TALLER 3
GUIA DIDÁCTICA
Bioinformática EstructuralTALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES
2012
Bioinformática Estructural 2
MODELADO DE NUEVAS ESTRUCTURAS y/o estudio gráfico de estructuras
problemas
1 - Tomen como secuencia o estructura problema: Sebastian: la secuencia problema que traes de tu
proyecto (enviármela por email) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero
puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por email)
Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema
Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por email)
Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos
Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados
Marcela y Diego: Va secuencia por email de (transportadores de ácidos grasos).
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2 - Con sus secuencia problema realizaremos el ejercicio de superposición (SAS), selecciòn de proteína template, modelado y observaciòn de template y modelos con los tutoriales del Taller 1 y 2
3 – Aquellos que trabajen sobre PDBs (y no tengan que modelar) investigarán la informaciòn (respondiendo a la pregunta,p or ejemplo: cuales proteinas son similares a la problema?), analizando la estructura de proteínas alineadas
Otros tutoriales a ser usados como referencia: TALLER.3.protein_course_2006.ppt
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Suerte, paciencia y mucha perserverancia!
Espero preguntas, planteos etc, por esta
vía durante los TalleresLos espero hoy en el
CEBIOINFO!
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Buena semana!