Monitoreo del proceso de purificación · Determinación de la concentración de proteínas Método...
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Monitoreo del proceso de purificación
Determinación de la concentración de proteínas
Método de Bradford
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Purificación de la enzimaLDH
Extracción y precipitación
PurificaciónDeterminación de la concentración
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• Conocer la concentración de proteínas en unamuestra, permite evaluar el proceso depurificación.
• Rendimiento: Porcentaje de actividad biológica de la proteína de interés a cada paso de la purificación. Actividad del extracto original =100%
• Grado de Pureza: Incremento en pureza a lo largo del proceso.
P=𝐴𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐𝑖𝑓𝑖𝑐𝑎 𝑒𝑛 𝑙𝑎 𝑓𝑟𝑎𝑐𝑐𝑖𝑜𝑛 𝑋
𝐴𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐𝑖𝑓𝑖𝑐𝑎 𝑒𝑛 𝑙𝑎 𝑓𝑟𝑎𝑐𝑐𝑖𝑜𝑛 𝑖𝑛𝑖𝑐𝑖𝑎𝑙
• Lo que se puede hacer con una proteína super pura.
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Actividad totalActividad especifica
Act
ivid
ad e
spec
ific
a
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1 2 3 4 5 6
Superdex (Exclusion molecular)
Mono Q (intercambio Aniónico)
CARRILES Fracciones1. 412. 423. 434. 44 5. 456. 46
CARRILES1. PaBADH wt2. E124S (fracciones 27+28 A y B utilizadas para cristalización)
3. Fracción 26 A4. Fracción 29 A
5. Fracción 26 B6. Fracción 26 B
1 2 3 4 5 6
Purificación de la mutante E124S de Betaína aldehído deshidrogenasa de Pseudomonas aeruginosa
La pureza no era buena solo utilizando cromatografías de intercambio iónico y afinidad.
Máximo grado de pureza alcanzado
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Métodos para monitorear el proceso de purificación
Los métodos más usuales son:
- Absorción en el ultravioleta.
- Reacción del Biuret.
- Método de Lowry.
- Método de Bradford.
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Principio
• En condiciones ácidas, el colorante Coomassie Brillant Blue G-250 se une a las proteínas por los aminoácidos básicos (Arg, Lys, His) y con los residuos aromáticos (Trp, Tyr y Phe).
• El colorante tiene tres formas:
• Forma catiónica (470 nm)
• Forma neutral (650 nm)
• Forma aniónica (595 nm)Ganske, BMG LABTECH,2008.
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•El rango de determinación de proteína es de 1-10 mg/ml (ensayo micro) y de 0,5 -1,4 mg/ml (ensayo estándar).
Método de Bradford
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Actividadespecífica
Dadoen:𝑈𝑛𝑖𝑑𝑎𝑑𝑒𝑠/
𝑚𝑔 𝑑𝑒𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒í𝑛𝑎
Necesitamos:
a) Determinación de la cantidad de proteína de interés (LDH).I. Propiedades espectroscópicas.II. Detección por fluorescencia.III. Unión a fluoróforosIV. Ensayo enzimático.
b) Determinación de cantidad total deproteína.
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Determinación de la cantidad deproteína
Absorbancia a 280mn Bradford
Ventajas • Simple y rápido
• No destructivo
• Muy sensible 1µg/mLa
1.5 mg/mL
• Complejo colorante-
proteína tiene un altoε
Desventajas • Pocoexacto • Afectado por algunos
detergentes.
• Depende de la
presencia de residuos:
Tyr y Trp.
• El colorante se une a las
celdas de cuarzo.
Determinación • Concentración𝐴𝑏𝑠280𝑛𝑚
(µg/µL)=( )*10ε (%)
• Curva patrón
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Determinación de concentración de
proteínas
Curva patrón Muestras
Orden de adición de reactivos para la determinación de proteínas del estándar BSA
[BSA]= 0.1 mg/mL
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Determinación de concentración de
proteínas
Curva patrón
Muestras
[BSA]= 0.1 mg/mL
Diluciones LDH
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Cálculo
• 𝐶𝑜𝑛𝑡𝑒𝑛𝑖𝑑𝑜𝑑𝑒𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒í𝑛𝑎 µ𝑔 =𝐴𝑏𝑠595𝑛𝑚−𝑏
∗𝐹
b= ordenada al origen
m= pendiente
F= Factor de dilución (número de veces que diluyeron)
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Paso de
purificación
Vol de fracción
(mL)
Proteína total
(mg)
Actividad (U) Actividad específica
(U/mg)
Extracto crudo
F1
1,400 10,000 100,000 10
Precipitación con
(NH4)2SO4 F2
280 3000 96000 32
Cromatografía
exclusión de
tamaño F4
Desalado
90 400 80,000 200
Cromatografía
intercambio
iónico
FIA,FIB,FIC
80 100 60,000 600
Cromatografía
de afinidad
FPA,FPB,FPC
6 3 45,000 15,000
Purificación de un enzima hipotético x