propiedadespropiedades

eléctricaseléctricas

1952

1976

1985

1991

2003200420052006

20022001

1993

deposición deposición carbón carbón 

vaporizadovaporizado

C60

NTC en hollín

paredparedsencillasencilla

NEC, JapónNEC, JapónIBM, EUAIBM, EUA

1995

Dinámica MolecularDinámica MolecularREBOREBO

URSSURSSRadushkevichLukyanovich

1960

1970

AplicacionesAplicaciones

Sistema de simulación por dinámica molecular de interacciones entre nanotubos de carbono de pared sencilla y diferentes polímeros

Cro

nogr

ama 

de lo

s na

notu

bos 

de c

arbó

n (N

TC)

Diagrama MoSDAS 

user

DNA.xyz

DNA.crdDNA.top

bio.pdb DNA.pdbCNT.pdb

centered.g96CNT.topCNT.g96 gromacs.g96

CNT.itp DNA.itp ions.itpwater.itpposre_CNT.itp

input.mdpindex.ndx init.g96 DNA_CNT.top

topol.tpr

nucInput.py

sed edition

measuremoleculeLenght

moved withVMD script

sed editionsed edition

measuremoleculeLenght

developmentof the file  complete the

input templete

developmentof the file 

Myrna I. Merced Serrano1, Raúl Colón2, José O. Sotero Esteva1

1. Departamento de Matemáticas, 2. Departamento de Física y Electrónica Universidad de Puerto Rico en Humacao

MoSDAS­GUI●  integra cuatro paquetes de 

simulación de dinámica molecular usando cuatro lenguajes de programación.

● Incorpora dos métricas especialmente diseñadas para conformación de polímeros sobre NTCs

● proveerá biblioteca de especificaciones físicas para distintos polímeros y diferentes tipos de interacción

Mon

ómer

o d

e es

tiren

o

vista lateralVista desde adentrodel tubo

ADN de hebra sencilla

Importancia:Importancia:

●utilidad de nanutubos funcionalizados en la fabricación de  sensores

●estudios de efectos de interacción de CNT con polímeros biológicos

Objetivo:Objetivo:

Construir un herramienta que: ●presente interfaz fácil de usar,

●agilice la utilización de programado complejo de simulación de dinámica molecular,

●acopie parámetros físicos apropiados,

●presente funciones de distribución apropiadas para este tipo de estudio.

Este proyecto es financiado por el  proyecto Partnership for Research and Education in Materials (PREM­UPRH).  Myrna I. Merced agradece a los proyectos PREM­UPRH, Undergraduate Research in Mathematics for Academic Achievement (URMAA) y RISE por su auspicio.  Raúl Colón agradece el apoyo del proyecto UPRH Minority Access to Research Careers.  José O. Sotero Esteva agradece el auspicio de PREM­UPRH y URMAA.

Simulación preliminar demuestra viabilidad de la simulación con otros polímeros.  Ya había sido hecha con ADN.

URMAAURMAA

NSF­DMR­353730NSA H98230­04­C­0486NIH 5T34GM008156­17NIH 1R25GM075348­01A1