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遺伝情報処理ソフトウェア Ver.15 遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX Ver.15は、 多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。 核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、プラスミドマップ、 シーケンスアセンブラー、次世代シーケンス解析機能、配列データベース等 多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。 Windows プロジェクトウィンドウ( 配列エディタ ) ・ 波形ファイルの読み込み ( 配列のみ ) サーキュラーのマップ表示 配列の構築履歴の記録 ( Gibson Assembly のみ ) ・ モチーフ検索 ・ パラレルエディタ 核酸・アミノ酸配列入力編集 ATGC ( シーケンスアセンブラー ) ・ 核酸配列自動結合 ・ 波形のサポート ・ トリミング処理 ファイル読み込み方法の追加( CEP ファイル ) 配列・波形同時表示機能 ( 12 月 1 日リリース予定 ) ※ SNP 検出参考時間 (PCR 重複除去、 Realignment およびフィルタ処理を含む) Core i5 3.20GHz HDD1TB メモリ 40GB の PC で 参照配列長 1,144,377bp カバレッジ 36 で 93 秒程度 参照配列長 4,903,504bp カバレッジ 29 で 818 秒程度 SNP 検出機能 ゲノム種比較機能( 微生物 ) ・ クオリティチェック機能 ・ トリミング機能 ・ 配列組成表示機能 ・ 配列全体 MAP 表示機能 ・ 発現量解析機能 ( カウントのみ ) ・ De Novo Assembly MIRA ・ 解析履歴機能 ・ 対応形式:fastq , fna/qual , csfasta ・ マッピング機能 ・ BAM/SAM形式データ読み込み機能 ・ ペアエンドマッピング ・ 複数の染色体別に同時マッピング ・ 参照配列のFeatureの表示 ・ 変異表のCSV出力、印刷 ・ De Novo Assembly Forge NGS ( 次世代シーケンス解析機能 )

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Page 1: Ver - GENETYX · 版 遺伝情報処理ソフトウェア genetyx ver.15は、 多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。

遺伝情報処理ソフトウェア Ver.15

版遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX Ver.15は、多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、プラスミドマップ、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンス解析機能、配列データベース等多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。

Windows

● プロジェクトウィンドウ( 配列エディタ )

 ・ 波形ファイルの読み込み ( 配列のみ )

 ● サーキュラーのマップ表示

 ● 配列の構築履歴の記録

  ( Gibson Assembly のみ )

 ・ モチーフ検索

・ パラレルエディタ

核酸・アミノ酸配列入力編集

ATGC ( シーケンスアセンブラー ) ♣・ 核酸配列自動結合

・ 波形のサポート

・ トリミング処理

● ファイル読み込み方法の追加( CEP ファイル )

● 配列・波形同時表示機能

         ( 12 月 1 日リリース予定 )

※ SNP 検出参考時間 

(PCR 重複除去、 Realignment およびフィルタ処理を含む)

  Core i5 3.20GHz HDD1TB メモリ 40GB の PC で

参照配列長 1,144,377bp カバレッジ 36 で 93 秒程度

参照配列長 4,903,504bp カバレッジ 29 で 818 秒程度

● SNP 検出機能 ▲

● ゲノム種比較機能( 微生物 ) ▲

・ クオリティチェック機能

・ トリミング機能

・ 配列組成表示機能

・ 配列全体 MAP 表示機能

・ 発現量解析機能 ( カウントのみ ) ▲

・ De Novo Assembly MIRA ▲

・ 解析履歴機能

・ 対応形式:fastq , fna/qual , csfasta

・ マッピング機能

・ BAM/SAM形式データ読み込み機能

・ ペアエンドマッピング

・ 複数の染色体別に同時マッピング

・ 参照配列のFeatureの表示

・ 変異表のCSV出力、印刷

・ De Novo Assembly Forge

  

 ★♣NGS ( 次世代シーケンス解析機能 )

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●印は GENETYX Ver.15 で機能アップされた項目です。

核酸配列解析

アミノ酸配列解析

配列データベース● データベース構築・検索

 ● MySQL サーバーを使用して

   データベースの共有

 ● 配列の構築履歴の記録

インターネット検索支援

配列の相同性解析・ ホモロジー解析

 ・ 検索結果をマルチプルアライメント風

   に表示

・ Local BLAST 検索

・ NCBI BLAST 検索

・ cRNA プローブ検索

・ PCR Primer 検索

・ MUMmer 検索

・ SNPs 検索

・ アノテーション転記機能 ♦・グローバルホモロジー

・ マキシマムマッチング

● マルチプルアライメント

 ・ Muscle によるマルチプルアライメント

 ・ Clustal W による

マルチプルアライメント ▲

 ・ MAFFT による

マルチプルアライメント▲

 ● Similarity Plot

 ・ 分子進化系統樹

 ● 系統樹 PHYLIP による解析 

・ ハープロット   

・ 配列データの組成分析

・ シグナルペプチドの予測

・ 配列組換え機能

・ タンパク質の等電点予測

・ 核酸配列への逆翻訳

・ 特許出願フォーム出力

・ PEST 配列検索

・ タンパク質の親水性 / 疎水性表示

・ タンパク質の疎水性クラスター解析

・ エドモンソン・ホイール・プロット法による

  タンパク質の構造予測

・ タンパク質のへリックス構造展開表示

・ T 細胞抗原性部位の予測

・ アミノ酸配列からの制限酵素の解析

・ ペプチダーゼ処理

・ タンパク質二次構造予測 ( Chou-Fasman )

・ Conformational Profile ( Chou-Fasman )

・ タンパク質の二次構造予測 ( GOR )

・ Entrez 検索

・ 配列データの組成分析

・ アミノ酸配列への翻訳

・ 特許出願フォーム出力

・ GC 含量分布図作成

・ di-Nucleotide 含量分布図作成

・ ダイレクトリピート、

  インバーテッドリピート部位の解析

・ 制限酵素認識部位解析

・ サイレント変異導入設計支援

・ オープンリーディングフレームの解析

・ コドンフレーム別含量分布図作成

・ プロモーター部位の解析

・ PCR プライマー部位の解析

● Primer 3 ▲

・ ハイブリダイゼーション機能

・ tRNA 領域の解析

・ ヘアピン構造部位の解析

・ パリンドローム部位の解析

・ RNA 二次構造予測

・ siRNA ターゲット部位予測

・ エクソン部位検索

・ コドン頻度表を使ったコード領域予測

・ Fickett 法を使ったコード領域予測

・ CpG island 候補検索

・ 5’3’ スプライス部位候補検索

・ Polymerase Ⅱ プロモーター部位

  候補検索

・ PolyA signal 候補検索

・ ゲノム編集機能 CRISPR / Cas9 ガイド

  RNA 設計支援★▲

● Gibson Assembly

PlasDraw

★ 64bit OS のみ対応 ♦ 64bit OS 推奨  ♣単体ソフトウェアとして別途販売。▲ Clustal W , MAFFT , RAxML ,発現量解析, MIRA , SNP , Primer は別途インストールが必要です。 ゲノムデータは別途ダウンロードが必要です。

・ プラスミド地図作図

取 扱 店

*会社名・製品名は各社の商標または登録商標です。*記載事項は機能改良のため予告なく変更することがあります。

CATALOGUE:190902

GENETYX URL https://www.genetyx.co.jp/TEL 03(3406)3241(大代表)FAX 03(3406)4881

TEL 06(6304)2371(大代表)FAX 06(6304)1086 

東京都渋谷区渋谷3丁目8番12号E-mail:[email protected]

大阪市淀川区西中島6丁目7番8号E-mail:[email protected]

本  社  〒150-0002

大阪支店  〒532-0011

 

 

:Microsoft Windows 10 / 8.1 が動作する機種:Microsoft Windows 10 / 8.1  以上全て日本語版、32bit OS / 64bit OS:2GB 以上(推奨 4GB 以上):1GB 以上の空き容量:光学ドライブ (インストール時に利用します):本製品のご使用にはインターネットによるライセンス認証が必要

対応機種対応 OSメモリストレージ 容量ハードウェアその他

対応機種対応 OSメモリストレージ 容量ハードウェアその他

■ 動作環境■ 動作環境年間の利用料金はかかりません!お得な追加ライセンスもご用意しております!

まずはお問い合わせください。

ホモロジー解析

マルチプルアライメント

分子進化系統樹

Gibson Assembly

上記製品の詳細につきましては HP または各製品の             カタログをご参照ください

DEMO 版取得先  URL https://www.genetyx.co.jp/products/download/genetyx_15_demo 

●Macintosh 版 ネットワーク版 別途ご用意しております。 ●Windows 版 ATGC GENETYX NGS 別途単体販売をしております。

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