Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos...

39
Los microbios que nos habitan: no estamos solos Carmen Peláez Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL-CSIC) Ciclo de Conferencias Qué sabemos de. Charla con el CSIC en Madrid. Octubre 2018.

Transcript of Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos...

Page 1: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Los microbios que nos habitan: no estamos solos

Carmen Peláez Instituto de Investigación en Ciencias de la

Alimentación (CIAL-CSIC)

Ciclo de Conferencias Qué sabemos de. Charla con el CSIC en Madrid. Octubre 2018.

Page 2: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

El ser humano, los animales y plantas forman con sus microorganismos (microbiota) un ente único

El conjunto de genes de cada ser humano, animal o planta se llama genoma y los genes

de su microbiota se denominan microbioma

Page 4: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Siglo XIX

Siglo XX

Siglo XXI

Nada parece más trascendental en Bacteriología que el conocimiento de las bacterias infecciosas y nada más secundario que el de los microbios inofensivos; y, no obstante si éstos desapareciesen, bien pronto el planeta se tornaría inhabitable para el hombre. Santiago Ramón y Cajal (1852-1934)

Page 5: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Siglo XXI

Hito científico en el inicio del siglo XXI

MICROBIOMA HUMANO

Page 6: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Corynebacterium

Staphylococcus

Propionibacterium

Microbiota de la piel Microbiota vaginal

FIRMICUTES: Lactobacillus Organismos entéricos Gardnerella S. epidermidis Streptococcus grupo B Levaduras

Lactobacillus

Bacteroides Bacteroidetes

Faecalibacterium Firmicutes

Bifidobacterium Actinobacteria

Verrucomicrobia

Akkermansia

Proteobacteria

Escherichia

Microbiota tracto digestivo

Page 8: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

1014 = 100 billones de bacterias

http://microbioun.blogspot.com.es/2016/10/cuantas-bacterias-tenemos-en-nuestro.html[21/08/2017

¿? células humanas

Sender et al. Cell 164: 337. 2016

0,9 x 1011/g heces 3,8 x 1013 = 38 billones de bacterias

400 g heces en el colon

2,5 x 1013 = 25 billones de células humanas

similar bacterias que células humanas

10 veces más bacterias que células humanas

Bacterias pesan la mitad las bacterias pesan 200 g

¿Cuánto somos de humano y cuánto de bacteria?

Somos 50% humanos

20-30 años, 70 kg, 170cm

:1013

Page 9: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Muy inestable Baja diversidad

2-3 años: composición de adulto

Cómo adquirimos la microbiota intestinal y cómo evoluciona durante la vida

Transmisión vertical

Diversa y estable Alta variabilidad interindividual: Huella

Infancia Adolescencia Adultos Ancianos

Baja diversidad

Heredamos y colonizan

Adquirimos y se adaptan

Perdemos

Page 13: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Desarrollo cerebral pre y post natal

Kelly et al 2017 Frontiers in Neuroscience. 2017. 11: 490

Factores que influyen en el eje cerebro-intestino-microbiota

durante la vida

Estrés materno: Glucocorticoides Inflamación Microbiota alterada Alimentación Antibióticos

Estrés infantil Alimentación Antibióticos

Page 14: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Hidrolizan hidratos de carbono complejos no digestibles: fibra alimentaria

Metabolizan compuestos no digestibles: polifenoles

Sintetizan vitaminas

AGCC

Lenta fermentación microbiana

Monosacáridos

Acético Propiónico Butírico

Gluconeogénesis y lipogénesis

Energía colonocitos

Absorción, depósito glucógeno y gasto

90% absorción

Participación activa en el metabolismo

Homeostasis metabólica

Cómo actúa la microbiota intestinal

Page 15: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Leche materna: - humana - otros mamíferos

Miel Rafinosa

Oligosacáridos complejos

FIBRA ALIMENTARIA: CARBOHIDRATOS COMPLEJOS NO DIGESTIBLES DE LA DIETA QUE ALCANZAN INTACTOS EL COLON

Fibra insoluble: Almidón no digestible, celulosa trigo integral, verduras

Fibra soluble: Inulina, pectinas, gomas, mucinas achicoria, cebolla, espárrago, frutas, legumbres, semillas, avena, cebada

Page 18: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Ridaura et al. Science 341: 1079. 2013

15

15 dias

OBESIDAD

15 d; dieta alta en HC baja en grasa

OBESIDAD

Page 19: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Argonne National Laboratory University of Chicago

6 familias durante seis semanas

Alta similitud entre la microbiota de orificios nasales, manos y pies y el entorno

60 familias: microb. boca, piel y heces Song et al., Microbiol Infectious Dis DOI: 10.7554/eLife.00458. 2013

Piel > boca y heces

“Microbiota del hogar”

“Microbiota de obesidad familiar”

“Microbiota familiar”

Page 20: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Patrón nutricional: Factor externo más importante que influye en la microbiota

2007 2008

Arumugam et al. Nature. 473: 174. 2011

Enterotipo 2- Prevotella

Alta en carbohidratos complejos: fibra Baja en grasa saturada y azúcares simples

Enterotipo 1- Bacteroides

Alta en proteínas, grasa saturada, azúcares simples. Baja o ausente en carbodidratos complejos: fibra

Page 21: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Occidentalización: Impacto en la diversidad microbiana: disbiosis

África Central

USA

Tribu pigmeos BaAka Recolectores

Tribu pigmeos Batu Agricultores

Gomez et al.Cell Reports 14: 142. 2016

Dieta alta en fibra Dieta intermedia

Dieta baja en fibra

Pérdida de diversidad microbiana

Page 22: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Martens . Nature. 529: 158. 2016 Sonneburg et al. 5 2 9: 212. 2016

Occidentalización: Impacto en la diversidad microbiana: disbiosis

La pérdida de diversidad microbiana, es decir la disbiosis, empeora con las sucesivas generaciones

¿Qué está pasando con la fibra?

Page 23: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Descubrimiento de los antibióticos A. Fleming (1928): disminución de mortalidad por infecciones, erradicación de epidemias infecciosas

Sustitución parto vaginal por cesárea.

Disminución lactancia materna

Aumento de medidas de higiene

Siglos XIX, XX y XXI

Pérdida de diversidad y aparición de enfermedades emergentes

Además……

Page 24: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Antibióticos en la infancia

Enfermedad Inflamatoria Intestinal

Enfermedad Inflamatoria Intestinal

Obesidad infantil

Blaser M. Nature 476. 2011

asma

alergias reflujo

gastroesofágico H. pylori

Enfermedades emergentes

Page 25: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

PROBIÓTICOS PREBIÓTICOS TRASPLANTE FECAL

Page 26: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Enterococcus faecium Streptococcus thermophilus Escherichia coli Saccharomyces boulardii

PROBIÓTICOS: bacterias vivas que administradas en las cantidades adecuadas proporcionan beneficio en la salud

Bifidobacterium B. bifidum B. longum B. infantis B. breve B. adolescentis B. animalis B. lactis

Lactobacillus L. acidophilus L. delbrueckii subsp. bulgaricus L. helveticus L. johnsonii L. reuteri L. plantarum L. casei L. fermentum L. gasseri L. rhamnosus L. salivarius

Especies aceptadas como probióticas por la ISAPP (2014) (1x109/ración): beneficios generales y frecuentes a nivel de especie

Akkermansia muciniphila Faecalibacterium prausnitzii Eubacterium hallii, Roseburia

cepa

SE BUSCAN

vivos

Page 27: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Administrados por vía oral los probióticos pueden actuar a cuatro niveles:

4) En órganos extraintestinales: - Sistema inmune sistémico y cerebro

¿CÓMO ACTÚAN LOS PROBIÓTICOS?

1) En la boca: - Actividad anticariogénica

2) En el lumen intestinal - Actividad metabólica: obesidad, intolerancia a la lactosa - Defensa frente a patógenos: nutrientes, pH, antimicrobianos

3) En la mucosa y epitelio intestinal: - Defensa frente a patógenos: sitios de unión a mucosa - Interacción con sistema inmune

S. mutans

Page 28: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

PREBIÓTICOS: Carbohidratos complejos no digestibles que a través de su metabolización por los microorganismos intestinales, modulan la composición

y/o actividad de la microbiota intestinal confiriendo un efecto fisiológico beneficioso para el hospedador

Síntesis enzimática: isomerización, transglicosilación

LACTULOSA: Disacárido de fructosa y galactosa OsLu: Oligosacáridos de lactulosa GOS (Galacto oligosacáridos: oligosacáridos de galactosa) FOS (Fructo oligosacáridos: oligosacáridos de fructosa): Inulina

Leche materna: - humana - otros mamíferos

Page 29: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

- En el lumen intestinal : Modulación de la microbiota y su metabolismo

Ácidos grasos de cadena corta

¿COMO ACTÚAN LOS PREBIÓTICOS?

-En la mucosa y epitelio intestinal: - Inmunomodulación y actividad antiinflamatoria - Integridad del epitelio - Absorción de minerales

Efectos metabólicos: Regulación apetito y saciedad

pH

Page 30: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Trasplantes fecales

Rupnik et al., Nature Reviews 7: 529. 2009

Infección por Clostridium difficile

Page 31: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

PROBIÓTICOS PREBIÓTICOS TRASPLANTE FECAL DIETA

Page 33: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Clark y Mach. J Int Society of Sports Nutrition. 13:43. 2016

Casos prácticos. ENTRENAMIENTO INTENSO

6-10 g/kg/dia 20-35% ingesta diaria

10-20 % ingesta diaria 1,2-1,7 g/kg/dia

ALTO

ALTO-MEDIO

BAJO

MUY BAJO

AGCC

Page 34: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Candela et al .Mechanisms of Ageing and Development 136-137 .70–75. 2014

Casos prácticos. PERSONAS MAYORES

Page 35: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Fetissov et al NATURE REVIEWS .VOL 13 | JANUARY 2017

: AGCC,leptina, pYY

: grelina

Van de Wouw et al 2017. J Nutrition. doi: 10.3945/jn.116.240481. 2017

¿ Es verdad que….

Page 38: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

Light et al 2018. Nature. https://doi.org/10.1038/s41586-018-0498-z

Listeria monocytogenes

Cahoon and Freitag 2018.

¿Es verdad que….

Page 39: Los microbios que nos habitan: no estamos solos · Los microbios que nos habitan: no estamos solos . Carmen Peláez . Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL

CSIC-Catarata

Grupo de Biología Funcional de Bacterias Lácticas

CIAL-CSIC

Teresa Requena M. Carmen Martínez-Cuesta

Davidson 2017. Environmental Microbiology (2017) 19(6), 2112–2114