Clase 18. Taxonomía y clasificación viral 2010

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MV. Cohinta Perdomo Cátedra de Microbiología e Inmunología F.C.V – U.C.V

Transcript of Clase 18. Taxonomía y clasificación viral 2010

MV. Cohinta PerdomoCátedra de Microbiología e Inmunología F.C.V – U.C.V

1. Todo organismo puede ser infectado por 1. Todo organismo puede ser infectado por un virus:un virus: Animales (vertebrados)Animales (vertebrados) PlantasPlantas BacteriasBacterias Insectos (invertebrados)Insectos (invertebrados) ProtozoariosProtozoarios HongosHongos

ANTECEDENTES

PlantasPlantas

ARNARN ADNADN

Todos ss

ss ds

ARNARN ADNADN

AnimalesAnimales

Retro ss ds ss ds

ARNARN ADNADN

BacteriasBacterias

ss ds ss ds

1.1. International Committee on Taxonomy of International Committee on Taxonomy of VirusesViruses (ICTV) (ICTV)

2.2. 6 órdenes, 87 familias6 órdenes, 87 familias (22 en med. Vet) (22 en med. Vet), 19 , 19 subfamilias, 348 géneros, y 2.288 especies.subfamilias, 348 géneros, y 2.288 especies.

3.3. Caudovirales, Herpesvirales, Caudovirales, Herpesvirales, Mononegavirales, Nidovirales, Mononegavirales, Nidovirales, Picornavirales y TymoviralesPicornavirales y Tymovirales

4.4. Composición variada: ácidos nucleicos, Composición variada: ácidos nucleicos, proteínas (capside), lípidos, proteínas y proteínas (capside), lípidos, proteínas y glúcidos (envoltura) glúcidos (envoltura)

5.5. Morfología distinta: icosaédrica, helicoidal y Morfología distinta: icosaédrica, helicoidal y compleja.compleja.

GENERALIDADES

A. Clasificación clínica (Sintomatología), A. Clasificación clínica (Sintomatología), anatomopatológica o epidemiológica: anatomopatológica o epidemiológica: criterio muy utilizado para nombrar las criterio muy utilizado para nombrar las especies de virusespecies de virus

1. Transmisión1. Transmisión Ingestión Ingestión DIGESTIVA DIGESTIVA InhalaciónInhalación RESPIRATORIARESPIRATORIA Contacto Contacto REPRODUCTIVAS, REPRODUCTIVAS,

CUTANEASCUTANEAS

CongénitaCongénita

2. Enfermedades generalizadas: 2. Enfermedades generalizadas: Viruela, dengue, rubéola, varicela, Viruela, dengue, rubéola, varicela,

sarampión, moquillo, peste porcina sarampión, moquillo, peste porcina africanaafricana

CLASIFICACION VIRALCLASIFICACION VIRAL

3. Enfermedades que afectan órganos 3. Enfermedades que afectan órganos específicosespecíficos

Virus neurotropos:Virus neurotropos: Encefalomielitis, encefalitis y rabiaEncefalomielitis, encefalitis y rabia

Virus entéricos:Virus entéricos: Rotavirus, coronavirus, enterovirus y algunos Rotavirus, coronavirus, enterovirus y algunos

adenovirusadenovirus Virus respiratorios:Virus respiratorios:

Ortomyxovirus, rinovirus y algunos Ortomyxovirus, rinovirus y algunos paramyxovirus, coronavirus y adenovirusparamyxovirus, coronavirus y adenovirus

Virus epiteliotropos:Virus epiteliotropos: Papilomavirus, Herpesvirus tipo 1 y 2Papilomavirus, Herpesvirus tipo 1 y 2

Virus oculares:Virus oculares: Adenovirus (conjuntivitis)Adenovirus (conjuntivitis)

Virus hepáticos:Virus hepáticos: Hepatitis tipo A, B, C y E, fiebre amarillaHepatitis tipo A, B, C y E, fiebre amarilla

Virus de transmisión sexual:Virus de transmisión sexual: Herpes simple, Papilomavirus, VIHHerpes simple, Papilomavirus, VIH

Arbovirus:Arbovirus: Todos los orbivirus (género de la familia Todos los orbivirus (género de la familia

Reoviridae), bunyavirus, flavivirus, togavirus Reoviridae), bunyavirus, flavivirus, togavirus y rabdovirusy rabdovirus

B. Área geográfica en donde se produjo la B. Área geográfica en donde se produjo la infección por primera vez:infección por primera vez:

Virus del EbolaVirus del Ebola Virus de NewcastleVirus de Newcastle Virus de la Encefalitis Equina de Virus de la Encefalitis Equina de

VenezuelaVenezuela

C. Nombre de investigadores:C. Nombre de investigadores: Sarcoma de RousSarcoma de Rous Papiloma de ShopePapiloma de Shope

D. Propiedades importantes del virusD. Propiedades importantes del virus Virus del mixoma, reaccionan ante la Virus del mixoma, reaccionan ante la

mucinamucina

CLASIFICACION VIRALCLASIFICACION VIRAL

InícialesIníciales

Reovirus: Reovirus: respiratory enteric orphanrespiratory enteric orphan Picornavirus: “Pico”(pequeño) y RNAPicornavirus: “Pico”(pequeño) y RNA Circovirus: virus circularesCircovirus: virus circulares Arbovirus: Arbovirus: arthropod-borne virusesarthropod-borne viruses

Conclusión: Criterios poco claros lo que Conclusión: Criterios poco claros lo que conduce a confusiónconduce a confusión

CLASIFICACION VIRALCLASIFICACION VIRAL

Ocurrió el surgimiento de 2 escuelas:Ocurrió el surgimiento de 2 escuelas:

1.1. Utiliza criterio de nomenclatura binomial Utiliza criterio de nomenclatura binomial

latina conservando los nombres ya latina conservando los nombres ya

existentesexistentes

Ej: Measles virus Measles Ej: Measles virus Measles

morvillivirusmorvillivirus

2. Elaboración de un criptograma o texto 2. Elaboración de un criptograma o texto

cifrado junto con el nombre vernáculo cifrado junto con el nombre vernáculo

del virus. Utilizado por taxonomistas.del virus. Utilizado por taxonomistas.

Anteriormente se tomaban en cuenta:Anteriormente se tomaban en cuenta:

1. Composición básica de la partícula:1. Composición básica de la partícula:

Ácido nucleico (tipo, tamaño)Ácido nucleico (tipo, tamaño)

Proteínas (estructurales y no Proteínas (estructurales y no

estructurales)estructurales)

Lípidos (presencia de envoltura)Lípidos (presencia de envoltura)

2. Tamaño:2. Tamaño:

UltrafiltraciónUltrafiltración

MEME

3. Morfología (simetría):3. Morfología (simetría):

Ejs: Poxvirus y ReovirusEjs: Poxvirus y Reovirus

Criterios a considerar para la nomenclatura binomialCriterios a considerar para la nomenclatura binomial

4. Estabilidad de la partícula:4. Estabilidad de la partícula: pHpH TemperaturaTemperatura Solventes orgánicosSolventes orgánicos DetergentesDetergentes

5. Antigenicidad:5. Antigenicidad: Pruebas serológicasPruebas serológicas

Actualmente, los mas importantes son:Actualmente, los mas importantes son:

a. La naturaleza del genoma viral:a. La naturaleza del genoma viral:

Tipo y carácter del genomaTipo y carácter del genoma

Estrategias de replicaciónEstrategias de replicación

PolaridadPolaridad

b. Utilización de la retrotranscripción por b. Utilización de la retrotranscripción por

algunos grupos de virusalgunos grupos de virus

c. Estructura del viriónc. Estructura del virión

ICTV (2000) establece un criterio de ICTV (2000) establece un criterio de clasificación taxonómica con:clasificación taxonómica con:

6 órdenes, 87 familias6 órdenes, 87 familias (22 en med. Vet) (22 en med. Vet), , 19 subfamilias, 348 géneros, y 2.288 19 subfamilias, 348 géneros, y 2.288 especies especies OrdenOrden: Relación filogenética : Relación filogenética distante: viralesdistante: virales

Caudovirales, Mononegavirales y Caudovirales, Mononegavirales y Nidovirales, etc.Nidovirales, etc.

FamiliaFamilia: existe una relación entre grupo. : existe una relación entre grupo. Se utiliza sufijo Se utiliza sufijo viridaeviridae SubfamiliasSubfamilias: Interrelación con puntos : Interrelación con puntos

confusos entre los grupos. confusos entre los grupos. Sufijo:Sufijo:VirinaeVirinae

GeneroGenero: Sufijo v: Sufijo virusirus Especie: Se conservan los nombres Especie: Se conservan los nombres

existentes y no incluye nombre del existentes y no incluye nombre del génerogénero

NOMENCLATURA DE LOS VIRUS ANIMALESNOMENCLATURA DE LOS VIRUS ANIMALES

Orden Familia Tipo AN GrupoAN

Poxviridae

Asfarviridae

Iridoviridae

Herpesviridae Virus

Caudovirales (Subf: Alphaherpesvirinae dsDNA Virus DNA

Betaherpesvirinae

Gammaherpesvirinae)

Adenoviridae

Papillomaviridae

Circoviridae Virus

Parvoviridae ssDNA

CLASIFICACIÓNCLASIFICACIÓN

Orden Familia Tipo AN Grupo AN

Hepadnaviridae ADN Retro- transcriptores

Caudovirales Retroviridae RNA

Reoviridae Virus Birnaviridae dsRNA

Bornaviridae

Filoviridae

Mononegavirales Paramyxoviridae Virus Virus RNA

Orthomyxoviridae ssRNA(-)

Bunyaviridae

Arenaviridae

Rhabdoviridae

Orden Familia Tipo AN Grupo AN

Picornaviridae

Mononegavirales Caliciviridae

Astroviridae Nodaviridae Virus Virus

Coronaviridae ssRNA(+) RNA

Nidovirales Arteriviridae

Flaviviridae

Togaviridae

¿Priones?

Virus ADNVirus ADN

Papillomaviridae:Papillomaviridae: Papilomas o Papilomas o verrugasverrugas

Polyomaviridae:Polyomaviridae: Poly + oma = Poly + oma = variedad de tumoresvariedad de tumores

Adenoviridae:Adenoviridae: Glándula adenoidesGlándula adenoides Herpesviridae:Herpesviridae: ErupciónErupción Poxviridae:Poxviridae: PústulaPústula Parvoviridae:Parvoviridae: PequeñoPequeño Hepadnaviridae: Hepadnaviridae: HígadoHígado Asfarviridae:Asfarviridae: African swine feverAfrican swine fever

FAMILIAS VIRALES DE IMPORTANCIA VETERINARIAFAMILIAS VIRALES DE IMPORTANCIA VETERINARIA

Virus ARNVirus ARN

Picornaviridae: Picornaviridae: Poliovirus, Poliovirus, Insensible al eterInsensible al eter

Caliciviridae: Caliciviridae: Calix = copaCalix = copa Togaviridae: Togaviridae: Toga = capaToga = capa Flaviviridae: Flaviviridae: AmarilloAmarillo Orthomyxoviridae: Orthomyxoviridae: Ortho= Ortho=

verdadero Myxo = mucosidadverdadero Myxo = mucosidad Paramyxoviridae: Paramyxoviridae: Para = al lado Para = al lado

de myxo = mucosidadde myxo = mucosidad Filoviridae: Filoviridae: FilamentosoFilamentoso

Virus ARNVirus ARN

Coronaviridae: Coronaviridae: CoronaCorona Arenaviridae: Arenaviridae: Aspecto de arenilla Aspecto de arenilla

por ribosomaspor ribosomas Bunyaviridae: Bunyaviridae: BunyamweraBunyamwera Retroviridae: Retroviridae: Trancriptasa inversa Trancriptasa inversa

o Retrotranscriptasao Retrotranscriptasa Rhabdoviridae: Rhabdoviridae: Cilindro (bala o Cilindro (bala o

proyectil)proyectil) Reoviridae: Reoviridae: Respiratory Enteric Respiratory Enteric

OrphanOrphan Birnaviridae: Birnaviridae: Bi = dos RNABi = dos RNA AstroviridaeAstroviridae: : Aspecto de estrellaAspecto de estrella

Cuatro series de símbolos en cada criptograma ( : : : )

1. Primera serie: Tipo de ácido nucleíco / Tipo de ácido nucleíco / número de tirasnúmero de tirasR = ARN D = ADN1 = Tira única2 = Doble tira

Parvoviridae Parvoviridae (D/1:1,5-2,2/19-(D/1:1,5-2,2/19-32:S/S:I,V/C,I,O,R)32:S/S:I,V/C,I,O,R)

Cuatro series de símbolos en cada criptograma ( : : : )

2. Segunda serie: Genoma segmentado / PM Genoma segmentado / PM del Genoma / % AN en la partícula infectantedel Genoma / % AN en la partícula infectante

= Genoma segmentado Peso Molecular en millones (106) % de AN en la partícula infectante

ReoviridaeReoviridae (R/2 : (R/2 : 12-12-19/15-30 : S o So/S : I, S, 19/15-30 : S o So/S : I, S,

V/I, O, Ve/Ac, Au, Di)V/I, O, Ve/Ac, Au, Di)

Cuatro series de símbolos en cada criptograma ( : : : )

3. Tercera serie: Forma de la partícula / Forma de la partícula / presencia de envoltura / forma de presencia de envoltura / forma de nucleocápsidenucleocápside

S = esférica E = alargada, terminales no

redondeados U = alargada, terminales redondeados X = compleja, distinta de los indicado

en U e = presencia de envoltura o cáscara o = virión ocluido en la matriz de la

proteína viral

BunyaviriadeBunyaviriade (R/1: (R/1: 6- 6- 7/* : Se/E : 7/* : Se/E : I,V/C,Ve/Ac,Di)I,V/C,Ve/Ac,Di)

Cuatro series de símbolos en cada criptograma ( : : : )

4. Cuarta serie: Tipo de huésped / modo de Tipo de huésped / modo de transmisión / tipo de vectortransmisión / tipo de vector

Tipo de huésped: I = invertebrado V = = invertebrado V = vertebradovertebrado

Modo de transmisión R = Aparato respiratorio R = Aparato respiratorio Ve = Vector invertebrado Ve = Vector invertebrado I= Tubo Intestinal I= Tubo Intestinal O = Contacto O = Contacto C = Congénita C = Congénita

Tipo de vector Ac = Acarina (ácaro o garrapata)Ac = Acarina (ácaro o garrapata) Au = Auchenorrincha ( insectos de Au = Auchenorrincha ( insectos de

plantas)plantas) Di = Dípteros (Moscas y mosquitos)Di = Dípteros (Moscas y mosquitos) Si = Sifonáptera (pulga)Si = Sifonáptera (pulga)

En todos los casos: * = propiedad no conocida o incompleta

BunyaviriadeBunyaviriade (R/1: (R/1: 6- 6- 7/* : 7/* : Se/E : I,V/C,Ve/Ac,Di)Se/E : I,V/C,Ve/Ac,Di)

))

Ejemplos:Ejemplos:

ParvoviridaeParvoviridae (D/1 : 1,5-2,2/19-32 : S/S : I,V/C,I,O,R)(D/1 : 1,5-2,2/19-32 : S/S : I,V/C,I,O,R) PapillomavaviridaePapillomavaviridae (D/2 : 3-5/12 : S/S : V/O,Ve/Ac,Si)(D/2 : 3-5/12 : S/S : V/O,Ve/Ac,Si) PicornaviridaePicornaviridae (R/1 : 2,3-2,8/30 : S/S : 1,V/I,O,R)(R/1 : 2,3-2,8/30 : S/S : 1,V/I,O,R) ReoviridaeReoviridae (R/2 : (R/2 : 12-12-19/15-30 : S o So/S : I, S, V/I, O, 19/15-30 : S o So/S : I, S, V/I, O,

Ve/Ac, Au, Di)Ve/Ac, Au, Di) BunyaviriadeBunyaviriade (R/1: (R/1: 6- 6- 7/* : Se/E : I,V/C,Ve/Ac,Di)7/* : Se/E : I,V/C,Ve/Ac,Di) OrthomyxoviridaeOrthomyxoviridae (R/1 : (R/1 : 4/1 : Se/E : V/R)4/1 : Se/E : V/R)