UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del...
-
Upload
aragnaculture -
Category
Documents
-
view
925 -
download
4
Transcript of UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del...
![Page 1: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/1.jpg)
Paul Laissue MD, PhDUnidad de Genética-Grupo GENIUROS
EMCS-Universidad del Rosario
UTLS-24 de octubre de 2012
![Page 2: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/2.jpg)
•Before DarwinBefore Darwin
•Lamarckismo vs DarwinismoLamarckismo vs Darwinismo
•Las leyes de MendelLas leyes de Mendel
•ADN: estructura y funciónADN: estructura y función
•Mutaciones del ADNMutaciones del ADN
•Secuenciación y arraysSecuenciación y arrays
•Medicina molecular del siglo XXIMedicina molecular del siglo XXI
ESTRUCTURAESTRUCTURA
![Page 3: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/3.jpg)
Época prehistóricaÉpoca prehistórica
•La genética existe desde siempre, por comparación de la similitud de los rasgos familiares
Hace 10.000 años: cruces de animales domesticados y plantas
![Page 4: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/4.jpg)
Los griegos (Los griegos (400-300 A.C)
Hipócrates: Pangénesis
Nicolaas Hartsoeker, 1695
Aristóteles
Los rasgos semejan frecuentemente los de generaciones anteriores
No todos los rasgos se heredan
Las partes de cuerpo mutiladas no se heredan
Se hereda la capacidad de producción de los caracteres
![Page 5: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/5.jpg)
Siglos XV a XVIII: hacia la teoría de la evoluciónSiglos XV a XVIII: hacia la teoría de la evolución
•Siglos XV a XVII: la vida en la tierra se desarrolló mecanicamente sin intervención divina
•Siglo XVIII: Pierre de Maupertuis: las modificaciones establecidas durante la reproducción se acumulan para generar nuevas razas o especies
•Siglo XVIII: Georges-Louis Buffon. Las 200 especies de mamiferos conocidas descienden de 38 ancestros comunes
•Siglo XVIII: Carl von Linné: padre de la taxonomía
![Page 6: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/6.jpg)
Siglo XIX: la transformación de las especiesSiglo XIX: la transformación de las especies
•Jean-Baptiste Lamarck (1744-1829): Filosofía zoológica: 1815
Cambio del medio ambiente
Cambio necesidades
Cambios heredables
Cambio comportamiento
Cambio uso órganos
![Page 7: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/7.jpg)
Siglo XIX: la transformación de las especiesSiglo XIX: la transformación de las especies
•Charles Darwin (1809-1882)
Beagle: 1831-1836
Clasificación de especímenes
Textos de geología
Experimentos en plantas
El origen de las especies, 1859
![Page 8: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/8.jpg)
Charles Darwin: la teoría de la evoluciónCharles Darwin: la teoría de la evolución
•Este proceso lento resulta en cambios en las poblaciones para adaptarse a sus entornos, y en última instancia, estas variaciones se acumulan con el tiempo para formar nuevas especies.
•Los individuos de una población varían considerablemente.
•Gran parte de esta variación es heredable.
•Los individuos menos adecuadas para el medio ambiente tienen menos probabilidades de sobrevivir y menos probabilidades de reproducirse.
• Los individuos más adaptados al medio ambiente tienen más probabilidades de sobrevivir y más posibilidades de reproducirse y de dejar sus rasgos hereditarios a las generaciones futuras, lo que produce el proceso de selección natural.
![Page 9: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/9.jpg)
Darwin vs LamarckDarwin vs Lamarck
![Page 10: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/10.jpg)
Gregorio Mendel: el padre de la genéticaGregorio Mendel: el padre de la genética
•Leyes de Mendel: 1866/1900
•Primera ley: Principio de la segregación
Rasgos dominantes y recesivos
![Page 11: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/11.jpg)
Gregorio Mendel: el padre de la genéticaGregorio Mendel: el padre de la genética
•Leyes de Mendel: 1866/1900
•Segunda ley: Principio de la transmisión independiente
![Page 12: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/12.jpg)
Gregorio Mendel: el padre de la genéticaGregorio Mendel: el padre de la genética
•Leyes de Mendel: 1866/1900
•Segunda ley: Principio de la transmisión independiente
![Page 13: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/13.jpg)
Organismo
Sistemas(Cardiovascular)
Organos
Corazón
Vasos sanguíneos
T. Muscular liso
Tejidos
T. Epitelial
T. Conectivo
Células
MoléculasAtomos
Proteínas
Núcleo
Niveles de organización de los seres vivosNiveles de organización de los seres vivos
![Page 14: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/14.jpg)
Estructura subcelularEstructura subcelular
![Page 15: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/15.jpg)
46 cromosomas23 origen ♀23 origen ♂
Núcleo de una célula somática humanaNúcleo de una célula somática humana
![Page 16: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/16.jpg)
Cromosoma mitótico completo
Sección condensada del cromosoma
Sección extendida del cromosoma
Cromatina de 30 nm formando nucleosomas
Cromatina
ADN
Disección molecular de un cromosoma humanoDisección molecular de un cromosoma humano
![Page 17: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/17.jpg)
•Doble hélice antiparalela•Esqueleto fosfato•Desoxiribosa•Bases nitrogenadas: A-T-G-C
Ley de complementariedad de bases
1953
Estructura molecular del ADNEstructura molecular del ADN
![Page 18: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/18.jpg)
•Organismos: codificar y transmitir la información molecular necesaria a la
herencia
•Células: garantizar la renovación celular (mitosis) por replicación
•Permitir la expresión de genes y la síntesis de proteínas (transcripción y
traducción): dogma central de la biología molecular (ADN-ARN-Proteína)
•Regulación genética y genomica
Funciones del ADNFunciones del ADN
![Page 19: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/19.jpg)
•Proceso mediante el cual una célula madre se divide en dos células hijas idénticas
•La composición cromosómica diploide se mantiene (2n)
Mitosis y replicación del ADNMitosis y replicación del ADN
![Page 20: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/20.jpg)
•Base molecular de la técnica de PCR
que permite la amplificación de ADN
Replicación del ADNReplicación del ADN
![Page 21: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/21.jpg)
•Regiones promotoras
•Exón: secuencia codificante
•Intrón: secuencias no codificantes separando los exones
Estructura de los genesEstructura de los genes
![Page 22: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/22.jpg)
ADN
ARN
Proteína
Dogma central de la biología molecularDogma central de la biología molecular
![Page 23: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/23.jpg)
Transcripción y traducción del ADNTranscripción y traducción del ADN
![Page 24: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/24.jpg)
Traducción: ARNm-ARNt-Protéina
Transcripción y traducción del ADNTranscripción y traducción del ADN
![Page 25: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/25.jpg)
•Código
Universal
El código genéticoEl código genético
![Page 26: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/26.jpg)
Algunas mutaciones del ADNAlgunas mutaciones del ADN
![Page 27: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/27.jpg)
2001: el Genoma Humano2001: el Genoma Humano
![Page 28: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/28.jpg)
•Determinar la secuencia completa de un individuo “sano”
•Crear una base de datos para guardar esta información
•Desarrollar herramientas informáticas de análisis
•Incentivar la creación de tecnología para el desarrollo de otras áreas:
transcriptómica y proteómica
•Crear un espacio legal, ético y social para su utilización
El Genoma Humano (1990-2001) ObjetivosEl Genoma Humano (1990-2001) Objetivos
![Page 29: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/29.jpg)
•3.000.000.000 nucleótidos
•~25000-30000 genes
•SNPs
•Pseudogenes
•Regiones repetidas
•Transposones
•Retrotransposones
•Disponible
El Genoma Humano-ResultadosEl Genoma Humano-Resultados
![Page 30: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/30.jpg)
•Comparación de secuencias entre individuos
•Diagnóstico molecular
•Genómica
•Transcriptómica
•Proteómica
•Evolución
•Genética de poblaciones
El Genoma Humano: algunas aplicacionesEl Genoma Humano: algunas aplicaciones
![Page 31: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/31.jpg)
•PCR: FSHR, LHR, BMP15, GDF9
Técnicas de secuenciaciónTécnicas de secuenciación
![Page 32: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/32.jpg)
T443C
BMP15-Exon 2
WT
Técnicas de secuenciación de primera generaciónTécnicas de secuenciación de primera generación
![Page 33: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/33.jpg)
T443C
BMP15-Exon 2 WT
•C.557C>A → p.Ser186Tyr
•Score SIFT 0,03 → Efecto deletéreo potencial
•Ausente en los controles
Técnicas de secuenciación de primera generaciónTécnicas de secuenciación de primera generación
![Page 34: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/34.jpg)
Ictiosis Curth-MacklinIctiosis Curth-Macklin
Fonseca et al. Br J Dermatol. 2012, in press
Enfermedad ADMutaciones KRT1
![Page 35: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/35.jpg)
Ictiosis Curth-Macklin: mutaciones de KRT1Ictiosis Curth-Macklin: mutaciones de KRT1
KRT1-c.1577delG
Fonseca et al. Br J Dermatol. 2012, in press
KRT1-p.Gly526Alafs*88
![Page 36: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/36.jpg)
Los microarreglosLos microarreglos
Microarreglo (microarray o “chip”): superficie sólida en la cual se fijan
fragmentos de ADN en posiciones específicas.
Primera descripción por microtecnología: 1995
Trends Biotechnol. 1998 16: 301-6.
Microspot mecánico
Inyección
![Page 37: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/37.jpg)
Los microarreglos: algunas aplicacionesLos microarreglos: algunas aplicaciones
•Expresión global: Transcriptómica
•GWAS (Asociación de Genoma Completo)
•Secuenciación de nueva generación (NGS)
•CGH (Hibridización Genómica comparada)
•ChIP-seq
•CNVs
•Proteómica
![Page 38: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/38.jpg)
Microarreglos de expresión: transcriptómica globalMicroarreglos de expresión: transcriptómica global
![Page 39: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/39.jpg)
Secuenciación a gran escala con microarreglosSecuenciación a gran escala con microarreglos
Métodos de NGS
•Microelectroforéticos
•Hibridización
•Análisis de moléculas Tr
•Arreglo cíclico
![Page 40: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/40.jpg)
NGS: métodos de inmobilización/amplificaciónNGS: métodos de inmobilización/amplificación
Roche 454, Polonator, SOLiD
Solexa/Illumina
Emulsión/PCR, y Amplificación en fase sólida
![Page 41: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/41.jpg)
NGS: secuenciaciónNGS: secuenciación
![Page 42: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/42.jpg)
NGS: resultadosNGS: resultados
![Page 43: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/43.jpg)
NGS: tipos de alteraciones genómicas detectablesNGS: tipos de alteraciones genómicas detectables
![Page 44: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/44.jpg)
Exoma(30Mb)
NGS: algunas aplicacionesNGS: algunas aplicaciones
![Page 45: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/45.jpg)
PaquidermoperiostosisPaquidermoperiostosis
Enfermedad ARMutaciones HPGD (-)
Secuenciación exoma 50XHum Mutat. 2012, 33:1175-81
![Page 46: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/46.jpg)
PaquidermoperiostosisPaquidermoperiostosis
Secuenciación exoma 50X
Mutaciones de SLCO2A1
Hum Mutat. 2012, 33:1175-81
![Page 47: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/47.jpg)
Matzuk et al. Nat Med. 2008 14:1197-213.
La reproducción: un rasgo fenotípico complejoLa reproducción: un rasgo fenotípico complejo
![Page 48: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/48.jpg)
Genes implicados en la función testicular murinaGenes implicados en la función testicular murina
![Page 49: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/49.jpg)
Genes implicados en la función testicular murinaGenes implicados en la función testicular murina
![Page 50: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/50.jpg)
Qué genes pueden estar implicados en la disfunción Qué genes pueden estar implicados en la disfunción reproductiva de la pareja hipofértil?reproductiva de la pareja hipofértil?
Secuenciación simultánea de regiones codificantes Secuenciación simultánea de regiones codificantes de 387 genesde 387 genes
![Page 51: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/51.jpg)
Cobertura y diseño del método diagnósticoCobertura y diseño del método diagnóstico
385 genes en 7 categorías funcionales385 genes en 7 categorías funcionales
•♀ Gametogénesis, Foliculogénesis, Ovulación, Eje HHG
•♀ Fecundación•♀ Efecto Materno•♀ Implantación
256 genes256 genes
•♂ Espermatogénesis•♂ Fecundación•♂ Eje HHG
277 genes277 genes
145 genes comunes145 genes comunes
![Page 52: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/52.jpg)
Genómica del siglo XXIGenómica del siglo XXI
•Diagnóstico: enfermedades monogénicas y complejas
•Pronóstico: cáncer
•Tratamiento: farmacogenética
![Page 53: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/53.jpg)
![Page 54: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/54.jpg)
Cuál es el origen genético del Síndrome de Miller?
Nat Genet. 2010 : 30-5
![Page 55: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/55.jpg)
NGS: identificación de genes causales de patologías mendelianasNGS: identificación de genes causales de patologías mendelianas
Nat Genet. 2010 : 30-5
![Page 56: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/56.jpg)
DHODHConfirmación por secuenciación directa en 4 pacientes no relacionados
NGS: identificación de genes causales de patologías mendelianasNGS: identificación de genes causales de patologías mendelianas
Nat Genet. 2010 : 30-5
![Page 57: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/57.jpg)
NGS: conclusionesNGS: conclusiones
![Page 58: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/58.jpg)
NGS: conclusionesNGS: conclusiones
![Page 59: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/59.jpg)
![Page 60: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/60.jpg)
Disección molecular de un cromosoma humanoDisección molecular de un cromosoma humano
![Page 61: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/61.jpg)
Orden1600-1850
Antes de darwin: Histoire de la pensée évolutionnistewikipipedia
LamarckDarwin
1866-1900Mendel
![Page 62: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/62.jpg)
KGN KGNTransfección
pFOXL2Mock(Vector Vacío)
Extracción ARNs totales
Síntesis de ADNc
Microarreglos de expresión: transcriptómica globalMicroarreglos de expresión: transcriptómica global
PCR cuantitativa
Microarrays de expresión
Permiten la comparación del efecto de dos condiciones sobre el nivel
de transcrito a una escala genómica global
Micorarrays de expresión
![Page 63: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/63.jpg)
Répression / Induction
-4,00
-2,00
0,00
2,00
4,00
6,00
8,00
JAM
2
StA
R
INH
BB
ES
R1
HS
D17
B4
CA
V1
NC
OR
1
FU
SIP
BS
T2
ZN
F50
3
AR
GL
TL
2
CY
P19
A1
CR
EB
3L2
BC
DO
2
HS
D17
B1
CA
V2
BM
P4
BC
L2
TG
FB
R2
PT
GS
1
CD
K6
SO
X9
FS
T
FO
XL
2
AC
DK
C5
HS
D3B
1
FS
HR
INH
BA
ES
R2
BM
P6
AC
VR
1B
OS
R2
PT
GS
2
*
****
**
n=3 (tres transfecciones indépendientes)
* = p<0.025 for a one-tailed test
Biosíntesis de prostanoides
Vía de señalización TGFβBiosíntesis de
esteroides
induction
represión
Microarreglos de expresión: transcriptómica globalMicroarreglos de expresión: transcriptómica global
![Page 64: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/64.jpg)
Eur J Endocrinol. 2006, 154:739-44.
Análisis de resultadosAnálisis de resultados
![Page 65: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/65.jpg)
NGS: métodos de inmobilización/amplificaciónNGS: métodos de inmobilización/amplificación
Emulsión/PCR, y Amplificación en fase sólida
Roche 454, Polonator, SOLiD
Solexa/Illumina
![Page 66: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/66.jpg)
NGS: identificación de variantes patogénicasNGS: identificación de variantes patogénicas
![Page 67: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/67.jpg)
NGS: exoma y genómica médicaNGS: exoma y genómica médica
![Page 68: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/68.jpg)
•Electroforesis sobre gel de agarosa y visualización UV
Purificación + secuenciación
Técnicas de secuenciación de secuenciación directaTécnicas de secuenciación de secuenciación directa
![Page 69: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/69.jpg)
Nature. 2009 461: 272–276
Es posible cartografiar patologías monogénicas a partir de la secuenciación del exoma de algunos individuos?
NGS: identificación de genes causales de patologías mendelianasNGS: identificación de genes causales de patologías mendelianas
![Page 70: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/70.jpg)
NGS: identificación de genes causales de patologías mendelianasNGS: identificación de genes causales de patologías mendelianas
Nature. 2009 461: 272–276
![Page 71: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/71.jpg)
NGS: identificación de genes causales de patologías mendelianasNGS: identificación de genes causales de patologías mendelianas
Nature. 2009 461: 272–276
![Page 72: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/72.jpg)
NGS: secuenciaciónNGS: secuenciación
Solexa/Illumina
![Page 73: UTLS COLOMBIA: De la genética clásica a la genómica funcional del siglo XXI: evolución del estudio de los factores determinantes de la salud y la enfermedad](https://reader034.fdocuments.co/reader034/viewer/2022042701/55a0481c1a28abe1728b4580/html5/thumbnails/73.jpg)
La Edad Media: ideas evolucionistasLa Edad Media: ideas evolucionistas
•Al-Jahiz (776-868): lucha por la existencia, transformación de las especies, influencia del medio ambiente
•Siglo X: (Ikhwan al-Safa): creación de los mundos y de la evolución
• Nasir ad-Din at-Tusi (1201-1274): « takamul » (perfeccionamiento): la transformación del medio ambiente conduce a la evolcución de las especies
• Ibn Khaldoun (1338-1405): « el plano humano se alcanza a partir del mundo de los monos »