TOMO II PROGRAMAS DE ESTUDIO DE LAS …. Dictámenes de... · Exposición ( X ) Exámenes parciales...

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TOMO II

PROGRAMAS DE ESTUDIO DE LAS ASIGNATURAS DEL PLAN

DE ESTUDIOS PROPUESTO

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CONTENIDO PRIMER AÑO Principios de Programación ……………………………………………… 5 Biología Molecular ……………………………………………… 9 Biología y Fisiología Celular ………………………………………………. 12 Bioquímica ………………………………………………. 15 Matemáticas I ………………………………………………. 19 Inglés ………………………………………………. 22 Bioinformática I ………………………………………………. 26 Botánica y Fisiología Vegetal ………………………………………………. 29 Genética ………………………………………………. 32 Principios de Estadística ………………………………………………. 35 Matemáticas II ………………………………………………. 38 Inglés ………………………………………………. 41 SEGUNDO AÑO Bioinformática II ………………………………………………. 47 Metabolismo Secundario ………………………………………………. 50 Agroecología y Sustentabilidad ………………………………………………. 53 Bioestadística ………………………………………………. 56 Matemáticas III ………………………………………………. 59 Inglés ………………………………………………. 62 Genómica Funcional ………………………………………………. 67 Bioética, Bioseguridad y Legislación ………………………………………………. 70 Genómica de la Conservación ………………………………………………. 73 Edafología y Microbiología del Suelo ………………………………………………. 76 Matemáticas IV ………………………………………………. 80 Inglés ………………………………………………. 83 QUINTO SEMESTRE Genómica Comparativa ………………………………………………. 89 Fitopatología y Mecanismos de Resistencia ……………………………………………….

92

Fitomejoramiento Genético ………………………………………………. 96 Temas Selectos en Ciencias Agrogenómicas I ……………………………………………….

101

Fronteras de la Genómica Agrícola I ………………………………………………. 104 Inglés ………………………………………………. 106 SEXTO SEMESTRE Biología de Sistemas ………………………………………………. 111 Biotecnología Vegetal y Microbiana ………………………………………………. 115 Producción de Semillas y Cultivo de Tejidos ……………………………………………….

118

Temas Selectos en Ciencias Agrogenómicas II ……………………………………………….

123

Fronteras de la Genómica Agrícola II ………………………………………………. 125 Inglés ………………………………………………. 127 SÉPTIMO SEMESTRE Trabajo de Investigación I ………………………………………………. 133 OCTAVO SEMESTRE Trabajo de Investigación II ………………………………………………. 136 OPTATIVAS Metagenómica ………………………………………………. Evolución Molecular ………………………………………………. Desarrollo y Desafíos del Campo Mexicano ……………………………………… Innovación Tecnológica en el Área Agrícola ………………………………………

139 142 145 149

4

PRIMER AÑO

5

UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO

Escuela Nacional de Estudios Superiores

Unidad León

Plan de estudios de la Licenciatura en Ciencias Agrogenómicas

Programa de la asignatura

Principios de Programación

Clave

Año 1

Créditos 8

Área

Campo de conocimiento

Genómica y Bioinformática

Nivel de Formación

Básico

Modalidad

Curso ( X ) Taller (X ) Lab ( ) Sem ( )

Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)

Carácter Obligatorio (X ) Optativo ( ) Obligatorio E ( ) Optativo E ( )

Horas

Duración: 18 semanas Semana Total año

Teóricas 3 Teóricas 54

Prácticas 2 Prácticas 36

Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )

Asignatura antecedente

Ninguna

Asignatura subsecuente

Bioinformática I

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender las bases y antecedentes de la computación, así como los conceptos básicos de programación; adquirir un pensamiento abstracto que le permita resolver problemas mediante la implementación de programas computacionales. Aplicar las bases de programación mediante la implementación de programas computacionales en diversos lenguajes de programación.

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Índice temático

Unidad Tema Horas

Teóricas Prácticas

1 Introducción a la computación 8 6

2 Programación estructurada 8 6

3 Módulos (subrutinas, funciones, procedimientos) 8 6

4 Estructuras de datos básicas 8 6

5 Introducción a lenguajes y máquinas 10 6

6 Implementación de programas computacionales en Perl y C 12 6 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático

Unidad Tema y subtemas

1 Introducción a la computación

1.1 ¿Qué es una computadora?

1.2 ¿Qué es un algoritmo?

1.3 ¿Qué es un lenguaje de programación?

1.4 ¿Qué tipos de lenguajes de programación existen?

1.5 ¿Qué es un paradigma de programación y cuáles existen?

1.6 ¿Cuál es la metodología para solucionar problemas con una computadora?

1.7 Lenguajes algorítmicos.

2 Programación estructurada

2.1 Variables.

2.2 Operadores.

2.3 Estructuras secuenciales.

2.4 Estructuras de control de flujo.

3 Módulos (subrutinas, funciones, procedimientos)

3.1 Ámbito de una variable (variables globales y locales).

3.2 Diferencia entre procedimientos y funciones.

3.3 Declaración de procedimientos y funciones.

3.4 Paso de argumentos por valor y por referencia.

3.5 Recursividad.

4 Estructuras de datos básicas

4.1 Arreglos lineales (vectores).

4.2 Matrices y arreglos multidimensionales.

4.3 Pilas y Colas.

4.4 Árboles y Grafos (redes).

5 Introducción a lenguajes y máquinas

5.1 ¿Qué relación guardan los lenguajes con la computabilidad?

5.2 Jerarquía de Chomsky de los lenguajes.

5.3 Autómatas finitos.

5.4 Gramáticas transformacionales.

5.5 Autómatas pushdown y gramáticas libres de contexto (CFG).

6 Implementación de programas computacionales en Perl y C

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Actividades didácticas Evaluación del aprendizaje

Exposición ( X ) Exámenes parciales ( X )

Trabajo en equipo ( X ) Examen final ( X )

Lecturas ( X ) Trabajos y tareas ( X )

Trabajo de investigación ( ) Presentación de tema ( X )

Prácticas (taller o laboratorio) ( X ) Participación en clase ( X )

Prácticas de campo ( ) Asistencia ( )

Otras (especificar) Otras (especificar)

Perfil profesiográfico

Título o grado Licenciado(a) en Computación o Informática, Ingeniero(a) en Sistemas

Experiencia docente Mínimo dos años

Otra característica

Bibliografía básica: Wirth, N. Algoritmos y estructuras de datos. Prentice Hall, 1987. Lipschutz, S. Estructura de datos. Serie Schaum en Computación. McGraw-Hill, 1988. Wirth, N. Algoritmos + Estructuras de datos = Programas. Dossat, 1992. Dijkstra, E.W. A Discipline of Programming. Prentice Hall, 1997. Knuth, D.E. The Art of Computer Programming Vol. 1, 2, and 3 (3rd Ed.). Addison Wesley, 1997. Sudkamp, T. A. Languages and Machines: An Introduction to the Theory of Computer Science (2nd Ed.). Addison-Wesley, 1998. Hopcroft, J. E., Motwani, R. and Ullman, J. D. Introduction to Automata Theory, Languages and Computation (2nd Ed.). Addison-Wesley Longman, 2000. Kernighan, B.W., y Ritchie, D.M. El lenguaje de programación C (2da Ed.). Prentice Hall, 1991. Schwartz, R.L., and Phoenix, T. Learning Perl (3rd Ed.). O’Reilly, 2001. Wall, L., Christiansen, T., and Orwant, J. Programming Perl (3rd Ed.). O’Reilly, 2000. Ralston, A., Reilly, E. D. and Hemmendinger, D. Encyclopedia of Computer Science (4th Ed.). Nature Publishing Group, 2000. Bibliografía complementaria: Turing, A. (1950). Computing Machinery and Intelligence. Mind LIX: 433-460. Benenson Y., Adar R., Paz-Elizur T., Livneh Z., Shapiro E. DNA molecule provides a computing machine with both data and fuel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100(5), 2191-2196. 2003. Benenson Y, Gil B, Ben-Dor U, Adar R, Shapiro E. An autonomous molecular computer for logical control of gene expression. Nature. 429(6990), 423-429. 2004. Hayes, B. Computing comes to life. American Scientist. 89(3), 204-208. 2001. Chen J., Wood D.H. Computation with biomolecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97(4), 1328-1330. 2000. Hayes, B. Graph Theory in Practice: Part I. American Scientist. 88(1), 9-13. 2000. Hayes, B. Graph Theory in Practice: Part II. American Scientist. 88(2), 104-109. 2000. Ravasz E., Somera A.L., Mongru D.A., Oltvai Z.N., Barabasi A.L. Hierarchical organization of modularity in metabolic networks. Science. 297(5586), 1551-1555. 2002. Agar, J. and Turney, J. Turing and the Universal Machine: The Making of the Modern Computer. Totem Books Press, 2001. Aho, A. V. and Hopcroft, J. E. The Design and Analysis of Computer Algorithms. Addison-Wesley Longman, 1974. Atallah, M. J., Fox, S. and Lassandro, S. Algorithms and Theory of Computation Handbook. CRC Press,1998. Cormen, T.H., Leiserson, C.E., Rivest, R.L. and Stein, C. Introduction to Algorithms (2nd Ed.).

8

The MIT Press, 2001. Baase, S. and Van Gelder, A. Computer Algorithms: Introduction to Design and Analysis (3rd Ed.). Addison-Wesley Longman, 1999. Kingston, J. H. Algorithms and Data Structures: Design, Correctness (2nd Ed.). Addison-Wesley Longman, 1997. Knuth, D. E. and Greene, D. H. Mathematics for the Analysis of Algorithms (3rd Ed.). Birkhauser Boston Press, 1999. Okasaki, C. Purely Functional Data Structures. Cambridge University Press,1999. Skiena, S. S. The Algorithm Design Manual. Springer-Verlag, 1997.

9



Unidad León



Biología Molecular

Clave

Año 1

Créditos 8

Área


Biología Celular y Molecular

Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender los procesos fundamentales de replicación, transcripción y traducción del material genético. Comprender los fundamentos teóricos de las metodologías generales empleadas para el análisis de ácidos nucléicos, proteínas, la secuenciación y el análisis de genomas, así como las metodologías más recientes empleadas en las ciencias agrogenómicas.

10

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Los ácidos nucléicos 6 4

2 Estructura y replicación de los genomas 6 4

3 Expresión genómica - transcripción 6 4

4 Expresión genómica - traducción 6 4

5 Regulación de la expresión genética 6 4

6 Técnicas de análisis y amplificación de ácidos nucleicos 6 4

7 Secuenciación de biomoléculas 6 4

8 Biosensores 6 4

9 Microbiochips: tecnologías y aplicaciones 6 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Los ácidos nucléicos

1.1. Conceptos y ejemplos de nucleósido, nucleótido y polinucleótidos.

1.2. Estructura del DNA y RNA.

1.3. Función de los ácidos nucleicos en la síntesis de proteínas.

1.4. Función de nucleótidos libres.

1.5. Estructura y función de ATP, ADP Y AMP.

2 Estructura y replicación de los genomas

2.1 El genoma eucarionte.

2.2 Introducción a la replicación del DNA.

2.3 Mutación y reparación.

2.4 Principios de recombinación.

2.5 Cromatina.

3 Expresión genómica - transcripción

3.1 La transcripción.

3.2 Transcripción en procariontes.

3.3 Transcripción en eucariontes.

3.4 El procesamiento del RNA.

4 Expresión genómica - traducción

4.1 La traducción.

4.2 El código genético.

5 Regulación de la expresión genética

5.1 La regulación génica en procariotes.

5.2 La regulación génica en eucariontes.

5.3 Genómica comparativa y evolución.

6 Técnicas de análisis y amplificación de ácidos nucleicos

6.1 Extracción y separación de ácidos nucleicos.

6.2 Electroforesis de ácidos nucleicos; mapeo por restricción.

6.3 Transferencia de ácidos nucleicos e hibridación.

6.4 Síntesis química y purificación de oligonucleótidos.

6.5 La reacción de polimerasa en cadena.

11

6.6 Producción de sondas para ácidos nucleicos.

6.7 Técnicas generales del DNA recombinante.

7 Secuenciación de biomoléculas

7.1 Secuenciación de DNA por tecnología capilar.

7.2 Secuenciación de DNA por tecnologías de pirofosfatasa.

7.3 Secuenciación de DNA por tecnologías de ligación.

7.4 Secuenciación masiva usando microchips y secuenciación por moléculas individuales.

7.5 Secuenciación de proteínas.

8 Biosensores

8.1 Diferentes tipos y formatos de biosensores para ácidos nucléicos, proteínas y metabolitos.

9 Microbiochips: tecnologías y aplicaciones

9.1 Tipos de microbiochips: microchips, chips bioelectrónicos, chips con detectores nucleotídicos, chips con detectores protéicos.

9.2 Detección y cuantificación de señales en microbiochips.

9.3 Amplificación exponencial de señales en microbiochips.

9.4 Perfiles de expresión génica por medio de microbiochips.

9.5 Análisis de genomas empleando cDNA microbiochips.

9.6 Perfiles de expresión proteica (proteomas) por medio de microchips.

9.7 Los chips del futuro: evolución de las nano y las pico tecnologías.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Biología o áreas afines



Bibliografía básica: Brown, T. A.; Genomes; Garland Sciences Publishing; 2007; 3rd edition. Lodish et al.; Molecular Cell Biology; W. H. Freeman and Company; 2004; 5th edition. Lewin B.; Genes IX; Jones & Bartlett Publishers, Inc.; 2007; 9th edition. Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas.

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Unidad León



Biología y Fisiología Celular

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender cómo se organizan y componen las células de los organismos vivos; entender los elementos que componen a las células tanto procarióticas como eucarióticas, así como sus procesos fundamentales.

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Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Células 3 2

2 Estructura y propiedades de membranas 4 3

3 Organización intracelular 4 2

4 Tráfico Intracelular y citoesqueleto 4 2

5 Citoesqueleto 4 3

6 Comunicación celular 4 3

7 Conversión de energía: Mitocondria y cloroplasto 4 3

8 Ciclo celular y muerte celular programada 4 3

9 Mecanismos de división celular 4 3

10 Uniones celulares, adhesión celular y matriz extra celular 4 2

11 Células germinales y fertilización 3 2

12 Desarrollo de organismos multicelulares 3 2

13 Histología 3 2

14 Inmunidad innata 3 2

15 Sistema inmunológico adaptativo 3 2 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Células

2 Estructura y propiedades de membranas

3 Organización intracelular

4 Tráfico Intracelular y citoesqueleto

5 Citoesqueleto

6 Comunicación celular

7 Conversión de energía: Mitocondria y cloroplasto

8 Ciclo celular y muerte celular programada

9 Mecanismos de división celular

10 Uniones celulares, adhesión celular y matriz extra celular

11 Células germinales y fertilización

12 Desarrollo de organismos multicelulares

13 Histología

14 Inmunidad innata

15 Sistema inmunológico adaptativo






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Bibliografía básica: Alberts, Johnson, Lewis, Ralf, Roberts and Walter; Molecular Biology of the Cell; Pearson; 2004; 5th edition. Cooper, G. M. and Hausman, R. E. (2006). The Cell: A Molecular Approach, 4th edition, ASM Press and Sinauer Associates. Maynard Smith John and Szanthmáry Eörs. The Origins of Life. From the Beginning of Life to the Origins of Language. Oxford University Press. 1999.

Bibliografía complementaria: Encyclopedia of Life Sciences y Artículos originales de revistas científicas.

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Unidad León



Bioquímica

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender y explicar los principios físicos y químicos que gobiernan la estructura y el comportamiento de las moléculas de interés biológico, estudiar a profundidad las bases de la bioquímica, y entender y manejar sus fundamentos.

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Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Fundamentos de la bioquímica 2 0

2 Agua 4 4

3 Amino ácidos, péptidos, proteínas 6 4

4 Enzimas 6 4

5 Coenzimas y vitaminas 6 4

6 Carbohidratos y glícobiologia 6 4

7 Lípidos 6 4

8 Bioenergética y el metabolismo 6 4

9 Técnicas de separación y purificación de proteínas 6 4

10 Métodos para la caracterización y determinación de estructuras tridimensionales de macromoléculas

6 4

Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Fundamentos de la bioquímica

1.2 Las interacciones débiles.

1.3 Los enlaces de alta energía.

1.4 La estructura de las macromoléculas determinada por los enlaces

fuertes y débiles.

2 Agua

3 Amino ácidos, péptidos, proteínas

3.1. Clasificación de aminoácidos.

3.2. Propiedades Físicas (estado físico, solubilidad, punto de fusión).

3.3. Propiedades químicas (zwitterión, anfoterismo, punto isoeléctrico).

3.4. Reacciones metabólicas (descarboxilación, desaminación, transaminación, óxido-reducción).

3.5. Enlace peptídico. Estructura y nomenclatura de péptidos.

3.6. Hidrólisis de péptidos.

3.7. Concepto de proteínas.

3.8. Clasificación de proteínas.

3.9. Estructura tridimensional de proteínas.

3.10. Función bioquímica de las proteínas, (estructurales, hormonas, enzimas, anticuerpos, etc).

3.11. Biosíntesis de proteínas.

4 Enzimas

4.1. Concepto.

4.2. Nomenclatura y clasificación.

4.3. Características de la reacción enzimática.

4.4. Factores que alteran la velocidad de reacción enzimática.

4.5. Función bioquímica de las enzimas en las vías metabólicas.

5 Coenzimas y vitaminas

5.1. Estructuras.

5.2. Clasificación de acuerdo a su función como coenzimas.

5.3. Función bioquímica, importancia de las reacciones enzimáticas

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6 Carbohidratos y glícobiología

6.1. Monosacáridos.

6.1.1. Estructuras de monosacáridos más comunes.

6.1.2. Función bioquímica e importancia.

6.2. Oligosacáridos.

6.2.1. Enlace glucosídico.

6.2.2. Disacáridos más importantes bioquímicamente.

6.2.3. Hidrólisis de los disacáridos.

6.3. Polisacáridos.

7 Lípidos

7.1. Lípidos simples.

7.1.1. Estructuras y nomenclatura.

7.1.2. Reacciones características.

7.1.3. Función Bioquímica.

7.2. Lípidos compuestos.

7.2.1. Ejemplos y estructuras.

7.2.2. Función bioquímica.

7.2.3. Estructura de membranas biológicas.

7.3. Derivados de lípidos.

7.4. Substancias asociadas a lípidos.

7.4.1. Hormonas esteroidales.

7.4.2. Ácidos biliares.

7.4.3. Vitaminas liposolubles.

8 Bioenergética y el metabolismo

8.1. Glicólisis, gluconeogénesis, y vía de las pentosas fosfato.

8.2. Fundamentos de la regulación metabólica: glucosa y glicógeno.

8.3. Ciclo del ácido cítrico.

8.4. Cadena respiratoria.

8.5. Fosforilación oxidativa y fotofosforilación.

8.6. Metabolismo de proteínas.

8.6.1. Desnaturalización.

8.6.2. Hidrólisis.

8.6.3. Aminoácidos glucogénicos y cetogénicos.

8.7. Metabolismo de lípidos.

8.7.1. Biosíntesis de triglicéridos y fosfolípidos.

8.7.2. Beta oxidación de ácidos grasos.

8.8. Integración Metabólica.

9 Técnicas de separación y purificación de proteínas

9.1 Métodos basados en la solubilidad de proteínas.

9.2 Métodos basados en su masa molecular.

9.3 Métodos basados en su carga eléctrica.

9.4 Métodos basados en interacciones específicas.

10 Métodos para la caracterización y determinación de estructuras tridimensionales de macromoléculas

10.1 Espectroscopía de absorción.

10.2 Espectroscopía de emisión.

10.3 Dicroísmo circular y lineal.

10.4 Resonancia magnética nuclear.

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10.5 Difracción de rayos X.

10.6 Scattering de macromoléculas en solución.

10.7 Espectrometría de masas.













Bibliografía básica: McMurry John E. and Begley Tadhg P. The Organic Chemistry of Biological Pathways Roberts & Company Publishers; 1 edition (February 2005) Housecroft, C. E. 8 E. C. Constable Pearson Chemistry: An Introduction to Organic, Inorganic & Physical Chemistry. Pretince Hall; 3rd Edition; 2005. Nelson, David. L. & Michael M. Cox.; Lehninger: Principles of Biochemistry; W. H. Freeman and Company, New York; 2008; 5th Edition. Bibliografía complementaria: Encyclopedia of Life Sciences Artículos originales de revistas científicas.

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Unidad León



Matemáticas I

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad Curso ( X ) Taller ( ) Lab ( ) Sem ( )

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Ninguna


Matemáticas II

Indicativa ( )



Objetivo general: Manejar, a nivel introductorio, una serie de temas, los cuales resultarán complementarios a otros cursos, útiles como herramientas en materias posteriores y a lo largo de su vida profesional. Si bien no se abarcarán todos los temas a profundidad, se espera que el alumno adquiera una base sólida sobre la cual pueda construir posteriormente si así lo requiere. Este curso es además un primer acercamiento a la formalidad matemática. Como tal, se espera que el alumno realice sus primeras demostraciones, que empiece a entender la idea de estructura y que adquiera la confianza necesaria para resolver problemas y acercarse a temas con

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contenido matemático.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Conjuntos 10 0

2 Álgebras booleanas 12 0

3 Inducción 10 0

4 Técnicas de conteo 12 0

5 Relaciones y funciones 16 0

6 Teoría de gráficas 12 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Conjuntos

1.1 Conjuntos como colecciones de objetos y ejemplos de conjuntos.

1.2 Igualdad de conjuntos.

1.3 Subconjuntos.

1.4 Operaciones con conjuntos.

1.5 Propiedades de las operaciones con conjuntos.

2 Álgebras booleanas

2.1 Axiomas que definen un álgebra booleana.

2.2 Dos ejemplos: conjunto potencia y el espacio {0,1}.

2.3 Demostración de propiedades a partir de los axiomas.

3 Inducción

4 Técnicas de conteo

4.1 Permutaciones.

4.2 Combinaciones.

4.3 Teorema del binomio.

4.4 Principio de las casillas.

4.5 Combinaciones con repetición: separadores.

4.6 Principio de inclusión y exclusión.

5 Relaciones y funciones

5.1 Definición de función.

5.2 Funciones y técnicas de conteo.

5.3 Funciones inyectivas, suprayectivas y biyectivas.

5.4 Funciones invertibles.

5.5 Relaciones y sus propiedades.

5.6 Relaciones de equivalencia.

5.7 Relaciones de órden.

6 Teoría de gráficas

6.1 Definiciones.

6.2 Los puentes de Koenigsberg: ciclos eulerianos.

6.3 Circuitos Hamiltonianos.

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6.4 Gráficas ponderadas y distancias.

6.5 Árboles.

6.6 Planaridad.



Trabajo en equipo ( ) Examen final ( X )



Prácticas (taller o laboratorio) ( ) Participación en clase ( X )




Título o grado Licenciado(a) en Matemáticas o áreas afines



Bibliografía básica: Cárdenas H., Lluis E., Raggi F., Tomás F.; Álgebra superior; ed. Trillas. • Grimaldi R.P. ; Matemáticas discreta y combinatoria; ed. Addison Wesley. • Shifrin T., Adams M.; Linear Algebra, a Geometric Approach. Freeman and Company, 2002 • Wallis W.D.; A beginner’s Guide to Discrete Mathematics; ed. Birkhauser.

Bibliografía complementaria: • Pérez Seguí M.L.; Combinatoria; Cuadernos de Olimpíada de Matemáticas.

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Unidad León



Inglés

Clave

Año 1

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Ninguna


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje, y como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área. Objetivos específicos: 1. Intercambiar descripciones sobre un pueblo o ciudad. 2. Describir una fotografía e inferir sobre estilos de vida.

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3. Hablar sobre salud y hacer sugerencias. Intercambiar información del cuerpo y de la salud. 4. Intercambiar información sobre acontecimientos de la vida, viajes y vacaciones. 5. Intercambiar información sobre semejanzas, diferencias, preferencias y acontecimientos del pasado. 6. Intercambiar información sobre planes, características y experiencias personales.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Lugares 9 0

2 Gente joven 9 0

3 Salud 9 0

4 Recuerdos 9 0

5 Deportes 9 0

6 Reunirse 9 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático

Unidad Temas y subtemas

1

Lugares 1.1 Gramática. 1.1.1 Presente simple y presente progresivo. 1.1.2 There is / there are Hay un (una) hay una (unas). 1.1.3 Repaso de sugerencias. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Frases preposicionales de lugar. 1.2.2 Paisajes naturales. 1.2.3 Adivinar el significado a partir del contexto. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Sonidos/ el alfabeto. 1.4 Comprensión de Lectura. 1.4.1 Leer un folleto turístico. 1.4.2 Leer un sitio web. 1.4.3 Leer un artículo de revista. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Describir el hogar. 1.5.2 Escribir un correo electrónico. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar una entrevista de trabajo. 1.6.2 Escuchar una canción. 1.6.3 Escuchar una conversación. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Describir una ciudad. 1.7.2 Conversar acerca de una canción. 1.7.3 Planear un viaje en nuestro país.

2

Gente joven 2.1 Gramática. 2.1.1 Alguno, alguna, algunos, algunas. 2.1.2 How much?/ how many? (Cuánto, cuántos, cuánta cuantas). 2.1.3 Apóstrofes. 2.1.4 Repaso de pasado simple y there is/there are.

24

2.2 Vocabulario. 2.2.1 Sustantivos contables e incontables. 2.2.2 Collocations (frases idiomáticas). 2.2.3 Deducción de significados. 2.3 Pronunciación. 2.3.1 Acentuación de la palabra. 2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer un folleto. 2.4.2 Leer un artículo de revista. 2.4.3 Leer un anuncio. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Tomar dictado. 2.5.2 Escribir una carta corta. 2.5.3 Escribir un proyecto. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1 Escuchar un programa de radio. 2.6.2 Escuchar una discusión acerca de un concurso. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Describir una foto. 2.7.2 Preguntar a los alumnos acerca de su estilo de vida. 2.7.3 Discutir acerca de beneficencias.

3

Salud 3.1 Gramática. 3.1.1 Imperativo. 3.1.2 Debes / no debes (should/ shouldn’t). 3.1.3 Repaso del imperativo y de debes/ no debes. 3.2 Vocabulario. 3.2.1 El cuerpo. 3.2.2 Enfermedades. 3.3 Pronunciación. 3.3.1 Uso de la acentuación para enfatizar. 3.4 Comprensión de lectura. 3.4.1 Leer un artículo de una revista. 3.4.2 Leer un anuncio de periódico. 3. 5 Expresión escrita. 3.5.1 Escribir un folleto. 3.5.2 Hacer notas. 3.5.3 Escribir a partir de una lectura. 3.6 Comprensión auditiva. 3.6.1 Escuchar una conversación telefónica. 3.6.2 Escuchar acerca de problemas de salud. 3.7 Expresión oral. 3.7.1 Hablar acerca del cuerpo. 3.7.2 Hacer y recibir llamadas telefónicas. 3.7.3 Dar consejos.

4

Recuerdos 4.1 Gramática. 4.2 Vocabulario. 4.3 Pronunciación. 4.4 Comprensión de lectura. 4.5 Expresión escrita. 4.6 Comprensión auditiva.

5

Deportes 5.1 Gramática. 5.2 Vocabulario. 5.3 Pronunciación.

25

5.4 comprensión de lectura. 5.5 Expresión escrita. 5.6 Expresión auditiva. 5.7 Expresión oral.

6

Reunirse 6.1 Gramática. 6.2 Vocabulario. 6.3 Pronunciación. 6.4 Comprensión de lectura. 6.5 Expresión escrita. 6.6 Comprensión auditiva. 6.7 Expresión oral.

Sugerencias didácticas: Exposición oral ( x) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clase (x) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigación ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )

Mecanismos de evaluación del aprendizaje de los alumnos: Exámenes parciales (x) Examen final escrito (x) Trabajos y tareas fuera del aula (x) Exposición de seminarios por los alumnos ( ) Participación en clase (x) Asistencia (x ) Seminario ( ) Otras:


Título o grado Licenciado en Letras Modernas. Licenciado en enseñanza del Inglés. Profesor que acredite cursos de formación docente.

Experiencia docente Mínimo dos años.

Otra característica Profesor egresado del Curso de Formación de Profesores del CELE, haber aprobado el examen de la COELE.

Bibliografía básica: Diccionario bilingüe Inglés-Español, Español-Inglés.

Bibliografía complementaria: Harper, J. (2004). Just grammar. Malasya: Ed. Marshal Cavendish.

26



Unidad León



Bioinformática I

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Principios de Programación


Bioinformática II

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender y utilizar diferentes recursos bioinformáticos que le permitan resolver aquellos problemas más frecuentes en las ciencias genómicas; explorar las bases de datos y herramientas más importantes y de uso más frecuente, así como la información que puede obtener de cada una de ellas y cómo interpretarla; además, estudiar las aplicaciones de la bioinformática, sus métodos, alcances y limitaciones, en distintas áreas de estudio de las ciencias genómicas.

27

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la Bioinformática 6 4

2 Bases de datos 1 (Nucleótidos) 6 4

3 Bases de datos 2 (Proteínas) 6 4

4 Bases de datos 3 6 4

5 Bases de datos 4 6 4

6 Minería de textos y datos 6 4

7 Homología y alineamientos 1 6 4

8 Homología y alineamientos 2 (BLAST) 6 4

9 Homología y alineamientos 3 6 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción a la Bioinformática

2 Bases de datos 1 (Nucleótidos)

2.1 Tipos de Secuencias.

2.2 Formato FASTA .

2.3 Código de letras de secuencias nucleotídicas.

2.4 Bases de datos de nucleótidos.

3 Bases de datos 2 (Proteínas)

3.1 Secuencias de proteínas y código de aminoácidos.

3.2 Secuencias traducidas nucleótidos _ proteínas.

3.3 SWISS Prot y Protein de NCBI.

4 Bases de datos 3

4.1 Búsqueda de bibliografía científica: PubMed, Books, etc.

4.2 Otros recursos de NCBI (Entrez, Gene, OMIM).

4.3 Genome Browsers (NCBI Map View, Ensembl, UCSC Genome

Browser).

5 Bases de datos 4

5.1 The Glycan Structure DB.

5.2 The Lipid Bank.

5.3 Expasy, Brenda.

5.4 KEGG, MetaCyc.

6 Minería de textos y datos

7 Homología y alineamientos 1

7.1 Noción biológica y teórica de homología.

7.2 Conceptos de homología.

7.3 Alineamientos globales y locales.

8 Homología y alineamientos 2 (BLAST)

8.1 Qué es BLAST y cómo interpretar un BLAST (valores de BLAST).

28

8.2 Diferentes tipos de BLAST.

8.3 Otros programas tipo BLAST.

8.4 Bidirectional Best Hit.

9 Homología y alineamientos 3

9.1 Reconstrucción filogenética.

9.2 Alineamientos múltiples.

9.3 Árboles filogenéticos.

9.3.1 Métodos de construcción de árboles filogenéticos.

9.4 Matrices de distancias.

9.5 Análisis de parsimonia y máxima verosimilitud.

9.6 Aplicaciones de la filogenia.












Otra característica Experiencia en investigación

Bibliografía básica: Lesk, A.M. Introduction to Bioinformatics, 2dn Ed., Oxford University Press, 2005. Bulger Brad, Greenspan Jay, Wall David; MySQL/PHP Database Applications; Wiley Publishing USA 2004, 2a edición. • Silberschatz Abraham , Korth Henry F, Sudarshan S.; Database System Concepts; Mc Graw Hill, USA 2005, 5ta Edicion. Bibliografía complementaria: • Codd E.F.; A Relational Model of Data for Large Shared Data Banks; Communications of the ACM, Vol. 13, No. 6, June 1970, pp. 377-387.

29



Unidad León



Botánica y Fisiología Vegetal

Clave

Año 1

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender las características histológicas y morfológicas de las plantas así como los procesos fisiológicos de obtención de materia y energía, los procesos de regulación internos y externos que determinan el crecimiento y el desarrollo de las plantas y sus mecanismos de adaptación.

30

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Grupos taxonómicos de plantas 6 4

2 La célula vegetal 6 4

3 Los tejidos vegetales 6 4

4 Órganos de la planta 6 4

5 Introducción a la fisiología vegetal 6 4

6 Transporte de agua 6 4

7 Fotosíntesis y transporte de electrones en el cloroplasto 6 4

8 Efecto del estrés en la fisiología 6 4

9 Efecto de las hormonas y factores ambientales en la fisiología

6 4

Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Grupos taxonómicos de plantas

1.1 Algas.

1.2 Musgos.

1.3 Helechos.

1.4 Gimnospermas.

1.5 Angiospermas.

1.6 Origen de las plantas.

2 La célula vegetal

2.1 Partes de una célula vegetal.

2.1.1 La membrana y pared celular.

2.2 Diferencias entre célula animal y célula vegetal.

3 Los tejidos vegetales

3.1 Tejidos meristemáticos.

3.2 Tejidos permanentes.

3.3 Tejidos de la superficie.

3.3.1 Epidermis, peridermis.

3.4 Tejidos de soporte, almacenaje y secretores.

3.4.1 Parènquima, colenquina, esclerénquima, tejidos secretores, tejidos de conducción, xilema, floema.

4 Organos de la planta

4.1 Estructuras vegetales.

4.1.1 Raíz, tallo, yemas, hojas.

4.2 Estructuras reproductivas.

4.2.1 Yemas florales, flor e inflorescencia, fruto e inflorescencia, semilla.

5 Introducción a la fisiología vegetal

5.1 Importancia de la fisiología vegetal.

6 Transporte de agua

6.1 Difusión, osmosis.

6.2 Absorción, conducción y perdida de agua por las plantas.

31

6.3 Magnitud de la transpiración.

6.4 Importancia y factores que afectan a la transpiración.

7 Fotosíntesis y transporte de electrones en el cloroplasto

7.1 Fotosíntesis via C3, fotosíntesis via C4.

7.2 Transporte de azucares.

8 Efecto del estrés en la fisiología

8.1 Estrés hídrico.

8.2 Estrés por temperatura.

9 Efecto de las hormonas y factores ambientales en la fisiología

9.1 Efecto de la luz y de las hormonas en el desarrollo.

9.2 Efectos de la contaminación del aire en la fisiología de las plantas.













Bibliografía básica: Stern Kingley R., Jansky S., J:E.B. 2003 Introductory Plants Biology. Ed. Mc. Graw-Hill. 9° Edition Barceló Coll J., Nicolás Rodrigo G., Sabater García B., Sánchez Tamés R. Fisiología vegetal. Ed. Pirámide S.A., Barcelona, 2003. Sitte, P., Weiler, E.W., Kadereit, J.W., Bresindhy A., Kórner, C. Strasburger. Tratado de botánica. 35 Edición. Ediciones Omega, S.A., Barcelona. 2004 Taiz, L., Zeiger, E. Plant Physiology. Sinauer Associates, Inc. Sunderland, MA (USA), 2006

Bibliografía complementaria: Salisbury, F.B y C. W. Rose. 1998. Plant Physiology. Wadsworth Publishing, California.

32



Unidad León



Genética

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender y explicar los conceptos y los principios básicos de genética, empleando estos conceptos para obtener una visión evolutiva de la biología, resolver problemas relacionados y comprender el contexto de las ciencias agrogenómicas.

Índice temático

33

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la genética 4 0

2 Marcadores genéticos 4 4

3 Genética mendeliana 8 4

4 Herencia citoplásmica 4 4

5 Genética parasexual y somática 4 4

6 Genética bacteriana 4 4

7 Citogenética 6 4

8 Recombinación genética y mutación 6 4

9 Genética cuantitativa 6 4

10 Genética de poblaciones 8 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción a la genética

1.1 Conceptos básicos de genética.

1.2 Breve bosquejo histórico.

2 Marcadores genéticos

2.1 Marcadores de DNA empleados en análisis genético.

2.2 Aplicaciones de los marcadores genéticos.

3 Genética mendeliana

3.1 Conceptos básicos de la herencia mendeliana.

3.1.1 Problemas de genética mendeliana.

3.2 Extensiones de genética mendeliana.

3.2.1 Problemas de extensiones de genética mendeliana.

4 Herencia citoplásmica

5 Genética parasexual y somática

6 Genética bacteriana

7 Citogenética

7.1 Variación en el numero cromosómico.

7.2 Variación en el tamaño cromosómico.

7.3 Variación en el arreglo y numero de segmentos cromosómicos.

7.4 Variación en la morfología de los cromosomas.

8 Recombinación genética y mutación

8.1 Mecanismos de recombinación genética

8.2 Mecanismos de mutación.

8.3 Problemas de mutación.

9 Genética cuantitativa

9.1 Rasgos cualitativos versus cuantitativos.

9.2 Rasgos cuasi-cuantitativos.

9.3 La distribución normal.

9.4 Heredabilidad.

9.5 Métodos de selección.

9.6 Métodos de apareamiento.

34

10 Genética de poblaciones

10.1 Constitución genética de las poblaciones.

10.2 Frecuencias génicas.

10.3 Equilibrio de Hardy-Weinberg.

10.4 Equilibrio genético.

10.5 Cruza de dos poblaciones.

10.6 Migración.

10.7. Mutación.

10.8 Selección gamética.

10.9 Selección cigótica.

10.10 Equilibrio mutación-selección.

10.11 Deriva genética.













Bibliografía básica: Griffiths, A.J., et al.; An Introduction to Genetic Analysis; WH Freeman & Col Ltd.; 2007; 9 Rev Ed edition. Brown, T.; Genomes 3; Garland Pub.; 2006; 3rd edition. Pasternak, J.J.; Introduction to Human Molecular Genetics; Wiley-Liss; 2005; 2nd edition.

Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas.

35



Unidad León



Principios de Estadística

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Basica


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Ninguna


Bioestadística

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender los conceptos y principios básicos de la estadística adquiriendo una visión intuitiva de la probabilidad, para después poder aplicar estos conocimientos en el análisis de datos y validar hipótesis mediante herramientas estadísticas.

36

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la estadística 4 0

2 Variables aleatorias discretas 4 0

3 Variables aleatorias continuas 4 0

4 Integrales completas 4 0

5 Integrales múltiples 4 0

6 Herramientas de cálculo diferencial e integral 4 0

7 Distribución de probabilidad multivariable 4 0

8 Probabilidad marginal 4 0

9 Distribuciones muestrales 6 0

10 Estimación 6 0

11 Intervalos de confianza 4 0

12 Propiedades de los estimadores puntuales 4 0

13 Pruebas de hipótesis 4 0

14 Análisis de varianza 6 0

15 Análisis de datos categóricos 4 0

16 Estadísticos no paramétricos 6 0

72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la estadística

2 Variables aleatorias discretas

3 Variables aleatorias continuas

4 Integrales completas

5 Integrales múltiples

6 Herramientas de cálculo diferencial e integral

7 Distribución de probabilidad multivariable

8 Probabilidad marginal

9 Distribuciones muestrales

10 Estimación

11 Intervalos de confianza

12 Propiedades de los estimadores puntuales

13 Pruebas de hipótesis

14 Análisis de varianza

15 Análisis de datos categóricos

16 Estadísticos no paramétricos





37






Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Estadística o áreas afines



Bibliografía básica: • D. D. Wackerly, W. MendelHall III & R. L. Scheaffer; Estadística matemática con aplicaciones; Thomson; 2002; Sexta edición. • R. G. D. Steel & J. H. Torrie; Principles and Procedures of Statistics. A Biometrical Approach; McGraw Hill; 1980; Segunda Edición. • S. Lipschutz & M. Lipson; Probabilidad; McGraw Hill; 2001; Segunda Edición. • M. R. Spiegel; Estadística; McGraw Hill; 1996. • R. I. Levin & D. S. Rubin; Estadística; Prentice Hall; 1996; Sexta edición. Bibliografía complementaria: • Artículos de revistas científicas relacionados con los temas correspondientes

38



Unidad León



Matemáticas II

Clave

Año 1

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Matemáticas I


Matemáticas III

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender la teoría y los conceptos respecto de los espacios vectoriales como una estructura básica en matemáticas y con múltiples aplicaciones, tales como el estudio de ecuaciones diferenciales, que se usan frecuentemente para realizar modelos en ciencias genómicas.

Índice temático

Unidad Tema Horas

39


1 Espacios vectoriales 14 0

2 Matrices y transformaciones lineales 16 0

3 Operaciones elementales y sistemas de ecuaciones lineales 14 0

4 Determinantes 14 0

5 Diagonalización 14 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Espacios vectoriales

1.1 Vectores en R2 y R3 como motivación geométrica.

1.2 Definición y ejemplos de espacio vectorial sobre R.

1.3 Definición de campo y de espacio vectorial en general.

1.4 Subespacios.

1.5 Combinaciones lineales y sistemas de ecuaciones lineales.

1.6 Dependencia e independencia lineal.

2 Matrices y transformaciones lineales

2.1 Definición y ejemplos de transformación lineal.

2.2 Núcleo e imagen de una transformación lineal. Teorema de la

dimensión.

2.3 Representación matricial de una transformación lineal.

2.4 Composición de transformaciones lineales y multiplicación de

matrices.

2.5 Un ejemplo: matrices de incidencia.

2.6 Invertibilidad e isomorfismo.

2.7 Matriz de cambio de coordenadas.

3 Operaciones elementales y sistemas de ecuaciones lineales

3.1 Matrices elementales y operaciones elementales.

3.2 Rango de una matriz y matrices inversas.

3.3 Sistemas de ecuaciones lineales.

4 Determinantes

4.1 Determinantes de órden 2.

4.2 Determinantes de órden n.

4.3 Propiedades de los determinantes.

5 Diagonalización

5.1 Vectores y valores propios.

5.2 Diagonalización.









40


Título o grado Licenciado(a) o Maestro(a) en Matemáticas o áreas afines



Bibliografía básica: S. Friedberg, A. J. Insel, L. E. Spence; Linear Algebra; Prentice Hall; 3ra edición.


41



Unidad León



Inglés

Clave

Año 1

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Inglés


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje, y como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área. Objetivos específicos: 1. Intercambiar información sobre los medios de comunicación y comparar opiniones. 2. Intercambiar información sobre planes a futuro, el medio ambiente, comida y compras.

42

3. Intercambiar información sobre experiencias de viajes, del pasado y valores de vida. 4. Hablar sobre cualidades y experiencias de vida. 5. Describir personas. 6. Intercambiar información sobre reglamentos.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Medios de comunicación 9 0

2 Nuestro cambiante mundo 9 0

3 Experiencias 9 0

4 Rico y famoso 9 0

5 Gente en nuestra vida 9 0

6 Reglas y reglamentos 9 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático


1

Medios de comunicación 1.1 Gramática. 1.1.1 Gustos, preferencias y deseos. 1.1.2 Much/ many, not enough. 1.1.3 Repaso de gustos, preferencias, going to, will. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Medios. 1.2.2 Programas de radio y televisión. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Cambio de acentuación. 1.4 Comprensión de lectura. 1.4.1 Leer un artículo de periódico. 1.4.2 Leer una guía de televisión. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Escribir acerca de le televisión. 1.5.2 Escribir de una guía de televisión. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar opiniones de la gente. 1.6.2 Escuchar un análisis de de un anuncio. 1.6.3 Escuchar una conversación acerca de la televisión. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Conversar acerca de los medios. 1.7.2 Comparar opiniones. 1.7.3 Planear un anuncio.

2

Nuestro cambiante mundo 2.1 Gramática. 2.1.1 Will + probablemente, definitivamente, posiblemente. 2.1.2 Preposiciones de lugar. 2.1.3 Repaso de gustos y preferencias. 2.2 Vocabulario. 2.2.1 El medio ambiente. 2.2.2 Lugares.

43

2.3 Pronunciación. 2.3.1 Acentuación de las oraciones y contracciones. 2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer un artículo del periódico. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Escribir un texto. 2.5.2 Hacer notas. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1 Escuchar una presentación. 2.6.2 Escuchar una canción. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Actuar en una toma de decisiones a futuro. 2.7.2 Conversar acerca de comida. 2.8 Conversar acerca de las compras y elección de regalos.

3

Experiencias 3.1 Gramática. 3.2 Presente perfecto. 3.2.1 Pasado participio regular e irregular. 3.2.2 Todavía y aún no (still/ yet). 3.2.3 Repaso: posibilidades futuras. 3.3 Vocabulario. 3.3.1 Países. 3.3.2 Colocaciones del verbo y del sustantivo. 3.4 Pronunciación. 3.4.1 Acentuación de la sílaba. 3.5 Comprensión de lectura. 3.5.1 Leer correos electrónicos. 3.5.2 Leer entrevistas. 3.6 Expresión escrita. 3.6.1 Escribir acerca de experiencias de viaje. 3.6.2 Escribir acerca de experiencias pasadas. 3.7 Comprensión auditiva. 3.7.1 Escuchar una conversación telefónica. 3.7.2 Escuchar descripciones de experiencias. 3.8 Expresión oral. 3.8.1 Conversar acerca de experiencias de viaje. 3.8.2 Conversar acerca de valores de vida. 3.9 Simular una entrevista.

4

Rico y famoso 4.1 Gramática. 4.1.1 Presente perfecto+ por y desde. 4.1.2 Repaso de pasado simple y adjetivos. 4.2 Vocabulario. 4.2.1 Adjetivos compuestos con bien. 4.2.2 Eventos en la vida. 4.3 Pronunciación. 4.3.1 Palabras sin acentuar y conectores. 4.3.2 Adjetivos compuestos. 4.4 Comprensión de lectura. 4.4.1 Leer una biografía. 4.4.2 Leer historias de vida. 4.5 Expresión escrita. 4.5.1 Escribir un reporte. 4.5.2 Escribir una biografía. 4.5.3 Escribir un perfil. 4.6 Comprensión auditiva.

44

4.6.1 Escuchar entrevistas acera del trabajo. 4.7 Expresión oral. 4.7.1 Escuchar un programa de radio.

5

Gente en nuestra vida 5.1 Gramática. 5.1.1 Adverbios de manera. 5.1.2 Ser y parecer. 5.1.3 Preguntas indirectas. 5.1.4 Repaso de presente perfecto y descripciones. 5.2 Vocabulario. 5.2.1 Adjetivos de apariencia y de carácter. 5.2.2 Frases idiomáticas. 5.3 Pronunciación. 5.3.1 Acentuación de la oración. 5.4 Comprensión de lectura. 5.4.1 Lectura de perfiles personales. 5.4.2 Lectura de un anuncio de una persona extraviada. 5.5 Expresión escrita. 5.5.1 Escritura de un correo electrónico. 5.5.2 Descripción de una persona. 5.5.3 Escritura de un anuncio de una persona extraviada. 5.6 Comprensión auditiva. 5.6.1 Escuchar una conversación. 5.6.2 Escuchar la descripción de una persona. 5.6.3 Escuchar una canción. 5.7 Expresión oral. 5.7.1 Jugar un juego de mímica. 5.7.2 Describir personas. 5.7.3 Preguntar y responder preguntas. 5.7.4 Descripción de personas.

6

Reglas y reglamentos 6.1 Gramática. 6.1.1 Permisos y prohibiciones. 6.1.2 Obligaciones. 6.1.3 Obligaciones, permisos y prohibiciones. 6.2 Vocabulario. 6.2.1 Actividades. 6.2.2 Tareas con make y do. 6.3 Pronunciación. 6.3.1 Acentuación en la oración. 6.4 Comprensión de lectura. 6.4.1 Leer una nota del periódico y de un correo electrónico. 6.5 Expresión escrita. 6.5.1 Tomar dictado. 6.5.2 Completar un texto. 6.6 Comprensión auditiva. 6.6.1 Escuchar una entrevista. 6.6.2 Escuchar señalamientos de tránsito. 6.7 Expresión oral. 6.7.1 Conversar acerca de posibles prohibiciones. 6.7.2 Conducir una entrevista de trabajo. 6.7.3 Hacer sugerencias. 6.8 Dar opiniones.

45

Sugerencias didácticas: Exposición oral ( x) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clas (x) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigación ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )








46

SEGUNDO AÑO

47



Unidad León



Bioinformática II

Clave

Año 2

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P (X)


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Bioinformática I


Ninguna

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender a detalle y profundidad los principales algoritmos utilizados en las ciencias genómicas para el análisis de secuencias, análisis de moléculas y análisis de datos masivos.

Índice temático

Unidad Tema Horas

48


1 Anotación de genomas de procariontes y eucariontes 8 4

2 Análisis y conservación de secuencias 6 4

3 Modelado de macromoléculas 6 4

4 Recursos de genómica funcional 6 4

5 Técnicas de secuenciación de genomas y transcriptomas 6 4

6 Análisis computacional de genomas y transcriptomas por métodos de última generación

6 6

7 Ensamblado de secuencias y alineamiento de genomas 8 6

8 Sistema operativo tipo Linux 8 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Anotación de genomas de procariontes y eucariontes

1.1. Detección y modelado de genes.

1.2. Características de los genes procariontes y eucariontes.

1.3. Métodos de predicción de secuencias génicas.

1.4. Métodos basados en comparación de secuencias, en análisis de motivos o en características físicas.

1.5. Algoritmos para la identificación de genes en genomas completos o parciales.

2 Análisis y conservación de secuencias

2.1. Búsqueda de patrones de proteínas y en secuencias de ácidos nucleicos.

2.2. Sintenías.

2.3. Motivos.

3 Modelado de macromoléculas

3.1. Algoritmos de predicción de estructura secundaria de RNAs.

3.2. Predicción y modelado de estructuras tridimensionales de proteínas.

3.3. Métodos experimentales de obtención de estructuras de macromoléculas biológicas.

3.4. Visualización.

3.5. Métodos ab initio.

3.6. Predicción de características 1D.

3.7. Predicción de estructura 3D mediante modelado por homología y reconocimiento de plegamiento.

3.8. Sistemas automáticos de predicción.

3.9. Relaciones estructura-actividad.

3.10. Predicción de interacciones proteína-sustrato y proteína-proteína.

3.11. Docking in silico.

4 Recursos de genómica funcional

4.1. Análisis de microarreglos.

4.2. Normalización de datos.

4.3. Selección de genes relevantes.

4.4. Agrupamiento de perfiles de expresión.

4.5. Algoritmos de análisis de resultados de microarreglos.

4.6. Proteómica.

4.7. RNA-seq.

4.8. ChIP-seq.

49

5 Técnicas de secuenciación de genomas y transcriptomas

6 Análisis computacional de genomas y transcriptomas por métodos de última generación

7 Ensamblado de secuencias y alineamiento de genomas

8 Sistema operativo tipo Linux.

8.1. Scripts de Shell

8.2. Programación en Perl.

8.3. Los elementos básicos de la programación en PERL.

8.4. Diseño de scripts para resolver problemas en bioinformática.

8.5. Bioperl.













Bibliografía básica: Mount, D. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. CSHL Press, 2004. Jonathan Pevsner, Bioinformatics and Functional Genomics, First edition, 2003; Publisher: Wiley, John & Sons; ISBN: 0471210048 Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas.

50



Unidad León



Metabolismo Secundario

Clave

Año 2

Créditos 8

Área


Biotecnología

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso (X) Taller (X ) Lab ( ) Sem ( )

Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender los aspectos fundamentales sobre los principales metabolitos secundarios de las plantas, la función que desempeñan en las plantas y los principales usos que tienen en biotecnología.

Índice temático

51

Unidad Tema Horas


1 Introducción al metabolismo secundario 12 8

2 La diversidad de metabolismo secundario. 14 8

3 Producción de metabolitos secundarios en cultivos in vitro 14 10

4 Principios y aplicaciones de la ingeniería metabólica en plantas

14 10

Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción al metabolismo secundario

1.1. Metabolismo primario y secundario.

1.2. Funciones y aplicaciones de los metabolitos secundarios.

1.3. Principales rutas biosintéticas: relación con el metabolismo primario.

2 La diversidad de metabolismo secundario

2.1. Terpenos.

2.1. Fenoles.

2.3. Alcaloides.

2.4. Otros metabolitos secundarios.

3 Producción de metabolitos secundarios en cultivos in vitro

3.1. Callos y células en suspensión.

3.2. Cultivo de raíces.

3.3. Cultivo de brotes.

4 Principios y aplicaciones de la ingeniería metabólica en plantas

4.1. Principios básicos de la ingeniería metabólica.

4.2. Ejemplos de aplicaciones de la ingeniería metabólica.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Bioquímica o áreas afines



Bibliografía básica: SEIGLER, D.S. 1998. Plant Secondary Metabolism. Kluwer Academic Publishers, Norwell, USA.

52

Hartmann, Thomas. "From waste products to ecochemicals: fifty years research of plant secondary metabolism." Phytochemistry 68.22-24 (2007): 2831-2846. Web. 31 Mar 2011. Bibliografía complementaria: Makkar, H.P.S.; et al. (2007) Plant Secondary Metabolites, Methods in Molecular Biology. Humana Press; 1 edition, ISBN-10: 1588299937.

53



Unidad León



Agroecología y Sustentabilidad

Clave

Año 2

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso (X) Taller ( ) Lab ( ) Sem ( )

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender los principios fundamentales de la agroecología y la sustentabilidad y su articulación con las nuevas necesidades sociales, económicas y tecnológicas.

Índice temático

Unidad Tema Horas

54


1 Introducción a la agroecología y sustentabilidad 8 0

2 Bases ecológicas y agronómicas de la agroecología 12 0

3 Metodologías agroecológicas y técnicas agrícolas sustentables

12 0

4 Diseño y evaluación de sistemas sustentables 10 0

5 Biodiversidad ecológica y sociocultural 10 0

6 Sistemas agroalimentarios sustentables 10 0

7 Desarrollo rural sustentable 10 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la agroecología y sustentabilidad

1.1. Principios y conceptos de la agroecología.

1.2. Principios y conceptos de la agricultura sostenible.

1.3. Principios y conceptos del desarrollo rural sostenible.

1.4. Principios y conceptos del ecodesarrollo y economía ecológica.

1.5. Problemática de los recursos naturales: agua/suelo bosque y biodiversidad.

2 Bases ecológicas y agronómicas de la agroecología

2.1. Estructura y funciones de los agroecosistemas.

2.2. Ciclos de nutrientes y flujos de energía.

2.3. Introducción a la biodiversidad vegetal y al manejo de plagas.

2.4. Ecología del paisaje.

2.5. Manejo del suelo, calidad edáfica y sanidad vegetal.

2.6. Diseño de tecnologías que incrementen la sustentabilidad de los agroecosistemas.

3 Metodologías agroecológicas y técnicas agrícolas sustentables

3.1. Principales metodologías para el análisis de sistemas agrarios.

3.2. Metodologías para el estudio de la biodiversidad.

3.3. Manejo integrado y agroecológico de plagas.

3.4. El balance socioeconómico en los procesos de producción agrarios.

3.5. El balance energético en los procesos de producción agrarios.

3.6. Valoración de la sustentabilidad agraria.

3.7. Perspectivas de investigación en Agroecología.

4 Diseño y evaluación de sistemas sustentables

4.1. El Concepto de sustentabilidad en los sistemas agrícolas y forestales y en los procesos de producción.

4.2. Bases para el análisis y diseño de sistemas agroecológicos sustentables.

4.3. Manejo de programas para simular situaciones de manejo de tecnología.

5 Biodiversidad ecológica y sociocultural

5.1. Conceptos y tipos de biodiversidad.

5.2. Biodiversidad ecológica y sociocultural.

6 Sistemas agroalimentarios sustentables

6.1. El sistema agroalimentario en la globalización.

6.2. La regulación del sistema agroalimentario.

6.3. Nuevos modos de organización de la provisión agroalimentaria.

6.4. Estudio de casos.

55

7 Desarrollo rural sustentable

7.1. Conceptos básicos de desarrollo y su aplicación a la agricultura y a las sociedades rurales.

7.2. La agroecología como desarrollo rural sustentable.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Biología, Sustentabilidad, Desarrollo Rural o áreas afines



Bibliografía básica: Agroecología: El camino hacia una agricultura sustentable. México: PNUMA - Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente, 2000. Agroecología: principios y estrategias para diseñar sistemas agrarios sustentables. In: Ediciones Científicas Americanas. México, 2001. TOLEDO, Victor. La Revolución agroecológica en América Latina. SOCLA, 2011. McCormick F. 1998. Principles of Ecosystem Management and Sustainable Development. En: Peine J. (Ed). Ecosystem Management for Sustainability. Lewis Publishers. N.Y. Frankllin J. F. 1997. Ecosystem Management: An overview. En: Boyse M. Y Haney A. Ecosystem Management. Aplications for sustainable Forest and Wildlife Resources. Yale University. Bibliografía complementaria: HERNÁNDEZ, Jaime Morales (Coord.). La agroecologia en la construcción de alternativas hacia la sustentabilidad rural. México: Siglo XXI Editores / Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Occidente, 2011. Sukopp, H. Y Werner, P. 1983. Urban environment and vegetation. In: Holzner, W., Werger, M.J.A. & Ikusima, I. (eds.) Man's Impact on Vegetation, pp. 247-260.

56



Unidad León



Bioestadística

Clave

Año 2

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico

Modalidad


Tipo T () P ( ) T/P ( X )


Horas

Duración: 18 semanas Semana Total



Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Principios de Estadística


Ninguna

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender y aplicar las diversas metodologías y técnicas aplicadas en la conceptualización de un sistema, siendo capaz de modelar un sistema usando ontologías o modelos de esquemas de datos (ER). Además, aprender a manejar una base de datos relacional y realizar la construcción de una interfaz Web que permita

57

consultar, agregar y desplegar información de los datos contenidos en una base de datos con contenido biológico, y utilizar el lenguaje R para análisis estadístico de colecciones de datos.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Modelos probabilísticos 10 6

2 Modelos de ontologías. 10 6

3 Modelo de esquema de datos 10 6

4 SQL estándar 8 6

5 PHP 8 4

6 Introducción a lenguaje de estadística R 8 8 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Modelos probabilísticos

1.1. Teoría de la probabilidad.

1.2. Modelos de cadenas de Markov.

1.3. Cadenas de Markov en la detección de motivos de DNA.

1.4. HMMs, aplicaciones.

2 Modelos de ontologías.

2.1 OPL (Ontology Processing Language).

2.2 ODPs (Ontology Design Patterns).

3 Modelo de esquema de datos

3.1 Entidad relación.

3.2 Ejemplos: GO, BioPAX.

4 SQL estándar

4.1 Álgebra relacional.

4.2 Lenguajes de definición y manipulación de datos (SQL).

5 PHP

6 Introducción a lenguaje de estadística R

6.1 Prólogo.

6.2 Conceptos.

6.3 Manejando datos con R.

6.4 Gráficas con R.

6.5 Análisis estadísticos con R.

6.6 Bioconductor.







58




Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Estadística, Bioinformática o áreas afines



Bibliografía básica: R web page : http://www.r-project.org/

Bulger Brad, Greenspan Jay, Wall David; MySQL/PHP Database Applications; Wiley Publishing USA 2004, 2a edición. Silberschatz Abraham , Korth Henry F, Sudarshan S.; Database System Concepts; Mc Graw Hill, USA 2005, 5ta Edicion Bibliografía complementaria: http://www.mailxmail.com/curso/informatica/disenobasesdatosrelacionales/capitulo2.htm http://es.wikipedia.org/wiki/Base_de_datos http://mysql.com http://www.webestilo.com/mysql/intro.phtml http://mysql.conclase.net/curso/

59

59


Escuela Nacional de Estudios Superiores Unidad León

Plan de estudios de la

Licenciatura en Ciencias Agrogenómicas


Matemáticas III

Clave

Año 2

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Matemáticas II


Matemáticas IV

Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender la teoría y las aplicaciones prácticas del cálculo diferencial e integral y del planteamiento, resolución y propiedades de las soluciones de las ecuaciones diferenciales.

60

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Markov 6 0

2 Campos y funciones 8 0

3 Ecuaciones parametrizadas 6 0

4 Derivación 14 0

5 Polinomios de Taylor y series de potencias 8 0

6 Integración 8 0

7 Cálculo de más variables 8 0

8 Ecuaciones diferenciales 14 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Markov

1.1 Matrices de transición

1.2 Cadenas de Markov.

1.3 Estados accesibles, recurrentes, transitorios, absorbentes y estables.

1.4 Estadística bayesiana.

1.5 Modelos ocultos de Markov (Hidden Markov Models).

2 Campos y funciones

1.1 Identidades trigonométricas, números complejos y fórmula de Euler.

3 Ecuaciones parametrizadas

4 Derivación

2.1 Derivada implícita.

2.2 Derivadas con logaritmos.

2.3 Problemas con derivadas.

2.4 Estimador de máxima verosimilitud.

2.5 Mínimos cuadrados y correlación.

5 Polinomios de Taylor y series de potencias

6 Integración

4.1 Problemas con integrales.

4.2 Sustitución trigonométrica.

4.3 Fracciones racionales.

7 Cálculo de más variables

7.1 Derivadas parciales.

7.2 Máximos, mínimos y puntos silla.

8 Ecuaciones diferenciales

5.1 Separación de variables.

5.2 Variación de parámetros con factor integrante.

5.3 Ecuaciones exactas.

5.4 Ecuaciones exactas con factores integrantes.



61








Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Matemáticas o áreas afines



Bibliografía básica: J. Stewart; Cálculo diferencial e integral; International Thomson Editores; 1998. R. Greenwell, N. Ritchey & M. Lial; Calculus for the Life Sciences; Addison-Wesley; 2003. W. A. Granville, P. F. Smith & W. R. Longley; Cálculo diferencial e integral; Limusa; 2007. C. Bosch-Giral, M. Guerra Tejada, C. Hernández García Diego, E. Oteyza de Oteyza; Cálculo diferencial e integral; Publicaciones Culturales; 1991. Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas.

62



Unidad León



Inglés

Clave

Año 2

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Inglés


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje y, como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área. Objetivos específicos: 1. Describir acciones que se llevan a cabo al momento de estar hablando. Hábitos, rutinas.

63

2. Intercambiar información sobre celebraciones, tradiciones y costumbres de un lugar. 3. Intercambiar información sobre el inglés y su mundo, intercambios estudiantiles e idiomas. 4. Intercambiar información sobre hábitos alimenticios, problemas, aprendizaje. 5. Intercambiar información sobre noticias, hablar sobre preferencias, aptitudes y cosas importantes en la vida. 6. Intercambiar información sobre cómo las personas cambian, personajes famosos y la paternidad.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Gente 9 0

2 Cultura 9 0

3 Idiomas 9 0

4 Hábitos 9 0

5 Generaciones 9 0

6 Cambios 9 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático


1 Gente 1.1 Gramática. 1.1.1 Presente simple y presente progresivo. 1.1.2 Pronombres reflexivos y recíprocos. 1.1.3 Ambos y ninguno. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Colocaciones comunes. 1.2.2 Verbos seguidos por reflexivos. 1.2.3 Características. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Énfasis en la palabra. 1.4 Comprensión de lectura. 1.4.1 Leer comentarios personales. 1.4.2 Leer un cuestionario. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Escribir un texto acerca de una persona. 1.5.2 Escribir un cuestionario. 1.5.3 Escribir opiniones. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar una conversación. 1.6.2 Escuchar una entrevista de radio. 1.6.3 Escuchar una discusión. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Dar información acerca de otras personas. 1.7.2 Conversar acerca de los hermanos mellizos. 1.7.3 Conversar acerca de costumbres culturales. 1.7.4 Conversar acerca de características de otras personas.

2 Cultura 2.1 Gramática. 2.1.1 Pasado simple y pasado progresivo.

64

2.1.2 Acciones del pasado y hábitos. 2.1.3 Expresiones de tiempo. 2.1.4 Repaso de presente simple. 2.2 Vocabulario. 2.2.1 Collocations (frases idiomáticas). 2.2.2 Juegos de la infancia. 2.3 Pronunciación. 2.3.1 Acentuación de la oración. 2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer la descripción de un evento. 2.4.2 Leer una encuesta. 2.4.3 Leer un diálogo. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Escribir acerca de un evento o festival. 2.5.2 Escribir acerca de una tradición familiar. 2.5.3 Escribir un pequeño diálogo. 2.5.4 Escribir un folleto. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1Escuchar la descripción de un evento. 2.6.2 Escuchar la descripción de una celebración. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Conversar acerca de festividades. 2.7.2 Conversar acerca de viejos hábitos y tradiciones. 2.7.3 Discutir acerca de ciertas costumbres nacionales.

3

Idiomas 3.1 Gramática. 3.1.1 Formulación de preguntas. 3.1.2 Tag questions. 3.1.3 Preguntas indirectas. 3.1.4 Repaso de pasado simple y solía. 3.2 Vocabulario. 3.2.1 Tipos de lengua. 3.2.2 Tipos de comunicación. 3.3 Pronunciación. 3.3.1 Entonación ascendente y descendente. 3.4 Comprensión de lectura. 3.4.1 Leer un poema. 3.4.2 Leer una carta. 3.5 Expresión escrita. 3.5.1 Escribir una carta. 3.5.2 Escribir un resumen. 3.6 Comprensión auditiva. 3.6.1 Escuchar un poema. 3.6.2 Escuchar una conversación. 3.7 Expresión oral. 3.7.1 Conversar acerca del inglés que se habla en el mundo. 3.7.2 Mantener una conversación. 3.7.3 Conversar acerca de vivir un intercambio estudiantil. 3.7.4 Conversar acerca de los idiomas en el mundo.

4

Hábitos 4.1 Gramática. 4.1.1 Primer condicional. 4.1.2 Posibilidades futuras. 4.1.3 Sustitutos de if. 4.1.4 Preguntas indirectas. 4.2 Vocabulario.

65

4.2.1 Verbos de dos palabras. 4.2.2 Homónimos. 4.3 Pronunciación. 4.3.1 Entonación en condicional. 4.4 Comprensión de lectura. 4.4.1 Leer un artículo de una revista. 4.5 Expresión escrita. 4.5.1 Escribir acerca de aprender inglés. 4.6 Comprensión auditiva. 4.6.1 Escuchar una conversación. 4.7 Expresión oral. 4.7.1 Dar un consejo. 4.7.2 Escuchar una entrevista de radio.

5

Generaciones 5.1 Gramática. 5.1.1 Modales para expresar. Deducción presente. 5.1.2 Intensificadores y cuantificadores. 5.1.3 Repaso de primer condicional y posibilidad futura. 5.2 Vocabulario. 5.2.1 Verbos de dos palabras. 5.2.2 Frases acerca de estilo de vida. 5.3 Pronunciación. 5.3.1 Reacciones empáticas. 5.4 Comprensión de lectura. 5.4.1 Leer un artículo de un periódico. 5.4.2 Leer un anuncio de revista. 5.5 Expresión escrita. 5.5.1 Hacer una encuesta. 5.5.2 Escribir un anuncio. 5.6 Comprensión auditiva. 5.6.1 Escuchar una conversación. 5.7 Expresión oral. 5.7.1 Hacer deducciones acerca de la demás gente. 5.7.2 Conversar acerca de preferencias y aptitudes.

6

Cambios 6.1 Gramática. 6.1.1 Presente perfecto para expresar cambios. 6.1.2 Presente perfecto simple y progresivo. 6.1.3 Duración. 6.1.4 Repaso de modales de deducción. 6.2 Vocabulario. 6.2.1 Apariencia. 6.2.2 Verbos de dos palabras. 6.3 Pronunciación. 6.3.1 Formas suaves. 6.4 Comprensión de lectura. 6.4.1 Leer una página electrónica. 6.4.2 Leer un artículo de periódico. 6.5 Expresión escrita. 6.5.1 Escribir una descripción de cambios que se presentan en la vida. 6.6 Comprensión auditiva. 6.6.1 Escuchar una canción. 6.7 Expresión oral. 6.7.1 Conversar acerca de cuánto ha cambiado la gente. 6.7.2 Conversar acerca de los padres.

66

Sugerencias didácticas: Exposición oral ( x) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clase (x) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigaci ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )








67



Unidad León



Genómica Funcional

Clave

Año 2

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Adquirir los conocimientos sobre los principios básicos del análisis genómico estructural y funcional, así como de los procesos fundamentales de replicación, transcripción y traducción en organismos procariontes y eucariontes.

Índice temático

68

Unidad Tema Horas


1 Introducción. Genes y genomas. 8 4

2 Relación estructura-función del genoma 10 6

3 Análisis genómico 8 6

4 Análisis tradicional de la función de genes 8 6

5 Técnicas masivas de estudio utilizadas en genómica funcional

10 8

6 Análisis funcional de genomas completos 10 6

54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción. Genes y genomas

1.1 Estructura y organización de los genes y los genomas.

1.2 Tamaño de los genomas.

1.3 Complejidad de secuencias genómicas.

1.4 Genomas de virus y procariontes.

1.5 Organización de genomas eucariontes.

2 Relación estructura-función del genoma

2.1 Sistemas de replicación en procariontes y eucariontes.

2.2 Transcripción en procariontes y eucariontes.

2.3 Traducción.

3 Análisis genómico

3.1 Fragmentación de genomas.

3.2 Separación de fragmentos largos de ADN.

3.3 Aislamiento de cromosomas.

3.4 Hibridación in situ.

3.5 Genotecas.

3.6 Vectores: YACs, BACs y PACs.

3.7 Mapas físicos y mapas genéticos.

3.8 Marcadores.

3.9 Estrategias de secuenciación genómica.

3.9.1 Modificaciones del método de Sanger.

3.9.2 Pirosecuenciación y otros métodos de secuenciación masiva.

4 Análisis tradicional de la función de genes

4.1 Técnicas de estudio de la expresión de genes particulares.

4.1.1 Northern blot, RT-PCR, qRT-PCR, hibridación in situ, inmunohistoquímica e inmunofluorescencia.

4.2 Técnicas de estudio de la función génica.

4.2.1 Transformación de células y organismos completos.

4.2.2 Organismos quiméricos, inactivación génica dirigida (organismos knock-out, knock-down y RNAi).

5 Técnicas masivas de estudio utilizadas en genómica funcional

5.1 Microarreglos.

5.2 Secuenciación masiva.

5.3 RNA-Seq.

69

5.4 Proteomica.

5.5 Procesamiento de datos, Expresión diferencial.

6 Análisis funcional de genomas completos.

6.1 Términos funcionales.

6.2 Análisis de ontologías y descubrimiento de función biológica.













Bibliografía básica: Pevsner, J. 2003. Bioinformatics and Functional Genomics. John Wiley & Sons, Inc. Lewin, B. 2008. Genes IX. McGraw-Hill/Interamericana. Brown, T. A.; Genomes; Garland Sciences Publishing; 2007; 3rd edition.

Bibliografía complementaria: Lodish et al.; Molecular Cell Biology; W. H. Freeman and Company; 2004; 5th edition. Hartl, D.L. and Jones, E.W. (2009) Genetics. Analysis of genes and genomes. 7ª edición. Jones & Bartlett Pub., USA. Artículos originales de revistas científicas.

70



Unidad León



Bioética, Bioseguridad y Legislación

Clave

Año 2

Créditos 8

Área


Biotecnología

Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender y analizar los conceptos y los fundamentos de bioética, bioseguridad y legislación y la relación que tienen con las ciencias agrogenómicas, así como la importancia de reconocer el impacto que estas tendrán en la vida cotidiana.

Índice temático

71

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la bioética, bioseguridad y legislación en biotecnología

8 0

2 Principios teóricos de bioética 16 0

3 Temas selectos de bioética y bioseguridad 16 0

4 Asuntos éticos, legales y sociales 16 0

5 La bioseguridad en México y los organismos genéticamente modificados

16 0

Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la bioética, bioseguridad y legislación en biotecnología

2 Principios teóricos de bioética

2.1 Teorías éticas.

2.1.1 Utilitarismo.

2.1.2 Kantianismo.

2.1.3 Principialismo.

2.1.4 Ética ambiental.

2.1.5 Teoría de derechos.

2.2 Principios bioéticos.

2.2.1 Principio de autonomía.

2.2.2 Principio de beneficencia.

2.2.3 Principio de justicia.

3 Temas selectos de bioética y bioseguridad

3.1 Ética en la investigación biotecnológica.

3.2 Bioterrorismo.

4 Asuntos éticos, legales y sociales

4.1 Introducción.

4.2 Uso apropiado de la información genética.

4.3 Privacía y confidencialidad.

4.4 Asuntos ambientales y saludables.

4.5 Productos de comercialización.

4.6 Genética en los juzgados.

5 La bioseguridad en México y los organismos genéticamente modificados

5.1. Desarrollo de productos de la biotecnología.

5.2 Nuevas aplicaciones en cultivos transgénicos.

5.3 Legislación y normatividad nacional.

5.3.1. Ley federal sobre metrología y normalización.

5.3.2. Ley de bioseguridad de los organismos genéticamente modificados.

5.3.3. Reglamento de la ley de bioseguridad de organismos genéticamente modificados.

5.4 Instrumentos internacionales.

5.4.1. Protocolo de Cartagena sobre seguridad de la biotecnología.

72










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Bioética, Biotecnología, Filosofía, Derecho o áreas afines



Bibliografía básica: Bioseguridad en la aplicación de la biotecnología y el uso de los organismos genéticamente modificados. CIBIOGEM. Primera edición, 2008. ISBN 978-968-823-286-6 Cahn S. and Markie P. 2011. Ethics: History, Theory, and Contemporary Issues, 5th Edition. ISBN: 978-0199797264 Bibliografía complementaria: Gupta, A. 2000. Governing trade in genetically modified organisms - The Cartagena Protocol on Biosafety. Environment 42: 22-33. Tannsjo, S. 2009. Understanding ethics: An Introduction to Moral Theory. Edinburgh University Press; 2nd edition. ISBN-13: 978-0748636907 .

73



Unidad León



Genómica de la Conservación

Clave

Año 2

Créditos 8

Área


Genómica y Bioinformatica

Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Profundizar en los conceptos principales de genómica de la conservación y explorar los avances más recientes en el desarrollo de herramientas genómicas y su potencial aplicación en la conservación de poblaciones y especies.

Índice temático

Unidad Tema Horas

74


1 Introducción a la genómica de la conservación 12 0

2 Importancia de la diversidad genética adaptativa 12 0

3 Herramientas genómicas y su aplicación en genética de la conservación

16 0

4 Manejo de herramientas genómicas y bases de datos en genómica de la conservación

16 0

5 Aplicaciones de la genómica de la conservación 16 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la genómica de la conservación

2 Importancia de la diversidad genética adaptativa

2.1. Métodos tradicionales para medir la diversidad genética adaptativa.

3 Herramientas genómicas y su aplicación en genética de la conservación

3.1. Métodos de secuenciación masiva de genomas completos.

3.2. Transcriptomica y predicción de genes.

3.3. De la transcripcion masiva a los marcadores moleculares.

3.4. Mapeo genético en genomas completos y marcadores moleculares.

3.5. Análisis de SNPs.

3.6. Análisis del control genético de caracteres adaptativos complejos.

3.7. Mapeo de genes adaptativos.

3.8. Mapeo comparativo de genes adaptativos.

4 Manejo de herramientas genómicas y bases de datos en genómica de la conservación

5 Aplicaciones de la genómica de la conservación

5.1. Ejemplos de estudios.



Trabajo en equipo ( X ) Examen final ( X ) Lecturas ( X ) Trabajos y tareas ( X )






Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Ecología, Biotecnología o áreas afines



75

Bibliografía básica: Ouborg, N.; et al; (2005) "Conservation genetics in transition to conservation genomics" Trends in Genetics. Volume 26, Issue 4, April 2010, Pages 177–187. Primmer, CR. (2009) "From Conservation Genetics to Conservation Genomics". Annals of the New York Academy of Sciences, 1162: 357–368. doi: 10.1111/j.1749-6632.2009.04444.x Engels J.M.M. , Ramanatha Rao V. , Brown A.H.D. and Jackson M.T. (2002). Managing Plant Genetic Diversity. International. Wallingford, UK Vij S.P. , Kondo K. (2002). Plant genetic diversity: exploration. evaluation. Conservation. Affilated East-West Press Pvt. Ltd. Henry, R.J. (2006) Plant Conservation Genetics. The Haworth Press Inc. USA. Bibliografía complementaria: Milano, I., et al; (2011). " Novel tools for conservation genomics: Comparing two high-throughput approaches for SNP discovery in the transcriptome of the European hake". 2011. PLoS ONE 6(11): e28008. doi:10.1371/journal.pone.0028008 Boshier, D.H and A.G. Young (2000) "Forest conservation genetics: limitations and future directions. In: Forest conservation genetics: Principles and practice" (A. Young, D. Boshier and T. Boyle, eds), pp. 289-297. CABI Publishing, United Kingdom.

76



Unidad León



Edafología y Microbiología del Suelo

Clave

Año 2

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Reconocer al suelo como un ecosistema, con características físicas, químicas y biológicas cambiantes. Así como los distintos tipos de interacciones que existen entre los microorganismos, los componentes del suelo, y las plantas.

Índice temático

77

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la edafología 3 2

2 Propiedades físicas del suelo 6 4

3 Propiedades fisicoquímicas del suelo 6 4

4 Constituyentes del suelo 6 4

5 Fertilidad y degradación del suelo 6 4

6 Microbiología del suelo 6 4

7 Métodos de estudio de los microorganismos del suelo 6 6

8 Interacciones entre los microorganismos del suelo y las plantas

9 4

9 Aplicaciones en el uso de los microbios del suelo 6 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción a la edafología

1.1 El suelo como elemento del ecosistema.

1.2 Conceptos básicos de suelos.

1.3 El perfil del suelo.

1.4 Componentes del suelo: materia orgánica, minerales, agua y aire.

2 Propiedades físicas del suelo

2.1 Textura: determinación e importancia en la formación y fertilidad de suelos.

2.2 Estructura: morfología y estabilidad.

2.3 Porosidad y permeabilidad.

2.4 Dinámica del agua.

2.4.1 Perfil hídrico y balance hídrico.

2.5 densidad aparente y densidad de partículas, color y temperatura del suelo.

3 Propiedades fisicoquímicas del suelo

3.1 Intercambio iónico.

3.1.1 Fuerza iónica y conductividad.

3.1.2 Capacidad de cambio de cationes.

3.2 Acidez del suelo.

3.2.1 Relación entre pH y grado de saturación.

3.2.2 Efectos de la acidez.

3.3 Concepto de salinidad.

3.3.1 Aspectos químicos de la recuperación de suelos salinos.

3.4 Potencial de oxidación - reducción.

4 Constituyentes del suelo

4.1 Fase sólida.

4.1.1 Minerales del suelo y mecanismos de procedencia.

4.1.1.2 Estabilidad y alteración de los minerales del suelo.

4.1.2 Materia orgánica.

4.1.2.1 Propiedades de la materia orgánica.

4.1.2.2 Cantidad y distribución de la materia orgánica en el suelo.

4.1.2.3 Organismos del suelo: clasificación.

4.1.2.4 Factores que influyen en su distribución.

78

4.1.2.5 Principales funciones de los organismos vivos en el suelo.

4.2 Fase líquida.

4.2.1 Clases de agua, origen y localización.

4.2.2 Estado energético.

4.2.3 Métodos de medida de humedades y potenciales.

4.3 Fase gaseosa.

4.3.1 Localización, composición y dinámica de los gases del suelo.

4.3.2 Movimientos del aire en el suelo: difusión y convección.

4.3.3 Influencia de la aireación sobre la actividad biológica del suelo y sobre su evolución natural.

5 Fertilidad y degradación del suelo

5.1 Factores que afectan la producción de las plantas.

5.1.1 Factores genéticos.

5.1.2 Factores ambientales: temperatura, energía radiante, humedad, reacción del suelo, composición del aire, factores bióticos, elementos nutrientes. elementos esenciales.

5.1.3 El Nitrógeno y el fósforo en los suelos.

5.1.3.1 Ciclo del nitrógeno y del fósforo en los suelos.

5.1.3.2 Funciones en la planta.

5.1.4 El Potasio, Calcio, Magnesio y Azufre en los suelos.

5.1.5 Micro elementos en los suelos.

5.2 Erosión.

5.2.1 Mecánica de la erosión.

5.2.2 La erosión y sus efectos en la fertilidad del suelo.

5.2.3 Pérdida de nutrimentos por la erosión.

5.2.4 La erosión y el rendimiento de los cultivos.

5.2.5 Recuperación de suelos degradados por la erosión.

6 Microbiología del suelo

6.1 Ecología microbiana del suelo.

6.2 El suelo como hábitat microbiano.

6.3 Principales grupos de microorganismos que habitan en el suelo.

6.4 Influencia de los factores ambientales sobre el crecimiento de los microorganismos del suelo.

7 Métodos de estudio de los microorganismos del suelo

7.1 Métodos de detección, identificación y aislamiento.

7.2 Aplicaciones de la genética molecular al estudio de los microorganismos del suelo.

8 Interacciones entre los microorganismos del suelo y las plantas

8.1 Interacciones entre las comunidades microbianas del suelo.

8.2 Interacciones entre los microbios del suelo y las plantas.

8.2.1 Asociaciones simbióticas, mutualistas y parásitas.

9 Aplicaciones en el uso de los microbios del suelo

9.1 Producción de biofertilizantes.

9.2 Biorremediación de suelos contaminados.

9.3 Biodegradación de pesticidas.

9.4 Biocontrol de enfermedades de plantas.


79






Prácticas de campo ( X ) Asistencia ( )






Bibliografía básica: Charman, P y Murphy B. (2007). Soil. Their Properties and Management. Oxford University Press. Australia. Roose, E. J., Feller, C. y Barthes, B. (2005). Soil Erosion and carbon Dynamics. Taylor and Francis. USA. Porta, C. J. (2003). Edafologia. Para la agricultura y el medio ambiente. Ediciones Mundi Prensa. España. Wild, Alan. (1994 ). Soil and the Environment. Cambridge. University Press. Tate, R. (2000). Soil Microbiology. 2nd. Edition, Wiley. Alexander M., (1998). Introducción a la microbiología del suelo, México D.F.,AGT Editor S.A. Bibliografía complementaria: Malcom, E. S. (1999). Handbook of Soil Science. University of Georgia, USA. Narro, E. (1994). Física de suelos, con enfoque agrícola. Editorial Trillas. México. Hernández, A. (2006). El suelo: fundamentos sobre su fundación, los cambios globales y su manejo. Universidad Autónoma de Nayarit. México. Madigan T. M., Martinko J. M. y Parker J., (2001). Biología de los microorganismos de Brock, México D. F., Prentice Hall. Artículos originales de revistas científicas.

80



Unidad León



Matemáticas IV

Clave

Año 2

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Básico


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( X )


Matemáticas III


Ninguna

Indicativa ( )



Objetivo general: Aprender y entender la aplicación de las transformaciones lineales de espacios vectoriales para la solución de ecuaciones diferenciales con aplicaciones a la biología de sistemas.

Índice temático

Unidad Tema Horas

81


1 Solución de ecuaciones diferenciales por sustitución. 8 0

2 Problemas de valor inicial. 6 0

3 Ecuaciones lineales homogéneas. 8 0

4 Soluciones particulares de ecuaciones no homogéneas. 8 0

5 Operador diferencial. 8 0

6 Ecuación de Cauchy-Euler. 6 0

7 Solución de ecuaciones diferenciales por eliminación. 8 0

8 Transformada de Laplace. 8 0

9 Sistemas de ecuaciones diferenciales de primer orden. 12 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Solución de ecuaciones diferenciales por sustitución

2 Problemas de valor inicial

3 Ecuaciones lineales homogéneas

4 Soluciones particulares de ecuaciones no homogéneas

5 Operador diferencial

6 Ecuación de Cauchy-Euler

7 Solución de ecuaciones diferenciales por eliminación

8 Transformada de Laplace

9 Sistemas de ecuaciones diferenciales de primer orden










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Matemáticas o áreas afines



Bibliografía básica: D. G. Zill & M. R. Cullen; Ecuaciones diferenciales con problemas de valores en la frontera; Thomas Learning; 2002; Quinta edición. J. W. Dettman; Introduction to Linear Algebra and Differential Equations; Dover Publications,

82

1986. R. Greenwell, N. Ritchey & M. Lial; Calculus for the Life Sciences; Addison-Wesley, 2003. Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas.

83



Unidad León



Inglés

Clave

Año 2

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas




Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Inglés


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje, y como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área. Objetivos específicos: 1. Intercambiar información sobre comida, restaurantes y recetas de cocina. 2. Intercambiar información sobre distintos tipos de anuncios y sus efectos en el consumidor.

84

3. Intercambiar información sobre esparcir rumores, dar opiniones, hablar sobre reseñas, realizar una entrevista. 4. Intercambiar información sobre experiencias de viajes y expediciones. 5. Intercambiar información sobre tiendas, ropa, el origen de algunas cosas, promoción de un producto. 6. Intercambiar información sobre los roles de los hombres y de las mujeres, sus características y deseos.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Alimentos y bebidas 9 0

2 Persuasión 9 0

3 Rumores y chismes 9 0

4 Viajes 9 0

5 Música 9 0

6 Planes 9 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático

Unidad

Temas y subtemas

1 Alimentos y bebidas 1.1 Gramática. 1.1.1 Ordenadores de secuencia. 1.1.2 Artículos. 1.1.3 Repaso presente perfecto. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Cuantificadores. 1.2.2 Adjetivos + colocaciones de sustantivo. 1.2.3 Partitivos. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Números y fracciones. 1.4 Comprensión de lectura. 1.4.1 Leer una receta de cocina. 1.4.2 Leer un artículo de revista. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Escribir una crítica a un restaurante. 1.5.2 Escribir notas para narrar una historia. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar un programa de radio. 1.6.2 Escuchar un poema. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Dar una receta. 1.7.2 Conversar acerca de restaurantes.

2

Persuasión 2.1 Gramática. 2.1.1 Hacer y permitir. 2.1.2 Preguntar, desear, decir. 2.1.3 Gerundios y presente participio. 2.1.4 Repaso de ordenadores de secuencia y artículos. 2.2 Vocabulario.

85

2.2.1 Verbos seguidos de to + infinitivo. 2.2.2 Frases con hacer y permitir. 2.3. Pronunciación. 2.3.1 Acentuación de la oración. 2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer un artículo de una revista. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Escribir una carta. 2.5.2 Escribir una presentación. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1 Escuchar un comercial de televisión. 2.6.2 Escuchar una canción. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Conversar acerca de los comerciales. 2.7.2 Conversar acerca de factores importantes dentro de una relación. 2.7.3 Hacer una presentación.

3

Rumores y chismes 3.1 Gramática. 3.1.1 Reporte de oraciones afirmativas. 3.1.2 Reporte de oraciones interrogativas. 3.1.3 Repaso del verbo hacer y gerundios. 3.2 Vocabulario. 3.2.1 Say y tell. 3.2.2 Frases idiomáticas. 3.3 Pronunciación. 3.3.1 Entonación. 3.4 Comprensión de lectura. 3.4.1 Leer un artículo de periódico. 3.4.2 Leer una reseña musical. 3.5 Expresión escrita. 3.5.1 Escribir un reporte. 3.5.2 Escribir preguntas para una entrevista. 3.6 Comprensión auditiva. 3.6.1 Escuchar una sesión de preguntas y respuestas. 3.6.2 Escuchar una canción. 3.7 Expresión oral. 3.7.1 Preguntar acerca de hábitos al hablar por teléfono. 3.7.2 Conversar acerca de reseñas y clubes de fanáticos.

4

Viajes 4.1 Gramática. 4.1.1 Pasado perfecto. 4.1.2 Pasado perfecto progresivo. 4.1.3 Repaso de reporte de oraciones. 4.2 Vocabulario. 4.2.1 Viajar. 4.2.2 Inferir significados. 4.3 Pronunciación. 4.3.1 Enlaces al pronunciar. 4.4 Comprensión de lectura. 4.4.1 Leer un artículo de revista. 4.5 Expresión escrita. 4.5.1 Escribir un ensayo acerca de competencias. 4.6 Comprensión auditiva. 4.6.1 Escuchar una conversación. 4.7 Expresión oral. 4.7.1 Elegir un representante para un evento importante.

86

4.7.2 Conversar acerca de volar. 4.7.3 Conversar acerca de experiencias de viaje.

5

Música 5.1 Gramática. 5.1.1 Voz pasiva. 5.1.2 Preposiciones relativas. 5.1.3 Repaso: pasado perfecto. 5.2 Vocabulario. 5.2.1 Connotación. 5.2.2 Sufijos. 5.3 Pronunciación. 5.3.1 Formas suaves y fuertes. 5.4 Comprensión de lectura. 5.4.1 Leer de un artículo de periódico. 5.5 Expresión escrita. 5.5.1 Escribir un artículo de revista. 5.6 Comprensión auditiva. 5.6.1 Escuchar un programa de radio. 5.6.2 Escuchar una guía de museo. 5.7 Expresión oral. 5.7.1 Conversar acerca de tiendas y compras. 5.7.2 Conversar acerca de los orígenes de las cosas. 5.7.3 Presentar un plan para promover un producto.

6

Planes 6.1 Gramática 6.1.1 Primer y segundo condicional. 6.1.2 Wish en tiempo pasado. 6.1.3 Repaso de voz pasiva y repaso general. 6.2 Vocabulario. 6.2.1 Usos de make y do. 6.2.2 Estilo de vida. 6.3 Pronunciación. 6.3.1 Homófonos. 6.4 Comprensión de lectura. 6.4.1 Leer una nota del periódico y de un correo electrónico. 6.4.2 Leer una encuesta. 6.5 Expresión escrita. 6.5.1 Escribir una carta. 6.6 Comprensión auditiva. 6.6.1 Escuchar una canción. 6.6.2 Escuchar una conferencia. 6.7 Expresión oral. 6.7.1 Conversar acerca de los roles de hombres y mujeres. 6.7.2 Conversar acerca de deseos. 6.7.3 Conversar acerca de características femeninas y masculinas.

Sugerencias didácticas: Exposición oral ( x) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clase (x) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigación ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )


87







88

QUINTO SEMESTRE

89



Unidad León



Genómica Comparativa

Clave

Semestre 5

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas

Duración: 18 semanas Semana Total Semestre



Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Revisar y estudiar los organismos modelo más utilizados en las ciencias agrogenómicas, sus características principales y los métodos para su estudio a escala genómica.

90

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la genómica comparativa 6 4

2 Principios de genética poblacional y evolutiva 8 4

3 Genomas virales 8 4

4 Genomas de bacterias y arqueobacterias 8 6

5 Genomas de hongos y oomicetos 8 6

6 Genomas de plantas y otros genomas eucariontes 8 6

7 Genómica agrícola 8 6

54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción a la genómica comparativa

2 Principios de genética poblacional y evolutiva

3 Genomas virales

4 Genomas de bacterias y arqueobacterias

5 Genomas de hongos y oomicetos

6 Genomas de plantas y otros genomas eucariontes

7 Genómica agrícola













Bibliografía básica: Artículos originales de revistas científicas. Arabidopsis Genome Initiative; "Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana"; Nature; 2000; 408:796-815. González V, et al.; “The partitioned Rhizobium etli genome: genetic and metabolic redundancy in seven interacting replicons”; Proc. Natl. Acad. Sci.; 2006;103(10):3834-3839.

91

Vielle-Calzada J.P., et al.; “The Palomero genome suggests metal effects on domestication”, Science. 2009, Nov 20;326(5956):1078. Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas. Vega-Arreguín J.C., et al.; “Deep sampling of the Palomero maize transcriptome by a high throughput strategy of pyrosequencing”. BMC Genomics, 2009 Jul 6;10:299. Galagan JE, et al.; "The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa"; Nature; 2003; 422:859-68.

92



Unidad León



Fitopatología y Mecanismos de Resistencia

Clave

Semestre 5

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Adquirir conocimientos fundamentales sobre los fenómenos moleculares de la interacción planta-patógeno, así como las bases teóricas sobre resistencia y susceptibilidad en plantas.

93

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la fitopatología 6 4

2 Biología molecular y genómica de fitopatógenos modelo 6 4

3 Mecanismos moleculares de patogenicidad y virulencia 6 4

4 Mecanismos moleculares de defensa 6 4

5 Estrategias ofensivas y defensivas 6 4

6 Defensa e Inmunidad inducida por PAMP (PTI)/ efector (ETI) 6 4

7 Silenciamiento génico o interferencia 6 4

8 Genómica de sistemas modelo planta - patógeno 6 4

9 Control químico, biológico, biotecnológico e integrado 6 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción a la fitopatología

1.1. Historia de la fitopatología

1.2. Postulados de Koch.

1.3. Descripción de los grandes grupos taxonómicos de los patógenos y sus estrategias patogénicas (parásitos/biótrofos, saprófitos/necrótrofos, facultativos vs obligados).

2 Biología molecular y genómica de fitopatógenos modelo

2.1. Sistemas modelo: virus, bacterias, hongos, oomicetos, nematodos, insectos.

2.2. Identificación y diagnóstico de fitopatógenos por técnicas inmunológicas, moleculares y de genotipificación (ELISA, PCR).

3 Mecanismos moleculares de patogenicidad y virulencia

3.1. Genes involucrados.

3.2. Enzimas (degradativas, estrés oxidativo, etc) e inhibidores de enzimas, toxinas y detoxificadores, hormonas y sus genes.

3.3. Determinantes del rango de hospedantes.

4 Mecanismos moleculares de defensa

4.1. Resistencia cuantitativa, cualitativa y de no hospedante.

4.2. Hipersensibilidad.

4.3. Inmunidad.

4.4. Tolerancia.

4.5. Resistencia local y sistémica (respuesta sistémica adquirida: SAR y no SAR).

5 Estrategias ofensivas y defensivas

5.1. El reconocimiento mutuo. Efectores y PAMPs (Patrones Moleculares Asociados a Patógeno) y sus genes asociados (genes de virulencia/avirulencia: avr).

5.2. Los genes R: estructura (dominios más frecuentes), localización y organización genómica, función y transducción de señales, regulación de su expresión (promotores, regulación postranscripcional).

5.3. Localización genética y sintenías evolutivas de genes de resistencia en especies vegetales relacionadas.

5.4. Modelos de Interacción.

6 Defensa e Inmunidad inducida por PAMP (PTI)/ efector (ETI)

94

6.1. Productos génicos activados vía transducción de señales.

6.2. Genes relacionados con respuesta a patógenos (PR) y no-PR.

6.3. Estrategias diferenciadas para patógenos biotróficos y necrotróficos (vía del salicílico versus vía del jasmónico).

6.4. Diálogo e interacción de distintas vías de transducción de señales no rutinariamente relacionadas con respuesta a patógenos (cross-talk).

6.5. Activación de respuestas complejas.

7 Silenciamiento génico o interferencia

7.1. DICER, RdRP, Argonauta y RISC.

7.2. Papel del dsRNA y de los RNAs pequeños (siRNA vs miRNA).

7.3. Supresores del silenciamiento.

7.4. Aplicaciones de silenciamiento: VIGS, HIGS.

8 Genómica de sistemas modelo planta - patógeno

8.1. Genomica de la interaccion planta - oomiceto, - bacteria, - virus, - hongo, - nematodo, -insecto.

9 Control químico, biológico, biotecnológico e integrado

9.1. Nuevas estrategias para el mejoramiento genético para el control de fitopatógenos.

9.2. Producción de plantas transgénicas con resistencia a patógenos.

9.3. Mejoramiento genético convencional y asistido por marcadores moleculares.







Prácticas de campo ( X ) Asistencia ( )






Bibliografía básica: Comprehensive and Molecular Phytopathology (Studies in Plant Science). Yuri Dyakov (Editor), Vitaly Dzhavakhiya (Editor), Timo Korpela (Editor): 496 pages. Publisher: Elsevier Science; 1 edition (March 28, 2007) ISBN-10: 0444521321 ISBN-13: 978-0444521323 Introduction to plant pathology. Richard N. Strange. John Wiley and Sons, 2003, 464 páginas, ISBN0470849738, 9780470849736 Molecular Plant Pathology: Advanced text. Matthew Dickinson, BIOS Scientific, 2003 244 páginas ISBN 1859960448, 9781859960448 Plant Pathology, Fifth Edition, George N. Agrios (Author): 952 pages. Publisher: Academic Press; 5 edition (January 10, 2005) ISBN-10: 0120445654 ISBN-13: 978-0120445653 Trigiano, R. N., Windham, M. T. and Windham, A. S. 2008. Plant Pathology. Concepts and Laboratory Exercises. CRC Press. Boca Raton, FL. USA. 558 p.

95

Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas. Matthews' Plant Virology, Fourth Edition, Roger Hull (Author): 1056 pages. Publisher: Academic Press; 4 edition (October 9, 2010) ISBN-10: 0123611601 ISBN-13: 978-0123611604 Plant-fungal Pathogen Interaction: a Classical and Molecular View. Hermann H. Prell, Peter R. Day Springer, 2001, 214 páginas, ISBN 354066727X Plant pathology and Plant Pathogens. Volumen 6 de Basic microbiology. John Alexander Lucas, C. H. Dickinson. Edición 3, John Wiley & Sons, 1998, 274 páginas, ISBN 0632030461

96



Unidad León



Fitomejoramiento Genético

Clave

Semestre 5

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender las distintas formas de reproducción de las plantas, los métodos de mejora y sus aplicaciones, así como el manejo del material vegetal.

Índice temático

Unidad Tema Horas

97


1 Introducción al mejoramiento genético 6 4

2 Reproducción de plantas y mejoramiento genético 6 4

3 Mejoramiento de especies autógamas 6 4

4 Mejoramiento de especies alógamas 6 4

5 Mejoramiento de plantas con reproducción asexual 6 4

6 Técnicas especiales de mejoramiento genético 8 6

7 Casos específicos de mejora genética 8 6

8 Manejo de recursos genéticos y programas de mejoramiento 8 4

Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Introducción al mejoramiento genético

1.1. Objetivos e importancia del mejoramiento genético.

1.2. Terminología genética.

1.3 Ciencias auxiliares en el fitomejoramiento.

1.4. Centros de origen de las plantas cultivadas y domesticación de las plantas cultivadas.

1.5. Bancos de germoplasma.

2 Reproducción de plantas y mejoramiento genético

2.1 Reproducción sexual y asexual.

2.2. Morfología de las estructuras reproductivas.

2.3. Plantas dioicas y plantas monoicas.

2.4. Microsporogénesis.

2.5. Megasporogénesis.

2.6. Tipos de fecundación y polinización.

3 Mejoramiento de especies autógamas

3.1. Métodos sin hibridación.

3.1.1. Selección masal.

3.1.2. Selección individual.

3.2. Métodos con hibridación.

3.2.1. Cruzamientos múltiples.

3.2.2. Método genealógico.

3.2.3. Método de selección masal.

3.2.4. Retrocruza.

3.2.5. Multilíneas.

3.2.6. Híbridos comerciales.

4 Mejoramiento de especies alógamas

4.1. Métodos sin hibridación.

4.1.1. Selección masal.

4.1.2. Espiga por hilera.

4.2. Métodos con hibridación.

4.2.1. Híbridos simples, híbridos dobles.

4.2.2. Selección y valoración de líneas puras.

4.2.3. Aptitud combinatoria general y especifica.

4.2.4. Predicción del rendimiento de híbridos dobles.

98

4.2.5. Evaluación de líneas.

4.2.6. Generaciones avanzadas de variedades híbridas.

4.3. Uso de la haploidía.

4.4. Selección recurrente.

4.5. Variedades sintéticas.

5 Mejoramiento de plantas con reproducción asexual 5.1. Características de las plantas clonales.

5.1.1. Colección y estudio sistemático del material.

5.2. Respuesta a la selección.

5.2.2. Selección intraclonal.

5.2.3. Mutaciones, injertos y usos de la reproducción sexual como medios para obtener variabilidad.

5.3. Métodos de mejoramiento genético.

5.3.1. Métodos de mejora para cultivos apomícticos.

5.3.2. Ejemplos de cultivos propagados asexualmente.

6 Técnicas especiales de mejoramiento genético

6.1. Poliploidía.

6.1.1. Efectos de la poliploidía sobre el fenotipo.

6.1.2. Utilización de la poliploidía con fines prácticos.

6.2. Haploidía.

6.2.1. Terminología y clasificación de haploides.

6.2.2. Origen y naturaleza. Identificación.

6.2.3. Utilización en la mejora de plantas.

6.3. Mutagénesis.

6.3.1. Mutaciones naturales e inducidas.

6.3.2. Aplicación de la mutagénesis artificial en la mejora de plantas.

6.4. Hibridación interespecífica e intergenérica.

6.4.1. Barreras.

6.4.2. Aspectos genéticos.

6.4.3. Utilización en la mejora de plantas.

6.5. Introducción de variación extraespecífica en las plantas.

6.5.1. Líneas de adición y de sustitución cromosómica.

6.5.2. Injerto cromosómico.

6.5.3. Recombinación génica.

6.6. Métodos in vitro.

6.6.1. Cultivo de embriones.

6.6.2. Cultivo de meristemas.

6.6.3. Cultivo de células y tejidos.

6.7. Plantas transgénicas.

6.7.1. Métodos de obtención.

6.7.2. Análisis de plantas transgénicas.

6.7.3. Organismos genéticamente modificados (OGM).

6.7.4. Impacto ambiental y social. Los transgénicos en el mundo.

6.8. Selección asistida por marcadores moleculares (MAS).

6.8.1. Regiones de actividad cuantitativa (QTLs).

6.8.2. Utilidad y aplicación en programas de mejoramiento.

7 Casos específicos de mejora genética

7.1 Mejora por rendimiento.

99

7.1.1. Bases morfológicas y fisiológicas del rendimiento.

7.1.2. Componentes de rendimiento.

7.1.3. Genética de los componentes.

7.1.4. Problemas de correlación entre caracteres.

7.2. Mejoramiento de la calidad.

7.2.1.Tipos de calidad: aparente, organoléptica, nutricional, culinaria, industrial.

7.2.2. Variabilidad genética en la calidad.

7.2.3. Factores que afectan la calidad.

7.2.4. Marcadores moleculares asociados a calidad.

7.3 Mejora de las resistencias a enfermedades y a condiciones ambientales adversas.

7.3.1. Resistencia genética a las enfermedades.

7.3.2. Interacción hospedante-patógeno.

7.3.3. Mecanismos de resistencia.

7.3.4. Resistencia a condiciones ambientales adversas.

7.3.5. Determinación genética de la resistencia: resistencia diferencial y uniforme.

7.3.6. Variedades multilíneas con resistencia genética.

8 Manejo de recursos genéticos y programas de mejoramiento

8.1 Manejo de recursos genéticos.

8.2 Manejo de programas de mejoramiento.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Biotecnología, Agronomía o áreas afines



Bibliografía básica: Pohelman J. M. and Sleper D. A. (2006). Breeding Field Crops. Fifth edition. Blackwel Publishing. Iowa, USA. Chahal, G.S. and Gosal S.S. (2002) Principles of Plant Breeding: Biotechnological and Conventional Approaches. Alpha Science International Ltd. Pangbourne. India Acquaah G. (2007). Principles of plant genetics and breeding. Blackwell Publishing.USA. Xu Yunbi . (2010). Molecular Plant Breeding. CAB International. Wallingford, UK. Murphy D.J. (2007). Plant Breeding and Biotechnology: Societal Context and the Future of Agriculture. Cambridge University Press. UK.

100

Bibliografía complementaria: Kazuo N. Watanabe,Eija Pehu . (1997). Plant biotechnology and Plant Genetic Resources for Sustainability and Productivity. RG Landers and Academic Pres INC, California, USA. Kumar A. and Shekhawat N.S. (2007). Plant Tissue Culture And Molecular Markers: Their Role In Improving Crop Productivity. IK International Publishing House Pvt. Ltd. New Delhi, India. Pohelman, J.M; Allen Sleper, D. Mejoramiento genético de las cosechas, 2da. Edic. Editorial LIMUSA.

101



Unidad León



Temas Selectos en Ciencias Agrogenómicas I

Clave

Semestre 5

Créditos 8

Área


Genómica y Bioinformática, Biología Celular y Molecular, Biotecnología, Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso (X) Taller ( ) Lab ( ) Sem (X)

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Consolidar su formación mediante la discusión de proyectos de investigación que presenten un componente genómico, agrícola o social importante. Esta discusión se realizará directamente con investigadores de instituciones nacionales y extranjeras líderes en su área de investigación; esto brindará nuevas oportunidades de desarrollo de los estudiantes, así como proponer nuevos enfoques en los proyectos de investigación discutidos.

102

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Desarrollo de la Agricultura en México 12 0

2 Contexto Agrícola Actual 12 0

3 Perspectivas de la Agricultura 12 0

4 Seminarios impartidos por investigadores nacionales e internacionales líderes en su área

36 0

Total 72 0

Contenido Temático


1 Desarrollo de la Agricultura en México

1.1 Geografía, recursos y población

1.2 Utilización y características de las tierras agrícolas

1.3 Políticas y programas agrícolas

1.4 La reforma agraria, el crédito rural.

1.5 La Revolución verde

1.6 La crisis agraria en México

1.7 El papel de la agricultura en el desarrollo económico de México

2 Contexto Agrícola Actual

2.1 Características del sector agrícola

2.2 Marco normativo en el desarrollo agrícola

2.3 Regiones económicas de desarrollo agrícola

2.4 Impacto de la crisis económica en la agricultura en México

3 Perspectivas de la Agricultura

3.1 Tendencias de la agricultura

3.2 Presente y futuro de la biotecnología en México

3.3 La mejora genética en la agricultura

3.4 Política de investigación agrícola











Título o grado Maestro o Doctor en Ciencias en Desarrollo Rural, Economía Agrícola, Ciencias Sociales o áreas afines

103



Bibliografía básica: Romero Polanco, Emilio (2002) Un siglo de agricultura en México. Textos Breves de Economía . Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Investigaciones Económicas, Miguel Ángel Porrúa., México. ISBN 970-701-291-9 Escalante, R. y H. Catalán (2008), Situación actual del sector agropecuario en México: perspectivas y retos, Revista Economía Informa núm. 350. Alba González Jácome. Agricultura y sociedad en México: diversidad, enfoques, estudios de caso. Universidad Iberoamericana, 1999. Artículos originales de revistas de investigación sugeridos por el investigador invitado. Bibliografía complementaria: Hubert C. de Grammont. El campo mexicano a finales del siglo xx (The Mexican Countryside in the Late 20th Century) Revista Mexicana de Sociología Vol. 63, No. 4 (Oct. - Dec., 2001), pp. 81-108 Published by: Universidad Nacional Autónoma de México.

104



Unidad León



Fronteras de la Genómica Agrícola I

Clave

Semestre 5

Créditos 12

Área



Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso ( ) Taller ( ) Lab ( ) Sem (X)

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 6 Total 108

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Consolidar la formación mediante contacto directo con líderes en distintas áreas de las ciencias agrogenómicas; tales como: bioinformática, genómica funcional, genómica agrícola, genómica comparativa, metagenómica, análisis computacional y experimental, genómica de plantas y patogenos, estadística y biotecnología. Esto les brindará una excelente perspectiva para continuar sus estudios o actividades profesionales en diferentes áreas de las ciencias agrogenómicas.

105

Índice temático

Unidad Tema Horas



108 0

Total 108 0

Contenido Temático












Título o grado Doctor(a) en Biología o áreas afines



Bibliografía básica: Artículos originales de revistas de investigación sugeridos por el investigador invitado.


106



Unidad León



Inglés

Clave

Semestre 5

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas

Duración: 18 semanas Semana Total semestre



Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Inglés


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje, y como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área.

107

Objetivos específicos: 1. Intercambiar información sobre aspectos relacionados con personalidad. 2. Intercambiar información acerca de la adquisición de fama y fortuna. 3. Intercambiar información sobre el uso de la tecnología digital. 4. Intercambiar información sobre temas relacionadas con la amistad, el noviazgo, el matrimonio. 5. Intercambiar información sobre inventos y descubrimientos. 6. Intercambiar información sobre temas relacionados con la fantasía, mitos y realidades.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Tu y yo 10 0

2 Fama y fortuna 11 0

3 Tecnología 11 0

4 Lazos afectivos 11 0

5 Inventos y descubrimientos 11 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático

Unidad Temas

1

Tú y yo 1.1 Gramática. 1.1.1 Repaso y extensión de presente y pasado simple. 1.1.2 Repaso y extensión del presente progresivo. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Adjetivos que describen personalidad. 1.2.2 Colores. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Acentuación de la oración. 1.4 Comprensión de lectura. 1.4.1 Leer artículos de revistas. 1.4.2 Leer correos informales. 1.4.3 Comparar un texto escrito y uno hablado. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Escribir un párrafo haciendo comparaciones. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar una conferencia. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Intercambiar información acerca de nombres. 1.7.2 Comentar y analizar letra manuscrita. 1.7.3 Comparar y contrastar obras de arte.

108

2

Fama y fortuna 2.1 Gramática. 2.1.1 Repaso y extensión del tiempo pasado simple, used to y be used to doing. 2.1.2 Uso de wish, if only. 2.2 Vocabulario. 2.2.1 Relacionado con el dinero. 2.2.2 Combinación fija de verbos y sustantivos (collocations). 2.2.3 Vocabulario sobre escuela y carreras. 2.3. Pronunciación. 2.3.1 Entonación para expresar interés y sorpresa. 2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer una biografía. 2.4.2 Leer el perfil de una persona famosa. 2.4.3 Leer instrucciones. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Escribir una mini biografía. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1 Escuchar entrevistas. 2.6.2 Escuchar una encuesta. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Hablar acerca de situaciones que provocan arrepentimiento.

3

Tecnología 3.1 Gramática. 3.1.1 Repaso y extensión del presente perfecto con for y since. 3.1.2 Adverbios que se usan con el presente perfecto. 3.1.3 Reciclaje de pasado simple, used to, be used to, wish, if only. 3.2 Vocabulario. 3.2.1 Relacionado con Internet. 3.3 Pronunciación. 3.3.1 Entonación de preguntas. 3.4 Comprensión de lectura. 3.4.1 Lectura de un artículo de Internet. 3.4.2 Lectura de una encuesta de revista. 3.5 Expresión escrita. 3.5.1 Hacer una actividad tipo “chat”. 3.6 Comprensión auditiva. 3.6.1 Escuchar una entrevista. 3.6.2 Escuchar una plática. 3.7 Expresión oral. 3.7.1 Hablar sobre el uso de teléfonos celulares. 3.7.2 Hablar sobre la importancia del Internet.

4

Lazos afectivos 4.1 Gramática. 4.1.1 Repaso y extensión de planes e intenciones futuras (going to, presente progresivo y presente simple). 4.1.2 Uso de will y going to para predecir el futuro. 4.1.3 Uso del primer y segundo condicionales. 4.1.4 Reciclaje del presente perfecto. 4.2 Vocabulario. 4.2.1 Relacionado con la familia, experiencias de vida y amistad. 4.3 Pronunciación. 4.3.1 Entonación para mostrar interés. 4.4 Comprensión de lectura. 4.4.1 Lectura de un artículo científico. 4.4.2 Lectura de un artículo de ciencias sociales. 4.5 Expresión escrita.

109

4.5.1 Escritura de opiniones en un sitio de Internet. 4.6 Comprensión auditiva. 4.6.1 Escuchar a personas realizando una entrevista. 4.7 Expresión oral. 4.7.1 Hablar acerca de intenciones. 4.7.2 Hablar acerca de la familia, el matrimonio y la amistad.

5

Inventos y descubrimientos 5.1 Gramática. 5.2 Vocabulario. 5.3 Pronunciación. 5.4 Comprensión de lectura. 5.5 Expresión escrita. 5.6 Comprensión auditiva. 5.7 Expresión oral.

Sugerencias didácticas: Exposición oral (x ) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clase ( ) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigación ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )

Mecanismos de evaluación del aprendizaje de los alumnos: Exámenes parciales (x ) Examen final escrito ( x ) Trabajos y tareas fuera del aula ( x ) Exposición de seminarios por los alumnos ( ) Participación en clase ( x ) Asistencia ( x ) Seminario ( ) Otras:






Bibliografía complementaria: Harmer J. (2004). Just Grammar. Malasya: Ed. Marshal Cavendish.

110

SEXTO SEMESTRE

111



Unidad León



Biología de Sistemas

Clave

Semestre 6

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender los conceptos centrales de la biología de sistemas y conocer los principales temas de investigación en esta disciplina con distintos enfoques, tipos de modelaje y herramientas experimentales; con el fin de que adquirir una habilidad crítica de este tipo de análisis; así como conocer las herramientas de modelaje disponibles.

112

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Introducción a la biología de sistemas 12 0

2 Estructura y propiedades topológicas de redes metabólicas y redes transcripcionales

12 0

3 Dinámica redes en estado estacionario 12 0

4 Control de redes metabólicas 12 0

5 Diseño y modificación de redes bioquímicas y metabólicas 12 0

6 Modelos de redes metabólicas a escala genómica 12 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la biología de sistemas

1.1. La complejidad de los sistemas biológicos.

1.2. Las partes y el todo: propiedades emergentes.

1.3 Revisión de fundamentos matemáticos.

1.4. Introducción a la Teoría de Redes.

2 Estructura y propiedades topológicas de redes metabólicas y redes transcripcionales

2.1. Definiciones y representación matemática.

2.2. Métodos de análisis.

2.2.1. Análisis con teoría de grafos.

2.2.2. Análisis de balance de flujo.

2.2.3. Análisis de modos de flujo elementales.

2.3 Restricciones y principios de optimización.

3 Dinámica redes en estado estacionario

3.1. Definiciones y representación matemática. Leyes de velocidad.

3.2. El estado estacionario.

3.2.1. Análisis de estabilidad del estado estacionario.

3.2.2. Estados estacionarios múltiples.

3.3. Oscilaciones bioquímicas.

3.4. Análisis de redes de señalización.

4 Control de redes metabólicas


4.2. Métodos de análisis.

4.2.1. Análisis del control metabólico.

4.2.2. Análisis del control metabólico sin parámetros.

4.2.3. Análisis modular del control metabólico.

4.2.4. Análisis del control metabólico para grandes cambios.

4.3 Modelos estocásticos.

4.4 Dinámica booleana de redes de regulación transcripcional.

5 Diseño y modificación de redes bioquímicas y metabólicas


5.2. Diseño de modificaciones de sistemas existentes.

5.2.1. Modificación de la etapa limitante de velocidad.

5.2.2. Modificación de la etapa de mayor control.

113

5.2.3. Modificación de la etapa con control sostenido.

5.2.4. Métodos de modulación múltiple.

5.3. Diseño de nuevos sistemas.

5.3.1. Diseño del control metabólico.

6 Modelos de redes metabólicas a escala genómica

6.1. Ómica: genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica y otras ómicas.

6.3. Biología in silico. Modelos a escala genómica y modelos mínimos.

6.4. Integrando la información ómica.

6.5. De los datos ómicos a una teoría sistémica de la biología.





Trabajo de investigación ( X ) Presentación de tema ( X )








Bibliografía básica: Heinrich, R. y Schuster, S (1996) The regulation of Cellular Systems. Chapman & Hall, New York. Ideker, T.,Galitski, T. y Hood, L. (2001) A new approach to decoding life: systems biology. Ann. Rev. Genomics Hum. Genet., 2, 343-372. Lewis, N.E., Harish Nagarajan, H. y Palsson B.O. (2012) Constraining the metabolic genotypephenotype relationship using a phylogeny of in silico methods. Nat. Rev.Microbiol., 10, 291-305. Palsson, B.O. (2006) Systems Biology. Properties of Reconstructed Networks. Cambridge University Press, Cambridge. Fell, D.A. (1997) Understanding the control of metabolism. Portland Press, Londres Goldbeter, A. (1996) Biochemical Oscillators and Cellular Rhythmes. Cambridge University Press, Cambridge. Kitano, H., Foundations of Systems Biology. 1 edition ed. 2001: The MIT Press. 320. Kitano, H., Systems Biology: A Brief Overview. Science, 2002. 295(5560): p. 1662-1664. Newman, M., A.L. Barabasi, and D.J. Watts, The Structure and Dynamics of Networks. 1 edition ed. 2006: Princeton University Press. 624. Artículos originales y actualizados de revistas científicas. Bibliografía complementaria: Artículos originales y actualizados de revistas científicas. Hucka, M., et al., The systems biology markup language (SBML): a medium for representation and exchange of biochemical network models. Bioinformatics, 2003. 19(4): p. 524-531. Ideker, T., T. Galitski, and L. Hood, A NEW APPROACH TO DECODING LIFE: Systems

114

Biology. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 2001. 2(1): p. 343-372. Alon, U., An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. 1 edition ed. 2006: Chapman & Hall/CRC. 320. Davidson, E.H., Genomic Regulatory Systems: Development and Evolution. 1st edition ed. 2001:Academic Press. 261.

115



Unidad León



Biotecnología Vegetal y Microbiana

Clave

Semestre 6

Créditos 8

Área


Biotecnología

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general:

Adquirir una visión completa sobre la utilización de los microorganismos y las plantas

en biotecnología alimentaria y de producción agrícola.

116

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Biotecnología vegetal 20 12

2 Biotecnología microbiana 20 12

3 Alimentos genéticamente modificados. 14 12 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Biotecnología vegetal

1.1. Introducción a la biotecnología vegetal.

1.2. Metodología del cultivo in vitro.

1.3. Organogénesis in vitro.

1.4. Fecundación in vitro.

1.5. Producción in vitro de metabolitos secundarios.

1.6. Plantas transgénicas.

2 Biotecnología microbiana

2.1. Introducción a la biotecnología microbiana.

2.2. Metabolismo microbiano.

2.3. Crecimiento, cinética de crecimiento y medios de cultivo.

2.4. Manipulación del material genético.

2.5. Grupos microbianos de interés biotecnológico.

2.6. Productos de origen bacteriano. 2.7. Productos de origen fúngico. 2.8. Fermentadores y biorreactores. 2.9. Biorremediación.

3 Alimentos genéticamente modificados.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Biotecnología o áreas afines



117

Bibliografía básica: BUCHANAN, BB; GRUISSEM, W and JONES RL (Eds.) (2000). Biochemistry and Molecular Biology of Plants. Amerian Society of Plant Physiology, Rockville, Maryland, USA. KIRAKOSYAN, A and KAUFMAN, P (2009). Recent Advances in Plant Biotechnology. Ed. Springer. Madigan MT, Martinko JM Dunlap, PV y Clark, DP. 2009. Brock: Biología de los microorganismos. Ed. Pearson, Madrid. Prescott LM, Harley JP y Klein DA. 2002. Microbiología. McGraw-Hill Interamericana de España. Madrid. Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas. NEUMANN, K; KUMAR, A; IMANI, J (2009) Plant Cell and Tissue Culture - A Tool in Biotechnology. Ed. Springer.

118



Unidad León



Producción de Semillas y Cultivo de Tejidos

Clave

Semestre 6

Créditos 8

Área


Biotecnología

Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad


Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 5 Total 90

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Comprender la importancia que tienen las semillas de variedades mejoradas y el cultivo de tejidos vegetales dentro del sector agrícola y biotecnológico, así como los avances tecnológicos existentes.

119

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Embriología y morfología de la semilla 4 2

2 Fisiología de semillas 6 2

3 Producción de semillas de autógamas 6 4

4 Producción de semillas de alógamas 6 4

5 Calidad y procesamiento de semillas 6 4

6 Cultivo de tejidos vegetales 6 4

7 Técnicas in vitro en el cultivo de tejidos vegetales 6 4

8 Organogénesis y embriogénesis somática 6 4

9 Micropropagación 4 4

10 Aplicaciones del cultivo de tejidos 4 4 Subtotal 54 36

Total 90

Contenido Temático


1 Embriología y morfología de la semilla

1.1 Megaesporogénesis y microesporogénesis.

1.2 Polinización, fertilización y desarrollo de la semilla.

1.3 Morfología de plántulas.

2 Fisiología de semillas

2.1 Composición química de las semillas.

2.2 Germinación: fases y factores que la afectan.

2.3 Dormancia. Vigor. Longevidad y viabilidad. Vigorización.

2.4 Ensayos de viabilidad de las semillas.

3 Producción de semillas de autógamas

3.1 Semilla y aislamiento.

3.2 Manejo de cultivo.

3.3 Cosecha y extracción de semillas.

3.4 Procesamiento y control de calidad.

3.5 Producción de semilla híbrida.

4 Producción de semillas de alógamas

4.1 Semilla y aislamiento.

4.2 Manejo de cultivo.

4.3 Cosecha y extracción de semillas.

4.4 Procesamiento y control de calidad.

4.5 Producción de semilla híbrida.

5 Calidad y procesamiento de semillas

5.1 Objetivos del análisis de calidad.

5.2 Atributos de calidad en semillas y sus determinaciones.

5.3 Ensayos y técnicas para evaluarlos.

5.4 Muestreo.

5.5 Reglas internacionales para el análisis de semillas.

5.6 Patógenos que se trasmiten por semillas.

6 Cultivo de tejidos vegetales

6.1 Principios básicos de cultivo de tejidos vegetales.

120

6.2 Explantes.

6.2.1 Técnicas de asepsia.

6.3 Tipos de cultivos.

6.3.1. Callos.

6.3.2. Células en suspensión.

6.3.3. Protoplastos.

6.3.4. Órganos.

6.3.5. Embriones.

6.4 Semillas.

6.5 Inflorescencias.

6.6. Medios de cultivo.

6.6.1. Generalidades y componentes de los medios de cultivo.

6.6.2. Preparación de los medios de cultivo.

6.6.3. Efecto del pH sobre el cultivo.

6.6.4. Reguladores del crecimiento que se usan en el cultivo de tejidos.

6.6.5. Ejemplos de su uso en el cultivo in vitro.

6.7. Esterilización.

6.8 Establecimiento el cultivo de tejidos.

6.8.1. Etapas del cultivo de tejidos.

6.8.2. Selección de plantas madres.

6.8.3. Explante.

6.8.4. Siembra del explante.

6.8.5. Condiciones de incubación.

6.8.6. Cambios fisiológicos del explante.

6.8.7. Trasplante al sustrato.

7 Técnicas in vitro en el cultivo de tejidos vegetales

7.1. Generalidades.

7.2. Micropropagación.

7.3. Plantas libres de patógenos.

7.4. Técnicas in vitro aplicadas al fitomejoramiento.

7.5 Conservación in vitro.

7.5.1. Métodos de conservación.

7.5.1.1. Factores que limitan el crecimiento.

7.5.1.2. Supresión del crecimiento.

7.5.1.3. Cryoconservacion del germoplasma.

8 Organogénesis y embriogénesis somática

8.1 Organogénesis.

8.2 Embriogénesis somática.

8.3. Embriogénesis secundaria.

8.4. Etapas de la embriogénesis somática.

8.4.1. Inducción.

8.4.2. Histodiferenciación.

8.4.3. Maduración.

8.4.4. Germinación.

8.5. Factores relacionados con la morfogénesis.

8.5.1. Genotipo.

8.5.2. Explante.

8.5.3. Estado fisiológico de la planta. Edad.

121

8.5.4. Procedencia.

8.5.5. Medio de cultivo. Reguladores del crecimiento.

8.5.6. Condiciones de cultivo. Luz y temperatura.

9 Micropropagación

9. Que es la micropropagación.

9.1. Etapas.

9.2. Ventajas, aplicaciones, limitaciones, problemas.

9.3. Aclimatización.

9.3.1. Autotrofía vs heterotrofía.

9.3.2. Calidad de la planta.

9.3.3. Infraestructura.

9.3.4. Ambiente y químicos.

9.4. Uso de biorreactores.

10 Aplicaciones del cultivo de tejidos

10.1. Callos.

10.2. Diferenciación celular.

10.3. Células en suspensión.

10.4. Producción de metabolitos.

10.5. Regeneración de plantas completas.

10.6. Otros usos del cultivo de tejidos vegetales.

10.6.1. Fusión de protoplastos.

10.6.2. Variación somaclonal.

10.6.3. Almacenamiento de germoplasma.

10.6.4. Ingeniería genética de plantas.

10.6.4.1. Métodos de transformación genética.

10.7. Aplicaciones de la ingeniería genética.

10.7.1. Mejoramiento de cosechas.

10.7.2. Resistencia a herbicidas.

10.7.3. Resistencia a patógenos y plagas.

10.7.4. Retraso en la maduración de la fruta.

10.7.5. Tolerancia a frío y sequía.

10.7.6. Plantas mejoradas nutricionalmente.

10.8 Granjas moleculares.

10.8.1. Producción de anticuerpos.

10.8.2. Vacunas comestibles.

10.8.3. Biopolímeros.









122


Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Biotecnología o áreas afines



Bibliografía básica: Besnier Romero, F. 1989. Semillas. biología y tecnología. Ediciones Mundi-Prensa, Madrid. Black, M., Bewley, D. 2000. Seed Technology and its Biological Basis. CRC Press, Boca Ratón, Florida. Copleand, L.O. and M. B. Mc Donald. 2001. Principles of Seed Science and Technology. 4ª. ed. Kluwer Academic Pub. Norwell, MA. USA. Desai, B.B. 2004. Seeds Handbook: Biology, Production, Processing, and Storage. Marcel Dekker, New York. FAO. 2006. Sistema de semillas de calidad declarada. Estudio FAO, Producción y protección vegetal, 185. Roma. Kelly. A.F., George, R.A.T. 1998. Encyclopaedia of Seed Production of World Crops. John Wiley & Sons, New York. HOOD E.E., HOWARD J. A. 2002. Plants as Factories for Protein Production. Kluwer Academic Pub. Dordrecht. HURTADO M. D., MERINO M.M.A. 2000. Cultivo de tejidos vegetales. Trillas, México. LOYOLA-VARGAS V.M. VAZQUEZ-FLOTA F.A. 2006. Plant Cell Culture Protocols. Humana Press. Totowa, New Yersey TRIGIANO R.N., GRAY D.J. 2000. Plant tissue Culture Concepts and Laboratory Exercises.CRC Press. Boca Ratón FL TRIGIANO R.N., GRAY D.J. 2005. Plant Development and Biotechnology.CRC Press. Boca Ratón FL Bibliografía complementaria: Artículos de investigación actualizados en revistas científicas

123



Unidad León



Temas Selectos en Ciencias Agrogenómicas II

Clave

Semestre 6

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso (X) Taller ( ) Lab ( ) Sem (X)

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Consolidar su formación mediante la discusión de proyectos de investigación que presenten un componente genómico, agrícola o social importante. Esta discusión se realizará directamente con investigadores de instituciones nacionales y extranjeras líderes en su área de investigación; esto brindará nuevas oportunidades de desarrollo de los estudiantes, así como proponer nuevos enfoques en los proyectos de investigación discutidos.

124

Índice temático

Unidad Tema Horas



72 0

Total 72 0

Contenido Temático

















125



Unidad León



Fronteras de la Genómica Agrícola II

Clave

Semestre 6

Créditos 12

Área



Nivel de Formación

Integrativo

Modalidad Curso ( ) Taller ( ) Lab ( ) Sem (X)

Tipo T ( X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 6 Total 108

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Consolidar la formación mediante contacto directo con líderes en distintas áreas de las ciencias agrogenómicas; tales como: bioinformática, genómica funcional, genómica agrícola, genómica comparativa, metagenómica, análisis computacional y experimental, genómica de plantas y patogenos, estadística y biotecnología. Esto les brindará una excelente perspectiva para continuar sus estudios o actividades profesionales en diferentes áreas de las ciencias

126

agrogenómicas.

Índice temático

Unidad Tema Horas



108 0

Total 108 0

Contenido Temático

















127



Unidad León



Inglés

Clave

Semestre 6

Créditos 6

Área


Nivel de Formación


Tipo T ( X ) P ( ) T/P ()


Horas

Duración: 18 semanas Semana Total semestre



Total 3 Total 54

Seriación

Ninguna ( )

Obligatoria ( )



Indicativa ( X )


Inglés


Inglés

Objetivo general: Adquirir habilidades que le permitan el uso del inglés como herramienta de aprendizaje, y como futuro profesional, poseer estrategias cognitivas y lingüísticas adecuadas a sus necesidades de actualización en su área. Objetivos específicos: 1. Intercambiar información sobre aspectos relacionados con lenguaje corporal y verbal.

128

2. Intercambiar información acerca de actividades y eventos deportivos. 3. Intercambiar información sobre el uso de la tecnología digital. 4. Intercambiar información sobre temas relacionadas con problemas actuales. 5. Intercambiar información sobre aspectos positivos y negativos de la televisión. 6. Intercambiar información sobre temas relacionados con actividades futuras.

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Lenguaje corporal 9 0

2 Deportes 9 0

3 Tecnología 9 0

4 Nuestro mundo 9 0

5 La televisión 9 0

6 Viendo hacia adelante 9 0 Subtotal 54 0

Total 54

Contenido Temático

Unidad Temas

1

Lenguaje corporal 1.1 Gramática. 1.1.1 Conectores que expresan contraste. 1.1.2 La terminación ing en los verbos. 1.1.3 Reciclaje de deducción y posibilidad en el pasado. 1.2 Vocabulario. 1.2.1 Relacionado con expresiones faciales. 1.2.2 Adjetivos que describen personalidad. 1.3 Pronunciación. 1.3.1 Entonación para expresar emociones. 1.4 Comprensión de lectura. 1.4.1 Leer artículos sobre psicología. 1.4.2 Leer anuncios sobre trabajos. 1.4.3 Leer un currículum. 1.5 Expresión escrita. 1.5.1 Escribir la descripción de un rostro. 1.6 Comprensión auditiva. 1.6.1 Escuchar una entrevista. 1.7 Expresión oral. 1.7.1 Describir un rostro. 1.7.2 Hacer inferencias acerca de la personalidad. 1.7.3 Hablar acerca de conflictos morales.

2

Deportes 2.1 Gramática. 2.1.1 Frases nominales. 2.1.2 Expresar propósito. 2.1.3 Verbos + infinitivo. 2.1.4 Verbos + ing. 2.1.5 Reciclaje de conectores y verbos con ing. 2.2 Vocabulario. 2.2.1 Relacionado con apariencia y salud. 2.3 Pronunciación. 2.3.1 Entonación de Question tags.

129

2.4 Comprensión de lectura. 2.4.1 Leer una prueba de inteligencia. 2.4.2 Leer un artículo de periódico. 2.4.3 Leer un resumen de un libro. 2.5 Expresión escrita. 2.5.1 Escribir ideas principales y secundarias. 2.6 Comprensión auditiva. 2.6.1 Escuchar una presentación. 2.6.2 Escuchar una plática radiofónica. 2.7 Expresión oral. 2.7.1 Hablar sobre la belleza y cómo se preserva. 2.7.2 Hablar acerca de las pruebas de inteligencia. 2.7.3 Hablar acerca de estilos de aprendizaje.

3

Tecnología 3.1 Gramática. 3.1.1 Repaso y extensión del presente perfecto con for y since. 3.1.2 Adverbios que se usan con el presente perfecto. 3.1.3 Reciclaje de pasado simple, used to, be used to, wish, if only. 3.2 Vocabulario. 3.2.1 Relacionado con internet. 3.3 Pronunciación. 3.3.1 Entonación de preguntas. 3.4 Comprensión de lectura. 3.4.1 Lectura de un artículo de internet. 3.4.2 Lectura de una encuesta de revista. 3.5 Expresión escrita. 3.5.1 Hacer una actividad tipo “chat”. 3.6 Comprensión auditiva. 3.6.1 Escuchar una entrevista. 3.6.2 Escuchar una plática. 3.7 Expresión oral. 3.7.1 Hablar sobre el uso de teléfonos celulares. 3.7.2 Hablar sobre la importancia del internet.

4

Nuestro mundo 4.1 Gramática. 4.1.1 Repaso y extensión de palabras que expresan cantidad. 4.1.2 Uso de verbos modales en voz activa y pasiva. 4.1.3 Repaso y extensión de reported speech. 4.1.4 Reciclaje de: will, going to, primer condicional y presente perfecto. 4.2 Vocabulario. 4.2.1 Relacionado con envases y alimentos transgénicos. 4.3 Pronunciación. 4.3.1 Acentuación en frases. 4.4 Comprensión de lectura. 4.4.1 Lectura de un resumen de un libro de ciencia. 4.4.2 Lectura de un artículo de revista. 4.5 Expresión escrita. 4.5.1 Escritura de un ensayo discursivo. 4.5.2 Escribir sobre preguntas frecuentes (FAQs) en internet. 4.6 Comprensión auditiva. 4.6.1 Escuchar a personas realizando una entrevista. 4.6.2 Escuchar un debate. 4.6.3 Escuchar una conferencia académica. 4.7 Expresión oral. 4.7.1 Hablar acerca de desperdicios. 4.7.2 Hablar acerca de los alimentos transgénicos.

130

5

La televisión 5.1 Gramática. 5.1.1Presente perfecto y progresivo. 5.1.2 Frases nominales. 5.1.3 Repaso de condicionales. 5.1.4 Reciclado de verbos modales en voz activa y pasiva. 5.2 Vocabulario. 5.2.1 Combinación fija de la palabra video. 5.2.2 Relacionado con géneros televisivos. 5.3 Pronunciación. 5.3.1 Acentuación de frases incompletas. 5.4 Comprensión de lectura. 5.4.1 Leer una reseña de un programa de televisión. 5.4.2 Leer un resumen de una revista. 5.5 Expresión escrita. 5.5.1 Escribir una reseña de un programa de televisión. 5.5.2 Escribir un código de conducta. 5.6 Comprensión auditiva. 5.6.1 Escuchar una llamada telefónica a una estación de radio. 5.7 Expresión oral. 5.7.1 Hablar acerca de programas de televisión. 5.7.2 Hablar acerca de hábitos y horarios para ver televisión.

6

Viendo hacia adelante 6.1 Gramática. 6.1.1 Funciones de los condicionales. 6.1.2 Futuro progresivo y futuro perfecto. 6.2 Vocabulario. 6.2.1 Relacionado con exámenes de certificación. 6.2.2 Relacionado con educación. 6.3 Pronunciación. 6.3.1 Entonación de frases. 6.4 Comprensión de lectura. 6.4.1 Leer sobre certificaciones del idioma. 6.4.2 Leer una página web. 6.4.3 Leer un artículo de periódico. 6.5 Expresión escrita. 6.5.1 Escribir un correo electrónico formal solicitando información. 6.6 Comprensión auditiva. 6.6.1 Escuchar una plática informal. 6.6.2 Escuchar el discurso de un político. 6.7 Expresión oral. 6.7.1 Expresar acuerdo y desacuerdo sobre educación. 6.7.2 Hacer predicciones.

Sugerencias didácticas: Exposición oral ( x) Exposición audiovisual ( ) Ejercicios dentro de clase ( x) Ejercicios fuera del aula ( ) Seminarios ( ) Lecturas obligatorias ( ) Trabajo de investigació ( ) Prácticas de taller o laboratorio ( ) Prácticas de campo ( ) Otras: ____________________ ( )

Mecanismos de evaluación del aprendizaje de los alumnos: Exámenes parciales ( x ) Examen final escrito ( x ) Trabajos y tareas fuera del aula ( x ) Exposición de seminarios por los alumnos ( ) Participación en clase ( x ) Asistencia ( x ) Seminario ( ) Otras:

131






Bibliografía complementaria: Harmer J. (2004). Just Grammar. Malasya: Ed. Marshal Cavendish.

132

SÉPTIMO SEMESTRE

133



Unidad León



Trabajo de Investigación I

Clave

Semestre 7

Créditos 30

Área



Nivel de Formación

Investigación

Modalidad Curso ( ) Taller ( ) Lab ( X ) Sem ( )

Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 25 Total 450

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Adquirir una formación integral en las ciencias agrogenómicas a través de su incorporación en proyectos de investigación o actividades profesionales en laboratorios o empresas biotecnológicas.

Índice temático

134

Unidad Tema Horas


1 Trabajo de investigación 90 360 Subtotal 90 360

Total 450

Contenido Temático


1 Trabajo de investigación


Exposición ( X ) Exámenes parciales ( )

Trabajo en equipo ( ) Examen final ( )

Lecturas ( X ) Trabajos y tareas ( )


Prácticas (taller o laboratorio) ( ) Participación en clase ( )







Bibliografía básica: Libros y revistas científicas en consonancia con el programa de trabajo establecido. Bibliografía complementaria: Libros y revistas científicas en consonancia con el programa de trabajo establecido.

135

OCTAVO SEMESTRE

136



Unidad León



Trabajo de Investigación II

Clave

Semestre 8

Créditos 30

Área



Nivel de Formación

Investigación

Modalidad Curso ( ) Taller ( ) Lab ( X ) Sem ( )

Tipo T ( ) P ( ) T/P ( X )


Horas




Total 25 Total 450

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Adquirir una formación integral en las ciencias agrogenómicas a través de su incorporación en proyectos de investigación o actividades profesionales en laboratorios o empresas biotecnológicas.

137

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Trabajo de investigación 90 360

90 360

Total 450

Contenido Temático


1 Trabajo de investigación


Exposición ( X ) Exámenes parciales ( )

Trabajo en equipo ( ) Examen final ( )

Lecturas ( X ) Trabajos y tareas ( )


Prácticas (taller o laboratorio) ( ) Participación en clase ( )







Bibliografía básica: Libros y revistas científicas en consonancia con el programa de trabajo establecido. Bibliografía complementaria: Libros y revistas científicas en consonancia con el programa de trabajo establecido.

138

Optativas

139



Unidad León



Metagenómica

Clave

Semestre 7

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T (X ) P ( ) T/P ( )

Carácter Obligatorio ( ) Optativo (X ) Obligatorio E ( ) Optativo E ( )

Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general:

Comprender los conceptos de metagenómica y la diversidad filogenética de

comunidades microbianas desde una perspectiva global utilizando herramientas de

metagenómica y bioinformática.

Índice temático

Unidad Tema Horas

140


1 Introducción a la metagenómica 8 0

2 Herramientas y metodologías en metagenómica 10 0

3 Metagenoma del océano 12 0

4 Metagenoma del suelo y otros ambientes 12 0

5 Enfoques metagenómicos para la obtención de genes y sustancias con utilidad biotecnológica

10 0

6 Ventajas y desventajas de la metagenómica en el estudio de comunidades complejas

10 0

7 Perspectivas a futuro, metagenómica funcional

10

Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Introducción a la metagenómica

2 Herramientas y metodologías en metagenómica

3 Metagenoma del océano

4 Metagenoma del suelo y otros ambientes

5 Enfoques metagenómicos para la obtención de genes y sustancias con utilidad biotecnológica

6 Ventajas y desventajas de la metagenómica en el estudio de comunidades complejas

7 Perspectivas a futuro, metagenómica funcional













Bibliografía básica: Artículos originales de revistas científicas. Chistoserdovai L. Functional metagenomics: recent advances and future challenges. Biotechnol Genet Eng Rev. 2010;26:335-52. Wooley JC, Godzik A, Friedberg I "A Primer on Metagenomics". PLoS Comput Biol 6(2):

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21415887

141

e1000667. 2010. doi:10.1371/journal.pcbi.1000667 Williamson, Shannon J. et al. ; “The Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition: Metagenomic Characterization of Viruses within Aquatic Microbial Samples”; PLoS ONE, 2008, 3(1):e1456. Bhaya, Devaki, et al.; "Population level functional diversity in a microbial community revealed by comparative genomic and metagenomic analyses”; The ISME Journal, 2007 Dec, 1(8):703-13. Fierer, Noah, et al.; “Metagenomic and Small-Subunit rRNA Analyses Reveal the Genetic Diversity of Bacteria, Archaea, Fungi, and Viruses in Soil”; Applied and Environmental Microbiology; Vol. 73, no. 21, pp. 7059-7066.

Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas. McHardy, Alice C; Rigoutsos, Isidore;” What's in the mix: phylogenetic classification of metagenome sequence samples”; Current Opinion in Microbiology, 2007 Oct, 10(5):499-503. Raes, Jeroen; Foerstner, Konrad Ulrich; Bork, Peer; “Get the most out of your metagenome: computational analysis of environmental sequence data”; Current Opinion in Microbiology, 2007 Oct, 10(5):490-8. Koonin, EV; “Metagenomic sorcery and the expanding protein universe”; Nature Biotechnology; Vol. 25, no.5, pp. 540-542.

142



Unidad León



Evolución Molecular

Clave

Semestre 7

Créditos 8

Área



Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T (X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general:

Comprender los diferentes procesos y mecanismos que participan en la generación de la

diversidad biológica, así como que asimilar los conceptos que definen a la especie como

la unidad biológica, taxonómica y evolutiva. Analizar las distintas teorías evolutivas,

sus alcances, limitaciones y su relevancia en el estudio de la evolución genómica.

143

Índice temático

Unidad Tema Horas


1 Las pruebas de la evolución 18 0

2 Mecanismos moleculares de variación y plasticidad y su participación en la generación de la diversidad genómica

18 0

3 Cronología de la vida 18 0

4 Introducción a las teorías sobre la evolución 18 0

Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Las pruebas de la evolución

1.1 Diferencias y similitudes de las formas de vida, el concepto de homología, el árbol de la vida, el progenote y la generación espontánea.

1.2 La mutabilidad temporal de los sistemas vivos.

1.3 Los tiempos geológicos y el registro fósil.

2 Mecanismos moleculares de variación y plasticidad y su participación en la generación de la diversidad genómica

2.1 Replicación y reparación.

2.2 Recombinación y rearreglos.

2.3 Transferencia horizontal: elementos y procesos.

2.4 Secuencias de inserción y transposones.

2.5 Virus, fagos y plásmidos como fuentes de variación genómica.

2.6 Islas genómicas patogénicas y simbióticas.

3 Cronología de la vida

3.1 Los conceptos de especie y la especiación.

3.2 La reconstrucción de linajes evolutivos.

3.3 El origen de la vida y el florecimiento de la diversidad.

4 Introducción a las teorías sobre la evolución

4.1 La selección natural.

4.2 El origen de los nuevos alelos y genes.

4.3 Alteraciones cromosómicas.

4.4 Deriva génica y selección.

4.5 Análisis evolutivo de la forma y la función.









144





Bibliografía básica: Artículos originales de revistas científicas. Chistoserdovai L. Functional metagenomics: recent advances and future challenges. Biotechnol Genet Eng Rev. 2010;26:335-52. Wooley JC, Godzik A, Friedberg I "A Primer on Metagenomics". PLoS Comput Biol 6(2): e1000667. 2010. doi:10.1371/journal.pcbi.1000667 Williamson, Shannon J. et al. ; “The Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition: Metagenomic Characterization of Viruses within Aquatic Microbial Samples”; PLoS ONE, 2008, 3(1):e1456. Bhaya, Devaki, et al.; "Population level functional diversity in a microbial community revealed by comparative genomic and metagenomic analyses”; The ISME Journal, 2007 Dec, 1(8):703-13. Fierer, Noah, et al.; “Metagenomic and Small-Subunit rRNA Analyses Reveal the Genetic Diversity of Bacteria, Archaea, Fungi, and Viruses in Soil”; Applied and Environmental Microbiology; Vol. 73, no. 21, pp. 7059-7066.

Bibliografía complementaria: Artículos originales de revistas científicas. McHardy, Alice C; Rigoutsos, Isidore;” What's in the mix: phylogenetic classification of metagenome sequence samples”; Current Opinion in Microbiology, 2007 Oct, 10(5):499-503. Raes, Jeroen; Foerstner, Konrad Ulrich; Bork, Peer; “Get the most out of your metagenome: computational analysis of environmental sequence data”; Current Opinion in Microbiology, 2007 Oct, 10(5):490-8. Koonin, EV; “Metagenomic sorcery and the expanding protein universe”; Nature Biotechnology; Vol. 25, no.5, pp. 540-542.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21415887

145



Unidad León



Desarrollo y Desafíos del Campo Mexicano

Clave

Semestre 8

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T (X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general:

Analizar el contexto histórico, económico, social, jurídico, político y ambiental en el

que se desarrollan las organizaciones sociales en el campo y confrontarlo con los

desafíos actuales y futuros del desarrollo sustentable y de equidad del medio rural.

Índice temático

Unidad Tema Horas

146


1 Tenencia de la tierra, manejo del agua agrícola y de los bosques a lo largo de la historia de México

12 0

2 Reforma Agraria y política de irrigación 12 0

3 Organización de productores 12 0

4 La modernización de la agricultura 12 0

5 Crisis económica políticas de ajuste y declinación rural 12 0

6 Principales desafíos 12 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 Tenencia de la tierra, manejo del agua agrícola y de los bosques a lo largo de la historia de México

1.1 Etapa prehispánica. Las culturas mesoamericanas. 1.2 La Colonia. La economía colonial. 1.3 El Siglo XIX. La economía del México independiente. 1.4 La Revolución. México en el periodo revolucionario. Los principales proyectos de la Revolución: Plan de Ayala y Plan de San Luis.

2 Reforma Agraria y política de irrigación 2.1 La creación de los ejidos y de las comunidades agrarias. 2.2 Las tierras comunales. 2.3 Principales fallas de la Reforma Agraria. 2.4 Los sujetos del desarrollo: ejidatarios, comuneros, jornaleros y pequeños propietarios. 2.5 Las grandes obras de irrigación y su administración. 2.6 Creación de las instituciones bancarias para el campo.

3 Organización de productores 3.1 La organización social corporativa. 3.2 Las organizaciones nacionales independientes.

4 La modernización de la agricultura 4.1 Creación de las instituciones proveedoras insumos agrícolas, seguros, comercialización e innovación tecnológica. 4.2 Políticas de precios de garantía. 4.3 Despegue del desarrollo agrícola. 4.4 El milagro mexicano. 4.5 La Revolución Verde. 4.6 El proceso de ganaderización del sureste.

5 Crisis económica, políticas de ajuste y declinación rural 5.1 Las políticas neoliberales. 5.2 El Tratado de Libre Comercio de América del Norte. 5.3 La Reforma del Artículo 27 constitucional. 5.4 La reducción del papel del estado en el desarrollo agrícola y rural. 5.5 Emigración y envejecimiento de los productores. 5.6 Feminización de la mano de obra. 5.7 Remesas de los emigrantes. 5.8 Nueva ruralidad.

6 Principales desafíos 6.1 Términos de intercambio campo-ciudad e industria-campo. 6.2 Estructura Agraria y dinámica demográfica actual. 6.3 Agricultura dual: Subsidios y apoyos diferenciados. 6.4 Inversión en bienes públicos.

147

6.5 Agricultura sostenible: agua, suelos y recursos fitogenéticos. 6.6 Revolución biotecnológica. 6.7 Cambio climático. 6.8 Soberanía y seguridad alimentarias. 6.9 La participación social en una democracia participativa.

6.10 La Agricultura por Contrato.

6.11 Derechos laborales en el campo.

6.12 Desarrollo del mercado interno y substitución de importaciones.

6.13 Creación de empresas sociales y su consolidación.

6.14 Articulación de capacidades institucionales para la productividad y competitividad.










Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Ciencias en Desarrollo Rural o Economía Agrícola



Bibliografía básica: Calva, J.L., Ivico, M., Ahumada Lobo. (2007). Educación, ciencia, tecnología y competitividad. México: UNAM. Cordera Campo, R., Lomelí Vanegas, L. (2011). Programas de combate a la pobreza rural en México. Reunión de Trabajo “La realidad de la pobreza rural” Comisión de Desarrollo del Senado de la República. UNAM, RIMISP y SAGARPA. México, DF. 26 de julio del 2011. Elizondo Mayer-Serra, C. (2011). ¿Por qué estamos como estamos? México: Editorial Debate-CIDE. Escalante Gonzalbo, P., García M.B., Jáuregui L., Vázquez, J.Z., Speckman, G.E., Garciadiego, J., Aboites, A.L. (2011). Historia mínima de México. México: Centro de Estudios Históricos, COLMEX. Florescano, E. (1984). Origen y desarrollo de los problemas agrarios de México (1500-1821). Colección Problemas de México. México: Ediciones Era. Ruíz, R.E. (2010) Mexico: Why a few are rich and the people poor? USA: University of California Press. Bibliografía complementaria: Díaz Soto y Gama, A. (2002). Historia del agrarismo en México: rescate, prólogo y estudio biográfico por Pedro Castro. México: Ediciones ERA / Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Iztapalapa / Conaculta–Fonca. Galeano, E. (1971). Las venas abiertas de América Latina. México: Siglo XXI. Gliessman,S. (2006). Agroecology: The ecology of sustainable food systems. (2

nd ed.) USA:

http://www.google.es/search?tbo=p&tbm=bks&q=inauthor:%22Jos%C3%A9+Luis+Calva%22

http://www.google.es/search?tbo=p&tbm=bks&q=inauthor:%22Ivico+M+Ahumada+Lobo%22

148

CRC Press. Gliessman, S., Rosemeyer, M. (2010). The conversion to sustainable agriculture: principles, processes, and practices. USA: CRC Press. González, J.A. (2003). Cultura y agricultura: transformaciones en el agro mexicano. México:

Universidad Iberoamericana. Middlebrook, J.K., Zepeda, E.E. (2003). Confronting development: assessing Mexico’s economic and social policy challenges. USA: Stanford University Press. Warman, A. (1976). Y venimos a contradecir: Los campesinos de Morelos y el Estado Nacional. México: SEP-CIESAS.

149



Unidad León



Innovación Tecnológica en el Área Agrícola

Clave

Semestre 8

Créditos 8

Área


Ciencias Agrícolas

Nivel de Formación

Integrativo


Tipo T (X ) P ( ) T/P ( )


Horas




Total 4 Total 72

Seriación

Ninguna ( X )

Obligatoria ( )



Indicativa ( )



Objetivo general: Analizar los procesos de innovación tecnológica en los que se fundamentan la productividad y competitividad de las empresas. Así como analizar el papel de las actividades de investigación, desarrollo tecnológico, validación, transferencia de tecnología y capacitación en los procesos de innovación

Índice temático

150

Unidad Tema Horas


1 La economía del conocimiento 12 0

2 La importancia de la innovación tecnológica 12 0

3 El proceso de innovación tecnológica 12 0

4 Marco legal de la innovación 12 0

5 Fomento de la innovación tecnológica 12 0

6 Innovación en cadenas agroalimentarias 12 0 Subtotal 72 0

Total 72

Contenido Temático


1 La economía del conocimiento 1.1 Definición de tecnología. 1.2 Definición de innovación tecnológica. 1.3 Relación entre innovación productividad y competitividad.

2 La importancia de la innovación tecnológica 2.1 Para la productividad de las empresas. 2.2 Para la productividad y competitividad de las cadenas de valor.

3 El proceso de innovación tecnológica 3.1 Investigación básica. 3.2 Investigación aplicada. 3.3 Desarrollo tecnológico. 3.4 Validación. 3.5 Transferencia tecnológica y adopción. 3.5.1 Incentivos. 3.5.2 Asistencia técnica. 3.5.3 Capacitación.

4 Marco legal de la innovación 4.1 Ley de Ciencia y Tecnología. 4.2 Ley de Propiedad Intelectual. 4.2.1 Patentes. 4.2.2 Derechos de autor. 4.3 Ley de Semillas. 4.3.1 Certificados del obtentor.

5 Fomento de la innovación tecnológica 5.1 Papel del estado y del sector privado en la innovación tecnológica. 5.2 El financiamiento a la ciencia, el desarrollo tecnológico y la innovación.

6 Innovación en cadenas agroalimentarias 6.1 Actores y estrategias básicas de mercadotecnia en las cadenas agroalimentarias. 6.2 Comportamiento del consumidor y la innovación agroalimentaria. 6.3 Diseño y desarrollo de nuevos productos orientados por las preferencias del consumidor. 6.4 Tendencias de la innovación en el procesamiento y empaque. 6.5 Innovación tecnológica y logística. 6.6 Integración de la innovación en las estrategias de la empresa.




151







Título o grado Maestro(a) o Doctor(a) en Ciencias en Economía Agrícola



Bibliografía básica: Brambila Paz, J.J. (2006). En el umbral de una agricultura nueva. México: Universidad Autónoma Chapingo. Jongen, W.M.F., Meulenberg, M.T.G. Eds. (2005). Innovation in agri-food systems. The Netherlands: Wageningen, Academic Publishers. Maharaj, N., Dorren, G. (1995). The game of the rose: The third world in the flower trade. The Netherlands: Published for the Institute for Development Research Amsterdam by International Books. Ziegler, C. (2007). Favored flowers: culture and economy in a global system. United States: Duke University Press. Bibliografía complementaria: Dole, J.M., Wilkins, H. F. (1999). Floriculture: principles and species. New Jersey, USA: Prentice Hall. Shariff, M.H., Kahlil, T.M. Eds. (2008). Management of technology innovation and value creation. New Jersey, USA: World Scientific Publishing Co.

TOMO II PROGRAMAS DE ESTUDIO DE LAS …. Dictámenes de... · Exposición ( X ) Exámenes parciales...

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