Bioinformática

Por Jorge A. Islas Pineda.

jorge_islas@msn.com

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Que es Bioinformática ?

Es la aplicación de tecnología computacional a la gestión y análisis de datos biológicos.

Bioinformática es una disciplina científica emergente que utiliza tecnología de la información para organizar, analizar y distribuir información biológica con la finalidad de responder preguntas complejas en biología.

http://www.solociencia.com/biologia/bioinformatica-concepto.htm

Perl

• Practical Extraction and Reporting Language.

• Lenguaje de programación .

• Compilador.

Usos tipicos

• Procesamiento de Textos.

• Administración de sistemas.

• CGI y programación WEB.

• Interacción con Data Bases

Aplicaciones tipicas

• Proyecto del Genoma humano.

• NASA.

• Scripts.

Caracteristicas

• Libre (Open Source).

• Flexible.

• Seguro.

• Dinamico.

Programación en PERL

Ejemplo

Agregar el siguiente codigo en un archivo llamado hello.plprint “Hello World\n”;

Ejecucion

# perl hello.pl

#! /usr/bin/perl para Unix

# chmod 777 hello.pl#chmod +x hello.pl#./hello.pl

Opciones

# perl - w hello.pl

#! /usr/bin/perl -wpara Unix

Activa el uso de Warnings.

Comentarios

Para comentarion en Perl. Iniciar la linea de codigo con el simbolo # , o despues del “;”.

Ejemplo:

#esto es un comentarioPrint “ Hello World”; #esto es un comentario

Tarea #1

Ensayo sobre Bioinformatica.

1 cuartilla maximo.

http://www.slideshare.net/ucbwebmaster/cmo-escribir-un-ensayoesarrollo, conclusion.