PROSITEEJERCICIOS 1 A partir de la siguiente secuencia de aminocidos obtn la informacin que se te pide: MTDECVTRNYGVGIRSPNGSENRGSFIMADNTDAKGCTPESLVVGGATAASPLPANKFVARMPVERY ASE YNMSHKHRGVALIFNHEFFDIPSLKSRTGTNVDAQELKKAFENLGFAVSVHKDCKLRDILKHVGKAAE LD HTDNDCLAVAILSHGEHGYLYAKDTQYKLDNIWHYFTATFCPSLAGKPKLFFIQACQGDRLDGGITLE KG VTETDGESSTSYKIPIHADFLFSYSTIPGYFSWRNINNGSWYMQSLIRELNANGKKYDLLTLLTFVNQRV ALDFESNVPATPMMDRQKQIPCLTSMLTRILRFGDKPNGNKAG

A que tipos de familia pertenece esta protena o A la familia de las caspasas Cul es su posible funcin o La escisin del precursor IL-1 en un enlace Asp-Ala para generar la citocina madura biolgicamente activo Que perfiles caractersticos tiene o p20 y p10 Cul es la secuencia patrn consenso o Cul es el formato de alineamiento de clustal para las diferentes subunidades de dicha protena o Cules son los aminocidos mas conservados. GLPKQ

EJERCICIO 2 Los dedos de zinc son pequeos motivos estructurales de protenas que pueden coordinar uno o ms iones de zinc para ayudar a estabilizar sus pliegues Busca en PROSITE las protenas que contengan dedos de zinc y escoge una que tenga como actividad el pasar de GTP a GDP y responde las siguientes preguntas

En que evento celular se ve implicada o Control del ciclo ceular En qu familia ejerce su accin o GTPasas Como se llama el dominio que contiene el motivo dedo de zinc o ARF GTPase-activating proteins (ARFGAP) Cul es la secuencia caracterstica

o Se tiene una estructura 3D caracterstica con este dominio (coloca la imagen ) Realiza una alineamiento utilizando clustal y resalta las regiones conservadas de la primer secuencia de humano que aline EJERCICIO 3 Utilizando PROSITE Y NCBI Busca a la PARP en homo sapiens una enzima que cataliza la unin covalente de ADP ribosa.PARP est involucrada en la regulacin de diversos eventos celulares como la diferenciacin y proliferacin. Estructuralmente tiene alrededor de 1000 aa. Una vez la que encuentres su secuencia realzale un escaneo avanzado, para que encuentres los diferente dominios que la componen, explica de cada domino la secuencia de aa que los conforman, su ubicacin y su funcin