con resistencia a producción carbonosa y sequía” por el Dr. Netzahualcóyotl Mayek Pérez al Premio a la Investigación en el Instituto Politécnico Nacional 2011.

PREMIO A LA EXCELENCIA PROFESIONAL POR LA UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN. En el marco de su 78 aniversario, la Universidad Autónoma de Nuevo León otorgó a 48 egresados el Reconocimiento a la Excelencia en el Desarrollo Profesional, que desde 2005 otorga la institución para honrar a quienes con su trayectoria enaltecen a esa casa de estudios. En el Aula Magna “Fray Servando Teresa de Mier”, el 21 de septiembre, se reunieron los egresados y sus familiares como actores principales de la ceremonia, que fue atestiguada por el ingeniero José Antonio González Treviño, Secretario de Educación en Nuevo León. En esta ocasión recibió el premio el Dr. Netzahualcóyotl Mayek Pérez, Ingeniero Agrónomo, 1993/ Profesor Titular y Responsable del Laboratorio de Biotecnología Vegetal del Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional.


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En la quinta sesión de Colegio de Profesores de este Centro fueron entregados celebrada el 7 de Octubre, la Dra. Ninfa María Rosas García entregó los nombramientos y felicitó a los nuevos profesores Colegiados del Centro de Biotecnología Genómica:

Dr. Gildardo Rivera Sánchez

Dr. Jesús Gerardo García Olivares

Dr. Víctor Ricardo Moreno Medina


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Felicitación a nuestro compañero Dr. Mario Rodríguez Pérez por haber obtenido el nivel 2 en el Sistema Nacional de Investigadores.


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Reconocimiento y Felicitación al Dr. Manuel Parra Bracamonte, por haber obtenido el 2 lugar de su categoría en el concurso “Reynosa con Valores” con el cuento titulado “La Felicidad”.


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Inoculante basado en Azospirillum Buscamos socios para licenciar

Invención El IPN busca empresas, empresarios o inversionistas interesados en comercializar un nuevo fertilizante biológico. La oportunidad de mercado es amplia debido al creciente interés por productos no contaminantes y una superficie solo para granos mayor a los 40 millones de Ha (En Tamaulipas mas de 1 millón de Has), lo que representa un volumen de venta potencial de 4000 millones de pesos. Aplicación Gramíneas (sorgo y maíz) y cultivos diversos. Ventajas •Incrementa la producción y la rentabilidad de los cultivos. •Reduce el uso de fungicidas y fertilizantes químicos, así como la contaminación de suelos y mantos freáticos. •Aplicable a varios cultivos como; maíz, sorgo, trigo, cebada, etc. •Se realiza como productos líquidos o sólidos. Tecnología Este inoculante fijador de nitrógeno y estimulante de crecimiento para gramíneas (sorgo y maíz) es un producto elaborado en una formulación líquida con bacterias promotoras de crecimiento. Estado de la Propiedad Industrial Solicitud de patente expediente PA/a/2005/008322.

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Inventores Alberto Mendoza Herrera, Maria Antonia Cruz Hernandez, Cuauhtémoc Jacques-

Hernandez.

Contacto. Cuauhtémoc Jacques-Hernández. Centro de Biotecnología Genómica del IPN. Depto. de Transferencia de Tecnología. +52(899)9243627 Ext. 87708. • email: [email protected] Referencia CBG #001


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Con motivo del 75 Aniversario del Instituto Politécnico Nacional, el Centro de Biotecnología Genómica tuvo la oportunidad de ser elegido como Sede de la Feria Internacional del Libro (FIL Politécnica), evento que se realiza anualmente desde 1981, y ha llegado a constituirse como la actividad cultural anual más importante en el Instituto Politécnico Nacional. Participaron en esta Feria más de 20 expositores que representan a 60 sellos editoriales, con una asistencia mayor a las 3000 personas en la Sede que tuvo lugar en las instalaciones de Plaza Sendero Periférico en la Ciudad de Reynosa, Tamaulipas.


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Feria Internacional del Libro (FIL Politécnica)

La organización de esta Feria, pudo lograrse gracias al Comité que se formo el pasado 24 de Marzo y estuvo integrado por un gran número de personas que contaba ya con la experiencia. Este lo integraban autoridades municipales, directivas del Parque Cultural Reynosa, el Instituto Reynosense para la Cultura y las Artes, el Consejo Consultivo de Instituciones de Educación Superior, Consejo Consultivo de Instituciones de Educación Media Superior, la Dirección de Turismo, Dirección de Atención Juvenil, CANIRAC, entre otros.

Se formaron seis comisiones para trabajar en equipo dentro del Comité organizador quedando de la siguiente manera: Comisión de Patrocinios, Coordinación de Programa, Dirección, Logística, Difusión, Voluntarios y Convocatorias. En relación a la difusión de la FIL, se trabajo arduamente para lograr tener un mayor impacto en el transcurso de los seis meses logrando obtener más de 30 publicaciones en los medios de comunicación.


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Asimismo es importante mencionar que durante la organización de la FIL, el Comité organizador tomo la decisión de lanzar en el mes de Abril la convocatoria de creación de cuento titulada “Reynosa con Valores” misma que concluyo en el mes de Julio con un buen número de trabajos recibidos siendo estos 30 cuentos. Los ganadores obtuvieron como premio una laptop, un reconocimiento del IPN y un bono en acervo bibliográfico del Instituto. Para la elección de la Sede, se obtuvo un lugar muy estratégico, un espacio muy grande dentro del centro comercial Plaza Sendero Periférico, al cual las visitas ascienden a las 20 mil personas diarias y en fines de semana a 35 mil. Contamos con la participación de patrocinios en dicho evento por parte de Grupo Farmacéutico Lopez, A.C., Maderera y Ferretera Blanquita, S.A. de C.V. y la empresa Crédito Familiar, A.C.


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En la ceremonia de inauguración se conto con la presencia del Alcalde Municipal de Reynosa, Tamaulipas el Lic. Jesus Everardo Villarreal Salinas, los 21 Regidores, los Diputados Amelia Vitales, Adolfo V. Gonzalez y Carlos Solis, así mismo tuvimos el honor de la presencia del Director del Consejo Tamaulipeco de Ciencia y Tecnología el Lic. Francisco Hernandez Montemayor, el Lic. Arnoldo Gonzalez Herrera quien estuvo en representación del Gobernador el Ing. Egidio Torre Cantú. Estuvieron presentes cada uno de los integrantes del Comité organizador de la FIL, así como los Directores y Rectores de las diferentes instituciones educativas de esta Ciudad. Complementariamente, se realizo un conjunto selectivo de actividades culturales: talleres interactivos infantiles, exposiciones fotográficas y pictóricas, danza y baile regional, recitales poéticos, exhibiciones de cortometrajes, presentación de trovadores, talleres de pintura y escultura, así mismo contamos con la participación de distinguidas personalidades Reynosenses con la presentación de pláticas y conferencias de relacionadas al arte. Se tuvo una buena respuesta de la comunidad en cuanto a la asistencia a los eventos realizados, estos quedaron como a continuación se indican:


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Dentro de las 20 Sedes seleccionadas distribuidas estratégicamente en el país, Reynosa fue la número 13. Los resultados fueron excelentes, a nuestros eventos asistieron alrededor de 3300 personas sin contar las visitas a las áreas de exhibición y venta de libros, en promedio las ventas llegaron a los cuatro mil títulos; uno de los libros más buscados fue “El Principito”, las editoriales más sobresalientes fueron “Océano” y “Putumayo”. Actualmente contamos con seis librerías en nuestra localidad, que son Librería Sanborns Sucursal Reynosa, Librería Buenas Nuevas, Librería Valdés y Estrada, Librería la Principal, Librería San Judas Tadeo y Librería Centro Cultural Trillas Sucursal Reynosa, mismas que su temática son de interés general, es por ello que la Feria tuvo un gran auge en nuestra Ciudad.


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Dentro la programación de la FIL, también formo parte la Caravana Nacional del Emprendedor organizado por la Secretaria de Economía y la Universidad Autónoma de Tamaulipas, en donde participamos con la instalación de un stand los días 29 y 30 de Septiembre, para la venta y exhibición de libros en la temática de emprendedurismo, dentro del evento se tuvo la instalación de espacios para asesoría, orientación en la implementación de un negocio, conferencias magistrales y cursos para la planeación de un negocio, este evento estuvo presente en el Gimnasio de la UAT.


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Caravana Nacional del Emprendedor

Del 24 al 30 de octubre se llevo a cabo la semana nacional de la ciencia y tecnología


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Las Actividades realizadas fueron: 1. 36 Conferencias 2. 2 Talleres (extracción adn y huerto familiar) 3. 39 Spots de ciencia publicados en la radio 4. 7 visitas a radio para charlas de trabajos de investigación 5. 1 publicación de investigación científica en televisión 6. 1 publicación de investigación científica en prensa 7. 1 vista guiada al centro de biotecnología Escuelas donde se impartieron las conferencias y talleres: 1. CBTA 275 (200) 2. CETIS 131 (350), 3. TEC MILENIO (150), 4. UVM (340) 5. UNID (100) 6. UAT-AZTLAN (200) 7. CBTIS NUEVA CREACIÓN (280) 8. UTT (100) Contamos con la asistencia de estudiantes a estas actividades mas de 1500.

Los ganadores del concurso fueron: MEDIA SUPERIOR Primer lugar Nombre: Juan Gerardo Parral Juárez Proyecto: Humus de Lombriz Escuela: CONALEP Rio Bravo Segundo lugar Nombre: Jesus Antonio Manzano Trovamala Villegas Proyecto: Iluminador ABO Escuela: CBTIS 7 Tercer lugar Elisa Margarita Garcia Valenzuela Proyecto: Percutor Brongsmarch Escuela: CBTIS 7 SUPERIOR Primer lugar Nombre: Jose Rafael Guzmán Sepulveda Proyecto: Detección de pureza de líquidos mediante el uso de fibras especiales Escuela: Unidad Multidisciplinaria Reynosa Rodhe - UAT Segundo lugar Nombre: Noé Rodolfo Córdova Trinidad Proyecto: Tierra física efectiva para reducir el consumo de energía Escuela: Universidad México Americana del Norte Tercer lugar Nombre: Jose Eduardo Negrete Medrano Proyecto: Control para el llenado automático de contenedores con agua con visualización en tiempo Escuela: Instituto Tecnológico de Reynosa SECUNDARIA Primer lugar Nombre: Mauricio Eduardo Carrillo de la Garza Proyecto: Garrafón fácil Escuela: Colegio Alborada en Rio Bravo


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Dentro del marco de la Semana Nacional de Ciencia y Tecnología se impartió Curso: Huerta para todos impartido por el Dr. Jose Luis

Hernández


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EVENTOS DEPORTIVOS

Se llevó a cabo el tradicional torneo de Retas de futbol CBG-IPN 75 años. En esta ocasión participaron cuatro equipos conformados por estudiantes de los programas de Maestría y Doctorado de este Centro, estudiantes del programa de Doctorado del CICATA Altamira y profesores de la maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica y trabajadores del Centro. De la misma manera participaron trabajadores del Centro de Educación Continua Unidad Reynosa. Los equipos participantes fueron Tacusimas, Independiente, Biosencibles y CBG UNITED. El campeón fue el equipo CBG UNITED quien venció en la gran final a Biosensibles tres goles por uno. El goleador del torneo fue Manuel Arratia del equipo CBG UNITED con 11 goles.


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En Agosto y Septiembre se entregaron Estimulo por Antigüedad de 10 años al siguiente personal

Juan Rodríguez Silva

Jesús Román Benítez

Pablo Cabrera Alvarado


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Le damos la Bienvenida a nuestro Centro a dos nuevos

compañeros:

Dr. Homar Gill Langarica en el Laboratorio de Biotecnología Experimental

Dr. Virgilio Bocanegra Garcia en el Laboratorio de Medicina de Conservación.

El 09 de Diciembre de 2011 a las 9:00 hrs.

Tuvo lugar el Examen Pre-Doctoral Del estudiante:

RÉGULO RUÍZ SALAZAR

Con la Tesis “Análisis de la diversidad genética de Phaseolus

coccineus L. de Veracruz, México”.


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Para celebrar la Independencia de México, se ofreció una comida de antojitos mexicanos a todo el personal del Centro.


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Le damos también la Bienvenida a nuestro Centro a dos nuevos compañeros: Dr. Homar Gill Langarica en el Laboratorio de Biotecnología Experimental Dr. Virgilio Bocanegra Garcia en el Laboratorio de Medicina de Conservación.


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El 09 de Diciembre se llevo a cabo la tradicional posada de nuestro Centro, la cita fue a las 8.00 pm en el Salón Balmoral del Hotel Howard Johnson, donde hubo

una grata convivencia entre regalos, música y una deliciosa cena.

Blvd. del Maestro s/n esq. Elías Piña, Col. Narciso Mendoza

Cd. Reynosa, Tamaulipas, México. C.P. 88710

Tels. +52 (899) 924-3627 y 925-1656

Tienes algún comentario? [email protected] y/o [email protected]


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Boletin 2011

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