Informe 2010-11 – Nodo IBUNAMy colaboración con CBOL

Red Temática del Código de Barras de la Vida en México

Patricia Escalante P., Patricia Rosas E. y Lidia Cabrera M.Instituto de Biología, UNAM

2005-2007

V. León participa en la 1ª Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida en Londres, UK

A su regreso presenta un Seminario del proyecto en el IB.

Hace gestiones para que el IB se adhiera al Consorcio del Código de Barras de la Vida.

La CONABIO recibe solicitudes de apoyo a proyectos piloto, por parte del IB se apoya un proyecto de las plantas de 5 familias incluidas en la NOM-059-ECOL y otro de anfibios y reptiles.

Antecedentes

P. Escalante participa en el Taller Neotropical de las campañas ABBI y FishBOL en Buenos Aires, Argentina, y hace una presentación del potencial de México para una campaña del código de barras molecular de las aves.

A su regreso hace dos reuniones con la comunidad académica para expresar su interés e invitar a más académicos a iniciar proyectos.

Invita a P. Hebert a dar una Conferencia en el IB, la cual se lleva a cabo en abril del 2007. El Dr. Paul Hebert recorre nuestras colecciones y aprecia el potencial institucional para el proyecto y nos invita a participar en la reunión organizativa que tendría lugar en Guelph, en junio del 2007.

V. León y P. Escalante participan por parte del IB en el Taller Inaugural, de organizacion y financiamiento del proyecto iBOL en Guelph, Ontario del 17 al 20 de junio del 2007. Se llega al acuerdo que P Escalante será la coordinadora del nodo IBUNAM en la Red MexBOL.M Elías y P Escalante son invitados a formar parte del Consejo Científico de iBOL.

Organizamos los eventos de arranque de la Red a nivel nacional para marzo del 2009.

Y cada nodo organiza su taller. Para nuestro taller invitamos entre otros a Rob DeSalle (AMNH), Paul Hebert (Guelph), y otros invitados, también los de casa participamos, especialmente los que tenemos datos moleculares o de códigos de barras.

A fines del 2008 se emite la invitación a pedir la sede de la Tercera Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida y decidimos buscar la sede.

Recibimos la visita de evaluación como sede potencial en febrero del 2009, unas semanas después nos informan que ganamos la sede.Se forma en Comité Organizador Local (8 investigadores del IB, además de otros 12 de otras instituciones ).

Resumen de la Tercera Conferencia

371 delegados

45 países

7 días de eventos

Talleres PreConferencia en el IBUNAM: Presentación de Junko Shimura (CCDB), participantes de todo en mundo, en estas imágenes, Brasil, Europa.

Talleres, grupos de trabajo y reunión del Comité Científico del iBOL en el IBUNAM el 9 de nov 2009

La Conferencia en la Academia Mexicana de Ciencias, 10-12 nov 2009

(cont.)

Publicación de la Memoría del Simposio Mesoamericano de la Tercera Conferencia en mitochondrial DNA en la Revista Mitochondrial DNA número especial.

Mantenimiento del Blog del nodo IBUNAM de la Red MexBOL

56 suscripciones,11,794 hits hasta el momento

Traducción al españoltríptico CBOL

Agradecimientos del diseñopara DG Julio César Montero S.

LaboratorioLaboratorio

•Adquisición del TissueLyser (Qiagen). Adquisición del TissueLyser (Qiagen). Molido de tejidos para la extracción. Molido de tejidos para la extracción. Aparato disponible a la comunidad.Aparato disponible a la comunidad.

•22 placas = 2090 muestras de tejido 22 placas = 2090 muestras de tejido enviadas a secuenciar al Biodiversity enviadas a secuenciar al Biodiversity Institute of Ontario, CanadáInstitute of Ontario, Canadá

Entrenamiento en Guelph, mayo 2010, apoyo LLN-CBOL

(cont.)

Entrenamiento en el Laboratorio

Llenado de placa con tejidos de avesLlenado de placa con etanol

Entrenamiento en extracción de ADN

Selección de material para llenado de placas

Selección de material para llenado de placas

Asesoramiento

Llenado de base de datos

Subiendo datos e informacion al sistema BOLD

Llenado de las placas con muestras de animales

Llenado de las placas con muestras de plantas

Organización en la hoja de carga y los ejemplares

Organización de los ejemplares y toma de

fotografías

Talleres y Congresos

Taller en el Congreso Mexicano de Botánica

Participación en la 1ª Reunión del Grupo de Insectos - MexBOL

Patricia Rosas en el 1er. Taller del nodo IBUNAM

Lidia Cabrera en el 1er. Taller del nodo IBUNAM

Participantes en el 1er. Taller del nodo IBUNAM

Taller Grupo Perso-nas

Instituciones Productos

General Directores de grupos 30 IBUNAM, FES-Iztacala, INECOL, UDG, UAEH, CONABIO, INIFAP, MazatánUNAM

Diversos proyectos, Taller de Plantas y Reuniión satélite Congreso Nacional de Botánicoa

Hongos Micólogos 35 IBUNAM, FES-Iztacala, FC-Medicina, Inst. Geología, UAEH, UDG, FC-Ciencias, UAT ,UABC, UV, IPN

Proyectos de Códigos de Barras y un segundo taller

General Taxónomos y otros especialistas

25 UAEH, FES-Iztacala, UDG Proyecto Código de Barras de la biota de Hidalgo

General Taxónomos y otros especialistas sobre la biota de la Estación Biológica Chamela

23 IBUNAM, UAEH, IPN Proyecto Código de Barras de la biota de la Estación Biológica Chamela

Artrópodos Entomólogos (insectos) 9 IBUNAM, ECOSUR Consolidación y planeación de la Campaña de Insectos

Hongos Micólogos 15 IBUNAM, INECOL, UATlx Proyectos de Códigos de Barras

Plantas Vasculares

Botánicos 6 IBUNAM, UDG, ECOSUR, FC-Ciencias, UANL, UAMex

Preparación para Reunión Satélite

Plantas Vasculares

Botánicos 55 Divesas istituciones del país y algunos extrangeros

Información, discución y consolidación de la campaña de Plantas Vasculares

8 talleres (ago-nov)

3 Generales, 2 Hongos, 2 Plantas Vasculares, Artrópodos

198 asistentes

Mas de 18 instituciones del país (investigadores y estudiantes)

Diversos proyectos taxónomicos o bioticos

Projecto (código) Avance Investigadores/Estudiantes No. Spp.

matK/rbcL No. Barco-des

Apoyo

Five critical groups of the Mexican flora (ACCCO)

Análisis de datos y preparación para publicar

D. Gernandt, G. Salazar, S. Arias, F. Vergara, V. Sosa, J. Reyes, L. I. Cabrera, P. Rosas, M. L. Kuzmina

226 211/222 226 CONABIO

Pines of North and Central America (PNCA)

Colectando, generando base de datos y fotografías

D. Gernandt, P. Rosas, S. Hernández, M. Grabiel

63 52/50 147 MexBOL (Parcial)

 DNA barcode of the Orchidaceae of Mexico, part 1: Orchidoideae (MXBOR)

Colectando, generando base de datos y fotografías

Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Luis Sanchez, Masha L. Kuzmina

400 0/0 950 MexBOL (Parcial)

DNA barcode of Orchidaceae of Mexico, part 2: Epidendroideae. (MXBEP)

Colectando, generando base de datos y fotografías

Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina

400 0/0 950 MexBOL (Parcial)

DNA Barcode of Orchidaceae of Mexico, part ·3: Cypripedioideae an Vanilloideae. (MXBCY)

Colectando, generando base de datos y fotografías

Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina

400 0/0 950 MexBOL (Parcial)

Barcode of Asclepiadaceae of Mexico (MXASC)

Colectando, generando base de datos y fotografías

Veronica Juarez, Lidia I. Cabrera, M. Paniagua, Masha L. Kuzmina, Gerardo Salazar

194 0/0 380 MexBOL (Parcial)

Barcode of Aracea of Mexico (MXARA)

Colectando, generando base de datos y fotografías

Gerardo Salazar, Lidia I. Cabrera, Masha L. Kuzmina

100 0/0 285 MexBOL (Parcial)

Proyecto (código) Avance Investigadores/Estudiantes No. Spp.

matk/rbcL No. Barcodes

Apoyo

DNA barcode of the flora of Calakmul, Yucatan Peninsula, México (CALAK)

Análisi de datos G. Salazar, L. I. Cabrera, E. Martínez, C. Ramos, F. Chiang, M. Sousa, M. L. Kuzmina

572 424/699 950 MexBOL (Parcial)

DNA barcode of the tree flora of the tropical rain forest of the Los Tuxtlas (MXBT)

Generando secuencias, Tesis de licenciatura

G. Salazar, K. B. Hernández,  G. Ibarra, A. Campos, M. Ricker, R. I. Coates, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina 

179 70/171 294 MexBOL (Parcial)

DNA barcode of the flora of Zimatan, Oaxaca, Mexico (MXBZI)

Generando secuencias, Tesis de licenciatura

G. Salazar, D. Hernández, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina,  S. H. Salas

583 0/112 950 MexBOL (Parcial)

DNA barcode of te flora of the Jaguaroundi Ecological Park, Veracruz, Mexico (JAGUA)

Colectando, generando base de datos y fotografías

G. Salazar, M. Ricker, L. I. Cabrera,  M. L. Kuzmina

300 0/0 950 Pemex

Barcode of the Flora of Pedregal, Mexico City. Mexico. Responsablre (MXPED)

Colectando, generando base de datos y fotografías

G. Salazar, D. Hernadez, K. B. Hernandez, V. Trejo, L. I. Cabrera, M. L. Kuzmina

150 0/0 285 MexBOL (Parcial)

Vascular plants of Chamela, Jalisco, Mexico (MXBPV)

Colectando, generando base de datos y fotografías

G. Salazar, L. I. Cabrera, P. Rosas, M. L. Kuzmina

450 0/0 950 MexBOL (Partial)

Campaña Aproxi-mación

No. Investigadore/Estudiantes

No. Spp.

Marcadores

No. Barcodes

Apoyo

Plantas Vasculares = 13 proyectos

Florístico Taxonómico

21/5 = 26 4017 757 (matK)/1180 (rbcL)

8267 MexBOL (Parcial), CONABIO, PEMEX

Resumen

Código de Barras de AnimalesCódigo de Barras de AnimalesPatricia RosasPatricia Rosas

BeeBOL Lepidoptera Formicidae Mammals

Polar Mosquito Coral Reef Marine All Birds

HealthBOL Trichoptera

FishBOL Sponge

Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes

Barcodes Apoyo

Earthworms of Mexico [EWMEX]

Base de datos y generación de secuencias

Carlos Fragoso, Adriana Casallas y Gabriela Cervantes

200 INECOL

Birds of Mexico [BOM] Colecta, base de datos y generación de secuencias

Patricia Escalante, Marco Gurrola, Thonathiu Sanabria, Luis Fernando López y otros

1700 CONABIO Y Red MexBOL

Birds of Guatemala [BOG] Base de datos y generación de secuencias

Patricia Escalante 95 CONABIO Y Red MexBOL

Nymphalidae of Central Mexico [NCM]

1ª. parte finalizada con una publicación y la 2ª. parte en generación de secuencias

Adolfo Ibarra, Patricia Escalante y Patricia Rosas

500 UNAM y Fundación BANORTE

Cicadellidae de Mexico [CCM]

Base de datos, imágenes y generación de secuencias

Julieta Ramos-Elorduy y José Manuel Pino

500 CONABIO Y Red MexBOL

Freshwater fishes of the Panuco-Tamesi system [FFPTR]

Base de datos y generación de secuencias

Omar Mejia 311 CONABIO

Amphibians and reptiles of Mexico [MXHER]

Base de datos Virginia León, Oscar Flores, Adrián Nieto y Jonathan Campbell

550 CONABIO

Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes Barcodes Apoyo

Helminths of amphibians and reptiles of Mexico [HELMX]

Base de datos y generación de secuencias

Virginia León 580 CONABIO

Bees of México [RABM] Base de datos y generación de secuencias

Ricardo Ayala y Laurence Parker

82 BeeBOL y Presupuesto operativo IBUNAM

Bees of the world. Mexico [BOFWM]

Base de datos y generación de secuencias

Ricardo Ayala, Laurence Packer, Carlos Vergara y Bob Minckley, Ricardo Ayala, Laurence Parker y Sheila Dumesh

904 BeeBOL, Presupuesto operativo IBUNAM, Proyecto Mutual

Bees of the world. Mexico II [BOWMT]

Base de datos y generación de secuencias

Ricardo Ayala, Laurence Parker y Sheila Dumesh

95 Proyecto Mutual, York University, Presupuesto operativo. Proyecto Vulnerabilidad

Código de barras de esponjas marinas (Porifera) del Pacífico mexicano

Colecta y base de datos

José Antonio Cruz, José Luis Carballo y Axayacatl Rocha-Olivares

~500 -

Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes Barcodes Apoyo

Barcodng Arachnids of Mexico (All Arachnida, except Scorpiones & Acari) [ARMXB]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Griselda Montiel, Oscar Francke, Alejandro Valdez, César Durán, Jesús Cruz López, Gabriel Villegas, Mirna Hernández y Fernando Álvarez

65 sp. Red MexBOL

Barcoding Arachnids of Mexico (Subclase Acari) [MXBAC]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Tila María Pérez Ortiz, Griselda Montiel, Ricardo Paredes León, Oscar Francke Ballvé, Gabriel Villegas, María del Carmen Guzmán Cornejo, Margarita Vargas, Tania Palafox y Jesús Alberto Lugo

50 sp. Red MexBOL

Barcode of arachnids of Mexico (Order: Scorpiones) [MXBSC]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Oscar Francke, Carlos Santibañez, Jesús Cruz, Griselda Montiel, Javier Ponce y Gerardo Contreras

50 sp. Red MexBOL

Caddisfly diversity of Hidalgo, Mexico [TRHGO]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Atilano Contreras, Xin Zhou, María Razo, Munira Yasmin, y Rob Tabone

665 Posgrado C. Biológicas-UNAM, IB-UNAM, Red MexBoL

UNAM Trichoptera 1 [UNAMA] Colecta Xin Zhou, Atilano Contreras, Karl Kjer y Steffen Pauls

100 -

Projecto (código) Avance Investigadores / Estudiantes

Barcodes Apoyo

Brown lacewings (Neuroptera: Hemerobiidae) of Mexico [HEMMX]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Atilano Contreras-Ramos, Xin Zhou y María Razo

200 IB-UNAM y Red MexBoL

Doryctinae (Braconidae) of Mexico [ASDOR]

Finalizado y publicado Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

791 CONABIO

Lepidoptera from Chamela, Mexico [MXBLP]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

1000-2000 -

Microgastrinae from Chamela, Mexico [MXBMC]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

1000-2000 -

Quicke Braconidae [ASQBR]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

1000-2000 -

Quicke Ichneumonidae [ASQIC]

Colecta, base de datos y generación de secuencias

Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

1000-2000 -

World Doryctinae [DORYC] Colecta, base de datos y generación de secuencias

Alejandro Zaldívar, Alex Smith y José Fernandez

1000-2000 -

Envio de Placas a Guelph

Se enviaron placas con tejidos de animales y ejemplares voucher

Representan ~4 000 registros