Dx tecnicas en la acuicultura puno 2015
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Diagnóstico, prevención y control deEnfermedades en Acuicultura, la experiencia deChile una situación a considerar.
Relator invitado: Dr. Juan Battaglia Aljaro DMVUnidad de Microbiología de pecesVeterquimica S.A. [email protected]
Puno, Marzo del 2015.
Enfrentando las patologías en acuicultura.
1 • Diagnóstico
2 • Muestreo
3 • Veterinario
4 • Laboratorio
5 • Autoridad
6 • Historial
Mortalidad.
Indicadores de crecimiento:
Factor de condición
FCR
SGR
GF3
¿Qué ve el productor?
Deterioro Sostenido
La observación del comportamiento de los peces y la aparición deanomalías externamente son las primeras señales que el productordebe pesquisar para tomar las medidas necesarias.
Observación de sintomatología.
Necropsia.
Actividad que se realiza para analizar la sintomatología de los peces, queconsta de un análisis anatomopatológico externo e interno.
Aquí además se toman las muestras necesarias para los análisis posterioresque pueden incluir:
Siembra en medios.
Sistema miniaturizados Api®.
Frotis para tinción.
Frotis para IFAT.
Muestras para PCR.
Muestras para CC.
Muestras para ELISA.
Muestra para histología.
Antibiograma y MICs.
Necropsia.
Existen diversas metodologías de tinción de frotis, las más utilizadas son:
Tinción de Gram.
Tinción de AOS.
Tinción de Giemsa.
Frotis para tinción.
Existe una gran variedad de pruebas bioquímicas que se realizan a lasbacterias pero existen algunas que son sumamente importantes, entrelas que se pueden destacar:
Forma celular
Motilidad
Gram
Oxidasa
Catalasa
Crecimiento a diferentes Tº y Salinidades.
Crecimiento en diferentes medios
Métodos convencionales en tubo y placa
Comercialmente existen una serie de medios de cultivos que pueden ser divididos en tres categorías:
Generales
Selectivos o específicos
Metabólicos
Cultivos bacterianos.
Estos medios se caracterizan por presentar los nutrientes necesarios para eldesarrollo de una gran variedad de bacterias, sin embargo, no todas las bacteriascrecen en este tipo de medio.
Medios generales.
Entre los más utilizados en el diagnóstico en acuicultura están:
TSA con y sin suplemente de NaCl. En este medio se puede crecer bacterias como Vibrio anguillarum, V. ordalii, Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri.
Agar Nutritivo: de amplio espectro.
Agar Chocolate: es un medio sumamente rico en nutrientes y se ocupa ampliamente en la microbiología. En la acuicultura se utiliza para el crecimiento de P. salmonis.
Agar Marino (2216 de Zobbels): Agar para el aislamiento de bacterias marinas.
Medios generales
Estos medios se utilizan para aislar los patógenos de otras bacteriasambientales.
También don usados para aislar bacterias de fastidioso crecimiento,como Flavobacterium psychrophilum ,Tenacibaculum maritimum oRenibacterium salmoninarum.
Medios Selectivos o específicos
Entre los más utilizados en el diagnóstico en acuicultura están:
TCBS: Selectivo para Vibrios.
MacConkey: Selectivo para Enterobacterias (Yersinia ruckeri y Aeromonas salmonicida).
Columbia Blood Agar: Bacterias β Hemoliticas (Streptococcus spp).
TYES / AOA: selectivo para bacterias de la familia Flavobacteriacea de FW.
FMM: Selectivo para bacterias de la familia Flavobacteriacea de SW.
KDMC / KDM2: Selectivo para el patógeno de peces Renibacterium salmoninarum.
Medios Selectivos o específicos
Medios Selectivos o específicos
Estos medios sirven para determinar actividades enzimáticas, degradación deazucares y aminoácidos principalmente.
Entre los más utilizados para la caracterización de patógenos bacterianospodemos encontrar:
Medio Descarboxilasa de Moller (Aminoácidos).
OF (Azucares).
Citrato de Simmons.
Medios metabólicos
Medios metabólicos
Immuno Florescent Antibody Technique.
Está técnica sirve para detectar al patógeno directamente en frotis deórganos y lesiones mediante el uso de anticuerpos específicos que estánmarcados con fluoróforos.
Existen una gran variedad de Kits comerciales para la realización de estaherramienta diagnóstica.
IFAT.
La Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) es una herramienta altamente utilizada para ladetección de patógenos bacterianos y virales principalmente.
Existen 2 tipos de PCR
PCR Convencional.
PCR en Tiempo Real.
PCR.
PCR convencional encontramos 3 tipos de protocolos:
PCR de Detección
PCR de Tipificación
RT–PCR.
En la literatura existe una gran cantidad de protocolos de PCR para ladetección de patógenos bacterianos de peces, entre los que podemosencontrar:
Aeromonas salmonicida.
Yersinia ruckeri.
Flavobacterium psychrophilum.
Flavobacterium columnare.
Tenacibaculum maritimum.
Piscirickettsia salmonis.
Vibrio anguillarum.
Streptococcus phocae
Streptococcus iniae.
PCR convencional (Detección)
PCR en tiempo real.
PCR de tipificación.
Cultivo Celular
Enzyme Linked Immuno Sorbet Assay.
Ensayo Inmuno–Enzimatico.
Existen dos tipos:
Detección de antígenos.
Detección de anticuerpos.
ELISA
Histología
Antibiograma y MICs
Antibiograma y MICs
20 µL de Inoculo bacteriano
80 µL de medio cultivo
100 µL de medio de cultivo con Ab
8 C+164210,50,250,1250,063C- 0,031
X XXXXXXXXX32 X
Antibiograma y MICs.
16% 4%4%
4%
8%
8%
36%
20%
CMI FLU Flavobacterium
psychrophilum
0,031 ppm
0,063 ppm
0,125 ppm
1 ppm
4 ppm
8%
32%
16%
32%
8% 4%
CMI FFC Flavobacterium
psychrophilum
0,125 ppm
0,25 ppm
0,5 ppm
1 ppm
4 ppm
16% 4%4%
12%
24%
32%
4% 4%
CMI OT Flavobacterium
psychrophilum
0,031 ppm
0,063 ppm
0,25 ppm
0,5 ppm
2 ppm
4 ppm
8%8%
4%
8%
4%
68%
CMI AO Flavobacterium
psychrophilum
0,063 ppm
0,125 ppm
2 ppm
8 ppm
16 ppm
32 ppm
Sistemas minuaturizados Api®.
Aglutinación en porta objetos y Dot–Blot.
Western–Blot.
Secuenciación de genes.
Muchas gracias por la atención….